SIN3A

Membru A al familiei de regulatori transcripționali SIN3

PDB se bazează pe 1g1e.
Structuri disponibile
PDB Căutare ortolog: PDBe , RCSB
Identificatori
SimbolSIN3A  ; DKFZp434K2235; FLJ90319; KIAA0700
ID-uri externeOMIM:  607776 MGI :  107157 HomoloGene :  32124 GeneCards : SIN3A Gene
ortologii
VedereUmanMouse
Entrez2594220466
AnsambluENSG00000169375ENMUSG00000042557
UniProtQ96ST3Q60520
RefSeq (ARNm)NM_001145357NM_001110350
RefSeq (proteină)NP_001138829NP_001103820
Locus (UCSC)Chr 15:
75,66 – 75,75 Mb
Chr 9:
57,07 – 57,13 Mb
Căutați în PubMed[unu][2]

SIN3A ( Paired amphipathic helix protein Sin3a ) este o  proteină codificată la om de gena SIN3A [1] [2] .

Funcția

Proteina codificată de această genă este un  regulator transcripțional . Conține domenii de helix amfipatică pereche (PAH) care sunt importante pentru interacțiunile proteină-proteină și pot media reprimarea de către complexul Mad-Max [3] .

Interacțiuni cu alte proteine

S-a demonstrat că SIN3A interacționează cu:

Note

  1. Yu F., Thiesen J., Stratling W. H. Reprimarea transcripțională independentă de histone deacetilază prin proteina 2 de legare a metil-CpG  //  Nucleic Acids Res : jurnal. - 2000. - iunie ( vol. 28 , nr. 10 ). - P. 2201-2206 . - doi : 10.1093/nar/28.10.2201 . — PMID 10773092 .
  2. Halleck MS, Pownall S., Harder KW, Duncan AM, Jirik FR, Schlegel RA Un regulator transcripțional presupus de mamifer pe scară largă, care conține mai multe elice amfipatice pereche, cu similaritate cu drojdia SIN3  // Genomics  :  journal. - Academic Press , 1995. - August ( vol. 26 , nr. 2 ). - P. 403-406 . - doi : 10.1016/0888-7543(95)80229-F . — PMID 7601471 .
  3. Gena Entrez: SIN3A SIN3 omologul A, regulator de transcripție (drojdie) .
  4. Youn HD, Liu JO Cabin1 reprimă expresia Nur77 dependentă de MEF2 și apoptoza celulelor T prin controlul asocierii histondeacetilazelor și acetilazelor cu MEF2  //  Immunity: journal. - Cell Press , 2000. - Vol. 13 , nr. 1 . - P. 85-94 . - doi : 10.1016/S1074-7613(00)00010-8 . — PMID 10933397 .
  5. 1 2 Swanson KA, Knoepfler PS, Huang K., Kang RS, Cowley SM, Laherty CD, Eisenman RN, Radhakrishnan I. Represorii HBP1 și Mad1 leagă domeniul corepresorului Sin3 PAH2 cu orientări elicoidale opuse  (engleză)  // Nat. Struct. Mol. Biol.  : jurnal. - 2004. - Vol. 11 , nr. 8 . - P. 738-746 . doi : 10.1038 / nsmb798 . — PMID 15235594 .
  6. 1 2 Zhang Y., Dufau ML Mecanisme duale de reglare a transcripției genei receptorului hormonului luteinizant de către receptorii orfani nucleari și complexele de histone deacetilază  (engleză)  // J. Steroid Biochem. Mol. Biol. : jurnal. - 2003. - Vol. 85 , nr. 2-5 . - P. 401-414 . - doi : 10.1016/S0960-0760(03)00230-9 . — PMID 12943729 .
  7. Yao YL, Yang WM Proteinele asociate metastazelor 1 și 2 formează complexe proteice distincte cu activitate histon deacetilază  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 43 . - P. 42560-42568 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
  8. 1 2 3 4 5 Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE Identificarea și caracterizarea a trei noi componente ale complexului corepresor mSin3A   // Mol . celulă. Biol. : jurnal. - 2003. - Vol. 23 , nr. 10 . - P. 3456-3467 . - doi : 10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003 . — PMID 12724404 .
  9. 1 2 Yang L., Mei Q., ​​​​Zielinska-Kwiatkowska A., Matsui Y., Blackburn ML, Benedetti D., Krumm AA, Taborsky GJ, Chansky HA . interacționează cu histon deacetilazele 1/2 și corepresorii de transcripție mSin3A/B   // Biochem . J. : jurnal. - 2003. - Vol. 369 , nr. Pt 3 . - P. 651-657 . - doi : 10.1042/BJ20020854 . — PMID 12398767 .
  10. Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Trei proteine ​​definesc o clasă de histon deacetilaze umane legate de drojdia Hda1p  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1999. - Vol. 96 , nr. 9 . - P. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
  11. Zhang J., Kalkum M., Chait BT, Roeder RG Complexul corepresor al receptorului nuclear N-CoR-HDAC3 inhibă calea JNK prin subunitatea integrală GPS2   // Mol . celulă : jurnal. - 2002. - Vol. 9 , nr. 3 . - P. 611-623 . - doi : 10.1016/S1097-2765(02)00468-9 . — PMID 11931768 .
  12. You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL CoREST este o componentă integrală a complexului CoREST-histone deacetilază umană  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2001. - Vol. 98 , nr. 4 . - P. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
  13. 1 2 Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analiza subunităților NuRD relevă un complex de miez de histon deacetilază și o conexiune cu metilarea   ADN- ului // Gene Dev.  : jurnal. - 1999. - Vol. 13 , nr. 15 . - P. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
  14. 1 2 Zhang Y., Dufau ML Silence of transcription of the human luteinizing hormone receptor gene by histon deacetylase-mSin3A complex  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 36 . - P. 33431-33438 . - doi : 10.1074/jbc.M204417200 . — PMID 12091390 .
  15. 1 2 Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL Deacetilarea cromatinei printr-un complex de remodelare a nucleozomilor dependent de ATP  //  Nature : journal. - 1998. - Vol. 395 , nr. 6705 . - P. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
  16. Hassig CA, Tong JK, Fleischer TC, Owa T., Grable PG, Ayer DE, Schreiber SL Un rol pentru activitatea histon-deacetilazei în reprimarea transcripțională mediată de HDAC1  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : jurnal. - 1998. - Vol. 95 , nr. 7 . - P. 3519-3524 . - doi : 10.1073/pnas.95.7.3519 . — PMID 9520398 .
  17. Yasui D., Miyano M., Cai S., Varga-Weisz P., Kohwi-Shigematsu T. SATB1 vizează remodelarea cromatinei pentru a regla genele pe distanțe lungi  //  Nature : journal. - 2002. - Vol. 419 , nr. 6907 . - P. 641-645 . - doi : 10.1038/nature01084 . — PMID 12374985 .
  18. 1 2 Huang EY, Zhang J., Miska EA, Guenther MG, Kouzarides T., Lazar MA Corepresorii receptorilor nucleari se asociază cu histon deacetilaze de clasa II într-o cale de represiune independentă de Sin3  (Eng.)  // Genes Dev.  : jurnal. - 2000. - Vol. 14 , nr. 1 . - P. 45-54 . — PMID 10640275 .
  19. 1 2 3 4 5 6 Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidat tumor suppressor p33(ING1)  ( ingl. . .)  // Mol. celulă. Biol. : jurnal. - 2002. - Vol. 22 , nr. 3 . - P. 835-848 . - doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
  20. 1 2 Koipally J., Georgopoulos K. Interacțiunile Ikaros-CtIP nu necesită proteina de legare C-terminal și participă la un mod de represiune independent de deacetilază  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 26 . - P. 23143-23149 . - doi : 10.1074/jbc.M202079200 . — PMID 11959865 .
  21. Petrie K., Guidez F., Howell L., Healy L., Waxman S., Greaves M., Zelent A. The histone deacetylase 9 gene codes multiple protein izoformes  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 18 . - P. 16059-16072 . - doi : 10.1074/jbc.M212935200 . — PMID 12590135 .
  22. Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. O genă candidată a retardului mental legat de X este o componentă a unei noi familii de complexe care conțin histon deacetilază  (engleză)  // J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
  23. Laherty CD, Yang WM, Sun JM, Davie JR, Seto E., Eisenman RN Histone deacetilaze asociate cu corepresorul mSin3 mediază reprimarea transcripțională nebună  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , nr. 3 . - P. 349-356 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80215-9 . — PMID 9150134 .
  24. Yokoyama A., Wang Z., Wysocka J., Sanyal M., Aufiero DJ, Kitabayashi I., Herr W., Cleary ML Leucemia proto-oncoproteină MLL formează un complex de histonă metiltransferază asemănătoare SET1 cu menina pentru a inhiba expresia genei Hox  (engleză)  // Mol. celulă. Biol. : jurnal. - 2004. - Vol. 24 , nr. 13 . - P. 5639-5649 . - doi : 10.1128/MCB.24.13.5639-5649.2004 . — PMID 15199122 .
  25. ^ Wysocka J., Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W. Human Sin3 deacetilaza și histona H3-K4 metiltransferaza Set1/Ash2 legate de tritorax sunt legate împreună selectiv de factorul de proliferare celulară HCF-   1 / Genes Dev.  : jurnal. - 2003. - Vol. 17 , nr. 7 . - P. 896-911 . - doi : 10.1101/gad.252103 . — PMID 12670868 .
  26. Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Repression by Ikaros and Aiolos is mediated through histon deacetylaze complexs  // EMBO  J. : jurnal. - 1999. - Vol. 18 , nr. 11 . - P. 3090-3100 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
  27. Koipally J., Georgopoulos K. A molecular dissection of the repression circuity of Ikaros  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 31 . - P. 27697-27705 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
  28. ^ Zhang JS, Moncrieffe MC, Kaczynski J., Ellenrieder V., Prendergast FG, Urrutia R. Un motiv alfa-helical conservat mediază interacțiunea represorilor transcripționali de tip Sp1 cu corepresorul mSin3A   // Mol . celulă. Biol. : jurnal. - 2001. - Vol. 21 , nr. 15 . - P. 5041-5049 . - doi : 10.1128/MCB.21.15.5041-5049.2001 . — PMID 11438660 .
  29. Ellenrieder V., Zhang JS, Kaczynski J., Urrutia R. Semnalarea perturbă legarea mSin3A la domeniul de interacțiune Sin3-like Mad1 al TIEG2, un represor asemănător Sp1  // EMBO  J. : jurnal. - 2002. - Vol. 21 , nr. 10 . - P. 2451-2460 . - doi : 10.1093/emboj/21.10.2451 . — PMID 12006497 .
  30. Meroni G., Reymond A., Alcalay M., Borsani G., Tanigami A., Tonlorenzi R., Lo Nigro C., Messali S., Zollo M., Ledbetter DH, Brent R., Ballabio A., Carrozzo R. Rox, o proteină nouă bHLHZip exprimată în celulele repaus care se heterodimerizează cu Max, leagă o cutie E non-canonică și acționează ca un represor transcripțional  // EMBO  J. : jurnal. - 1997. - Vol. 16 , nr. 10 . - P. 2892-2906 . - doi : 10.1093/emboj/16.10.2892 . — PMID 9184233 .
  31. Brubaker K., Cowley SM, Huang K., Loo L., Yochum GS, Ayer DE, Eisenman RN, Radhakrishnan I. Structura soluției domeniilor de interacțiune ale complexului Mad-Sin3: implicații pentru recrutarea unui complex de modificare a cromatinei  (Engleză)  // Cell  : journal. - Cell Press , 2000. - Vol. 103 , nr. 4 . - P. 655-665 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)00168-9 . — PMID 11106735 .
  32. Ayer DE, Lawrence QA, Eisenman RN Mad-Max reprimarea transcripțională este mediată de formarea complexului ternar cu omologi de mamifere ai represorului de drojdie Sin3  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1995. - Vol. 80 , nr. 5 . - P. 767-776 . - doi : 10.1016/0092-8674(95)90355-0 . — PMID 7889570 .
  33. Boeke J., Ammerpohl O., Kegel S., Moehren U., Renkawitz R. Domeniul de reprimare minimă al MBD2b se suprapune cu domeniul de legare a metil-CpG și se leagă direct la Sin3A  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 45 . - Str. 34963-34967 . - doi : 10.1074/jbc.M005929200 . — PMID 10950960 .
  34. Li J., Wang J., Wang J., Nawaz Z., Liu JM, Qin J., Wong J. Ambele proteine ​​corepresoare SMRT și N-CoR există în complexe mari de proteine ​​care conțin HDAC3  //  EMBO J . : jurnal. - 2000. - Vol. 19 , nr. 16 . - P. 4342-4350 . - doi : 10.1093/emboj/19.16.4342 . — PMID 10944117 .
  35. Yang X., Zhang F., Kudlow JE Recrutarea transferazei O-GlcNAc la promotori prin corepresorul mSin3A: cuplarea proteinei O-GlcNAcylation la reprimarea transcripțională  // Cell  :  journal. - Cell Press , 2002. - Vol. 110 , nr. 1 . - P. 69-80 . - doi : 10.1016/S0092-8674(02)00810-3 . — PMID 12150998 .
  36. 1 2 Yochum GS, Ayer DE Pf1, o nouă proteină deget de zinc PHD care leagă corepresorul TLE de complexul mSin3A-histone deacetilază   // Mol . celulă. Biol. : jurnal. - 2001. - Vol. 21 , nr. 13 . - P. 4110-4118 . - doi : 10.1128/MCB.21.13.4110-4118.2001 . — PMID 11390640 .
  37. Khan MM, Nomura T., Kim H., Kaul SC, Wadhwa R., Shinagawa T., Ichikawa-Iwata E., Zhong S., Pandolfi PP, Ishii S. Role of PML and PML-RARalpha in Mad-mediated reprimare transcripțională  (engleză)  // Mol. celulă : jurnal. - 2001. - Vol. 7 , nr. 6 . - P. 1233-1243 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00257-X . — PMID 11430826 .
  38. Hassig CA, Fleischer TC, Billin AN, Schreiber SL, Ayer DE Activitatea histonei deacetilazei este necesară pentru reprimarea transcripțională completă de către mSin3A  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , nr. 3 . - P. 341-347 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80214-7 . — PMID 9150133 .
  39. 1 2 3 Zhang Y., Sun ZW, Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, o proteină nouă conservată între om și drojdie, este o componentă a unei histon deacetilaze complex  (engleză)  // Mol. celulă : jurnal. - 1998. - Vol. 1 , nr. 7 . - P. 1021-1031 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
  40. Laherty CD, Billin AN, Lavinsky RM, Yochum GS, Bush AC, Sun JM, Mullen TM, Davie JR, Rose DW, Glass CK, Rosenfeld MG, Ayer DE, Eisenman RN SAP30, o componentă a complexului corepresor mSin3 implicat în Reprimarea mediată de N-CoR de către factori de transcripție specifici   // Mol . celulă : jurnal. - 1998. - Vol. 2 , nr. 1 . - P. 33-42 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80111-2 . — PMID 9702189 .
  41. 1 2 3 Sif S., Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE Purificarea și caracterizarea complexelor de remodelare a cromatinei Brg1 și hBrm care conțin mSin3A  // Genes Dev  .  : jurnal. - 2001. - Vol. 15 , nr. 5 . - P. 603-618 . - doi : 10.1101/gad.872801 . — PMID 11238380 .
  42. Alland L., David G., Shen-Li H., Potes J., Muhle R., Lee HC, Hou H., Chen K., DePinho RA Identificarea Sds3 de mamifer ca componentă integrală a Sin3/histone deacetilază complex corepresor  (engleză)  // Mol. celulă. Biol. : jurnal. - 2002. - Vol. 22 , nr. 8 . - P. 2743-2750 . - doi : 10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002 . — PMID 11909966 .
  43. Huang S., Brandt SJ mSin3A reglează diferențierea celulelor de eritroleucemie murină prin asocierea cu factorul de transcripție TAL1 (sau SCL)  //  Mol . celulă. Biol. : jurnal. - 2000. - Vol. 20 , nr. 6 . - P. 2248-2259 . - doi : 10.1128/MCB.20.6.2248-2259.2000 . — PMID 10688671 .
  44. David G., Alland L., Hong SH, Wong CW, DePinho RA, Dejean A. Histone deacetilaza asociată cu mSin3A mediază reprimarea de către proteina PLZF asociată cu leucemia promielocitară acută  //  Oncogene : jurnal. - 1998. - Vol. 16 , nr. 19 . - P. 2549-2556 . - doi : 10.1038/sj.onc.1202043 . — PMID 9627120 .
  45. Ward JO, McConnell MJ, Carlile GW, Pandolfi PP, Licht JD, Freedman LP Proteina asociată cu leucemia promielocitară acută, degetul de zinc pentru leucemia promielocitară, reglează diferențierea monocitară indusă de 1,25-dihidroxivitamina D(3) a celulelor U937 printr-o interacțiune fizică cu receptorul vitaminei D(3)   // Sânge : jurnal. — Societatea Americană de Hematologie, 2001. - Vol. 98 , nr. 12 . - P. 3290-3300 . - doi : 10.1182/sânge.V98.12.3290 . — PMID 11719366 .
  46. Wong CW, Privalsky ML Componentele complexului corepresor SMRT prezintă interacțiuni distinctive cu oncoproteinele din domeniul POZ PLZF, PLZF-RARalpha și BCL-6  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 1998. - Vol. 273 , nr. 42 . - P. 27695-27702 . doi : 10.1074/ jbc.273.42.27695 . — PMID 9765306 .

Literatură