SAP30

Proteina asociată Sin3A, 30 kDa
Structuri disponibile
PDB Căutare ortolog: PDBe , RCSB
Identificatori
SimbolSAP30
ID-uri externeOMIM:  603378 MGI :  1929129 HomoloGene :  2869 GeneCards : SAP30 Gene
Profilul expresiei ARN
Mai multe informatii
ortologii
VedereUmanMouse
Entrez881960406
AnsambluENSG00000164105ENMUSG00000031609
UniProtO75446O88574
RefSeq (ARNm)NM_003864NM_021788
RefSeq (proteină)NP_003855NP_068560
Locus (UCSC)Chr 4:
174,29 - 174,3 Mb		Chr 8:
57,48 – 57,49 Mb
Căutați în PubMed[unu][2]

Proteina asociată Sin3A de 30 kDa , cunoscută și sub numele de SAP30 , este o proteină codificată la om de gena SAP30 [1] .

Funcția

Acetilarea histonelor joacă un rol cheie în reglarea expresiei genelor eucariote . Acetilarea și deacetilarea histonelor sunt catalizate de complexe multisubunități. Proteina codificată de această genă este o componentă a complexului histon deacetilază , care include SIN3A , SAP18 , HDAC1 , HDAC2 , RbAp46 , RbAp48 și alte polipeptide. Acest complex este implicat activ în deacetilarea histonelor octamer principale, dar este inactiv în deacetilarea histonelor nucleozomale. Pseudogena acestei gene este localizată pe cromozomul 3 [1] .

Mamiferele au un paralog al SAP30, numit SAP30-like (SAP30L), ale cărui secvențe disponibile sunt 70% identice cu SAP30 [2] . SAP30 și SAP30L alcătuiesc împreună familia bine conservată de proteine ​​SAP30 . SAP30L interacționează, de asemenea, cu mai multe componente corepresoare ale complexului Sin3A și induce reprimarea transcripțională prin recrutarea Sin3A și a histondeacetilazelor [ 3] .

Proteinele din familia SAP30 au localizare nucleară funcțională a semnalului și pot transmite semnalul Sin3A către nucleu [3] . Proteinele SAP30 au un contact de secvență independent cu ADN -ul , modulul lor N-terminal dependent de zinc, iar regiunea lor centrală acidă contribuie la interacțiunile histonă-nucleozom. Legarea ADN-ului proteinelor SAP30 este reglată de semnalizarea nucleară a lipidelor, fosfoinozitide (PI) [4] . Proteinele SAP30 oferă primul exemplu în care ADN-ul și PI par a fi într-o relație reciproc antagonistă în ceea ce privește interacțiunea lor cu proteinele deget de zinc și ilustrează astfel mecanismul molecular al modului în care aceste lipide pot contribui la reglarea genelor [4] [5] .

Interacțiuni

S-a demonstrat că SAP30 interacționează cu HDAC1 [6] [7] [8] [9] [10] [11] , histon deacetilaza 2 [7] [8] [11] , SIN3A [7] [8] [10] [11] [12] [13] , RBBP7 [7] [8] [11] , corepresorul receptorului nuclear 1 [13] [14] , RBBP4 [7] [8] [11] , ING1 [11] și YY1 [ 6] .

Note

  1. ↑ 1 2 Gena Entrez: proteină asociată cu SAP30 Sin3A, 30 kDa .
  2. ↑ Lindfors K., Viiri KM, Niittynen M., Heinonen TY, Mäki M., Kainulainen H. TGF-beta induce expresia SAP30L, o nouă proteină nucleară  //  BMC Genomics : jurnal. - 2003. - Decembrie ( vol. 4 ). — P. 53 . - doi : 10.1186/1471-2164-4-53 . — PMID 14680513 .
  3. ↑ 1 2 Viiri KM, Korkeamäki H., Kukkonen MK, Nieminen LK, Lindfors K., Peterson P., Mäki M., Kainulainen H., Lohi O. SAP30L interacționează cu membrii complexului corepresor Sin3A și țintește Sin3A către nucleol  (ing.)  // Cercetarea acizilor nucleici : jurnal. - 2006. - Vol. 34 , nr. 11 . - P. 3288-3298 . - doi : 10.1093/nar/gkl401 . — PMID 16820529 .
  4. ↑ 1 2 Viiri KM, Jänis J., Siggers T., Heinonen TY, Valjakka J., Bulyk ML, Mäki M., Lohi O. Activitățile de legare și îndoire a ADN-ului SAP30L și SAP30 sunt mediate de un modul dependent de zinc și monofosfoinozitide  //  Biologie moleculară și celulară : jurnal. - 2009. - ianuarie ( vol. 29 , nr. 2 ). - P. 342-356 . - doi : 10.1128/MCB.01213-08 . — PMID 19015240 .
  5. ↑ TamPub (link în jos) . Consultat la 20 aprilie 2015. Arhivat din original pe 25 mai 2011. 
  6. ↑ 1 2 Huang, Nu En; Lin Ching Hui; Lin Young Sun; Yu Winston C Y. Modularea activității YY1 prin SAP30  // Comunicații de cercetare  biochimică și biofizică : jurnal. - Statele Unite ale Americii, 2003. - Iunie ( vol. 306 , nr. 1 ). - P. 267-275 . — ISSN 0006-291X . - doi : 10.1016/S0006-291X(03)00966-5 . — PMID 12788099 .
  7. ↑ 1 2 3 4 5 Zhang, Y; SunZW; Iratni R; Erdjument Bromage H; TempstP; Hampsey M; Reinberg D. SAP30, o proteină nouă conservată între om și drojdie, este o componentă a unui complex histon deacetilază  // Celulă  moleculară : jurnal. - STATELE UNITE, 1998. - Iunie ( vol. 1 , nr. 7 ). - P. 1021-1031 . — ISSN 1097-2765 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
  8. ↑ 1 2 3 4 5 Zhang, Y; NghHH; Erdjument Bromage H; TempstP; Pasărea A; Reinberg D. Analiza subunităților NuRD dezvăluie un complex de miez al histonei deacetilaze și o legătură cu metilarea ADN-ului  // Genes & Development  : journal  . - STATELE UNITE, 1999. - August ( vol. 13 , nr. 15 ). - P. 1924-1935 . — ISSN 0890-9369 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
  9. ↑ Swanson, Kurt A; Knoepfler Paul S; Huang Kai; Kang Richard S; Cowley Shaun M; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Radhakrishnan Ishwar. Represorii HBP1 și Mad1 leagă domeniul corepresorului Sin3 PAH2 cu orientări elicoidale opuse  (engleză)  // Nature Structural & Molecular Biology  : journal. - Statele Unite ale Americii, 2004. - August ( vol. 11 , nr. 8 ). - P. 738-746 . — ISSN 1545-9993 . doi : 10.1038 / nsmb798 . — PMID 15235594 .
  10. ↑ 12 Yochum , G.S.; Ayer D E. Pf1, o nouă proteină PHD deget de zinc care leagă corepresorul TLE de complexul mSin3A-histone deacetilază  //  Biologie moleculară și celulară : jurnal. - Statele Unite ale Americii, 2001. - iulie ( vol. 21 , nr. 13 ). - P. 4110-4118 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001 . — PMID 11390640 .
  11. ↑ 1 2 3 4 5 6 Kuzmichev, A; Zhang Y; Erdjument Bromage H; TempstP; Reinberg D. Rolul complexului Sin3-histone deacetilază în reglarea creșterii de către supresorul tumoral candidat p33(ING1  )  // Biologie moleculară și celulară : jurnal. - Statele Unite ale Americii, 2002. - Februarie ( vol. 22 , nr. 3 ). - P. 835-848 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
  12. ↑ Fleischer, Tracey C; Yun Ui Jeong; Ayer Donald E. Identificarea și caracterizarea a trei noi componente ale complexului corepresor mSin3A   // Biologie moleculară și celulară : jurnal. - Statele Unite ale Americii, 2003. - Mai ( vol. 23 , nr. 10 ). - P. 3456-3467 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003 . — PMID 12724404 .
  13. ↑ 12 Laherty , CD; Billin A N., Lavinsky R M., Yochum G S., Bush A C., Sun J M., Mullen T M., Davie J R., Rose D W., Glass C K., Rosenfeld M G., Ayer D E., Eisenman R N. SAP30, o componentă a complexului corepresor mSin3 implicat în reprimarea mediată de N-CoR de către factori de transcripție specifici  // Celulă  moleculară : jurnal. - STATELE UNITE, 1998. - iulie ( vol. 2 , nr. 1 ). - P. 33-42 . — ISSN 1097-2765 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80111-2 . — PMID 9702189 .
  14. ↑ Underhill, C; Qutob MS; Yee SP; Torchia J. Un nou complex corepresor al receptorilor nucleari, N-CoR, conține componente ale complexului SWI/SNF de mamifer și ale corepresorului KAP-1  //  Journal of Biological Chemistry  : journal. - STATELE UNITE, 2000. - Decembrie ( vol. 275 , nr. 51 ). - P. 40463-40470 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M007864200 . — PMID 11013263 .

Literatură