RBBP4

Proteina de legare a retinoblastomului 4

Introdus pe baza PDB 2XU7 .
Structuri disponibile
PDB Căutare ortolog: PDBe , RCSB
Identificatori
SimbolRBBP4  ; NURF55; RBAP48; lin-53
ID-uri externeOMIM:  602923 MGI :  1194912 HomoloGene :  21153 GeneCards : RBBP4 Gene
ortologii
VedereUmanMouse
Entrez592819646
AnsambluENSG00000162521ENSMUSG00000057236
UniProtQ09028Q60972
RefSeq (ARNm)NM_001135255NM_009030
RefSeq (proteină)NP_001128727NP_033056
Locus (UCSC)Chr 1:
33,12 – 33,15 Mb		Chr 4:
129,31 – 129,34 Mb
Căutați în PubMed[unu][2]

Proteina de legare a histonelor RBBP4 (cunoscută și ca RbAp48 sau NURF55 ) este o proteină codificată la om de gena RBBP4 . [1] [2]

Funcția

Această genă codifică o proteină nucleară exprimată omniprezent, care aparține unei subfamilii de proteine ​​repetate WD foarte conservate. Este prezent în complexele proteice implicate în acetilarea histonelor și asamblarea cromatinei . Aceasta face parte din complexul Mi-2/NuRD care a fost implicat în remodelarea cromatinei și reprimarea transcripțională asociată cu deacetilarea histonelor. Această proteină codificată este, de asemenea, parte a complexelor corepresoare care sunt parte integrantă a silenciării transcripționale . Aceasta se găsește printre câteva proteine ​​celulare care se leagă direct la proteina retinoblastomului pentru a regla proliferarea celulară. Această proteină pare să fie, de asemenea, implicată în reprimarea transcripțională a genelor care răspund la E2F. [3]

Semnificație clinică

Scăderea RbAp48 în girusul dintat al hipocampului creierului este suspectată a fi principala cauză a pierderii memoriei în timpul îmbătrânirii normale . [4] O scădere a RbAp48 legată de vârstă este observată în circumvoluția dintată în timpul autopsiei tisulare după moartea omului, precum și la șoareci. În plus, gena knocking în forma negativă dominantă a RbAp48 cauzează deficite de memorie la șoarecii tineri, similar cu ceea ce se observă la șoarecii mai în vârstă. În cele din urmă, transferul genei lentivirus pentru a crește expresia RbAp48 în creier inversează afectarea memoriei la șoarecii în vârstă. [patru]

RBBP4 utilizează o parte a căii PKA - CREB1-CPB. [4] Astfel, una dintre posibilele abordări terapeutice pentru restabilirea pierderilor de memorie legate de vârstă este utilizarea căilor de metabolism PKA-CREB1-CPB ale medicamentelor stimulatoare. Agoniştii de dopamină D1/D5, cum ar fi 6-Br-APB şi SKF-38393, care sunt cuplati pozitiv cu adenilat ciclază şi inhibitorul cAMP fosfodiesterazei rolipram , s-a dovedit anterior că reduc defectele de memorie la şoarecii în vârstă. [5]

Interacțiuni

S-a demonstrat că RBBP4 interacționează cu:

Note

  1. ^ Qian YW, Wang YC, Hollingsworth RE Jr, Jones D., Ling N., Lee EY O proteină de legare a retinoblastomului legată de un regulator negativ al Ras în drojdie  //  Nature : journal. - 1993. - Septembrie ( vol. 364 , nr. 6438 ). - P. 648-652 . - doi : 10.1038/364648a0 . — PMID 8350924 .
  2. ↑ Barak O., Lazzaro MA, Lane WS, Speicher DW, Picketts DJ, Shiekhattar R. Isolation of human NURF: a regulator of Engrailed gene expression   // EMBO J : jurnal. - 2003. - noiembrie ( vol. 22 , nr. 22 ). - P. 6089-6100 . - doi : 10.1093/emboj/cdg582 . — PMID 14609955 .
  3. ↑ Gena Entrez: proteina de legare a retinoblastomului RBBP4 4 .
  4. ↑ 1 2 3 Pavlopoulos E., Jones S., Kosmidis S., Close M., Kim C., Kovalerchik O., Small SA, Kandel ER Molecular Mechanism for Age-Related Memory Loss: The Histone-Binding Protein  RbAp48.)  // Sci Transl Med : jurnal. - 2013. - august ( vol. 5 , nr. 200 ). — P. 200ra115 . - doi : 10.1126/scitranslmed.3006373 . — PMID 23986399 .
  5. ↑ Bach ME, Barad M., Son H., Zhuo M., Lu YF, Shih R., Mansuy I., Hawkins RD, Kandel ER Defectele legate de vârstă în memoria spațială sunt corelate cu defecte în faza târzie a hipocampului lung. -termen potențare in vitro și sunt atenuate de medicamente care îmbunătățesc calea de semnalizare a cAMP  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1999. - Aprilie ( vol. 96 , nr. 9 ). - P. 5280-5285 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.5280 . — PMID 10220457 .
  6. ↑ Yarden RI, Brody LC BRCA1 interacționează cu componente ale complexului histon deacetilază  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1999. - Vol. 96 , nr. 9 . - P. 4983-4988 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4983 . — PMID 10220405 .
  7. ↑ Zhang Q., Vo N., Goodman RH Histone binding protein RbAp48 interacționează cu un complex de proteină de legare CREB și CREB fosforilat   // Mol . celulă. Biol. : jurnal. - 2000. - Vol. 20 , nr. 14 . - P. 4970-4978 . - doi : 10.1128/MCB.20.14.4970-4978.2000 . — PMID 10866654 .
  8. ↑ Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identificarea și caracterizarea funcțională a componentelor p66/p68 ale complexului MeCP1   // Mol . celulă. Biol. : jurnal. - 2002. - Vol. 22 , nr. 2 . - P. 536-546 . - doi : 10.1128/MCB.22.2.536-546.2002 . — PMID 11756549 .
  9. ↑ 1 2 Zhang Y., Dufau ML Mecanisme duale de reglare a transcripției genei receptorului hormonului luteinizant de către receptorii orfani nucleari și complexele de histone deacetilază  (engleză)  // J. Steroid Biochem. Mol. Biol. : jurnal. - 2003. - Vol. 85 , nr. 2-5 . - P. 401-414 . - doi : 10.1016/S0960-0760(03)00230-9 . — PMID 12943729 .
  10. ↑ 1 2 Yao YL, Yang WM Proteinele asociate metastazelor 1 și 2 formează complexe proteice distincte cu activitate histon deacetilază  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 43 . - P. 42560-42568 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
  11. ↑ 1 2 3 Nicolas E., Ait-Si-Ali S., Trouche D. The histone deacetylase HDAC3 targets RbAp48 to the retinoblastom protein  // Nucleic Acids Res  . : jurnal. - 2001. - Vol. 29 , nr. 15 . - P. 3131-3136 . doi : 10.1093 / nar/29.15.3131 . — PMID 11470869 .
  12. ↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Trei proteine ​​definesc o clasă de histon deacetilaze umane legate de drojdia Hda1p  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1999. - Vol. 96 , nr. 9 . - P. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
  13. ↑ You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL CoREST este o componentă integrală a complexului CoREST-histone deacetilază umană  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2001. - Vol. 98 , nr. 4 . - P. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
  14. ↑ 1 2 Hassig CA, Fleischer TC, Billin AN, Schreiber SL, Ayer DE Activitatea histonei deacetilazei este necesară pentru reprimarea transcripțională completă de către mSin3A  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , nr. 3 . - P. 341-347 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80214-7 . — PMID 9150133 .
  15. ↑ Ng HH, Zhang Y., Hendrich B., Johnson CA, Turner BM, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 este un represor transcripțional aparținând complexului histon deacetilază MeCP1  .)  / / Nat. Genet.  : jurnal. - 1999. - Vol. 23 , nr. 1 . - P. 58-61 . - doi : 10.1038/12659 . — PMID 10471499 .
  16. ↑ 1 2 3 Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analiza subunităților NuRD relevă un complex de miez de histon deacetilază  și /o legătură cu metilarea ADN-ului  Genes Dev.  : jurnal. - 1999. - Vol. 13 , nr. 15 . - P. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
  17. ↑ 1 2 Zhang Y., Dufau ML Silence of transcription of the human luteinizing hormone receptor gene by histon deacetylase-mSin3A complex  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 36 . - P. 33431-33438 . - doi : 10.1074/jbc.M204417200 . — PMID 12091390 .
  18. ↑ Hassig CA, Tong JK, Fleischer TC, Owa T., Grable PG, Ayer DE, Schreiber SL Un rol pentru activitatea histon-deacetilazei în reprimarea transcripțională mediată de HDAC1  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : jurnal. - 1998. - Vol. 95 , nr. 7 . - P. 3519-3524 . - doi : 10.1073/pnas.95.7.3519 . — PMID 9520398 .
  19. ↑ Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histone deacetylases și SAP18, o nouă polipeptidă, sunt componente ale unui complex uman Sin3  (engleză)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , nr. 3 . - P. 357-364 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80216-0 . — PMID 9150135 .
  20. ↑ Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. O genă candidată a retardului mental legat de X este o componentă a unei noi familii de complexe care conțin histon deacetilază  (engleză)  // J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2003. - Vol. 278 , nr. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
  21. ^ Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL Deacetilarea cromatinei printr-un complex de remodelare a nucleozomilor dependent de ATP  //  Nature: journal. - 1998. - Vol. 395 , nr. 6705 . - P. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
  22. ↑ Qian YW, Lee EY Proteine ​​duble de legare a retinoblastomului cu proprietăți legate de un regulator negativ al ras în drojdie  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 1995. - Vol. 270 , nr. 43 . - P. 25507-25513 . doi : 10.1074/ jbc.270.43.25507 . — PMID 7503932 .
  23. ↑ Nicolas E., Morales V., Magnaghi-Jaulin L., Harel-Bellan A., Richard-Foy H., Trouche D.  RbAp48 aparține complexului histon deacetilază care se asociază cu proteina retinoblastomului  // J Biol. Chim.  : jurnal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 13 . - P. 9797-9804 . doi : 10.1074 / jbc.275.13.9797 . — PMID 10734134 .
  24. ↑ 1 2 Zhang Y., Sun ZW, Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, o proteină nouă conservată între om și drojdie, este o componentă a unui complex de histon deacetilază  (engleză)  // Mol. celulă : jurnal. - 1998. - Vol. 1 , nr. 7 . - P. 1021-1031 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
  25. ↑ Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidat tumor suppressor p33(ING1  )  // Mol. celulă. Biol. : jurnal. - 2002. - Vol. 22 , nr. 3 . - P. 835-848 . - doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .

Literatură