TOP2B

Topoizomeraza (ADN) II beta 180 kDa

Topoizomeraza umană Iibeta în complex cu ADN (sferă de aur). PDB intrarea 4j3n

Structuri disponibile

Căutare ortolog: PDBe , RCSB

Lista ID-urilor PDB
3QX3 , 4G0U , 4G0V , 4G0W , 4J3N

Identificatori

Simbol

TOP2B ; TOPIIB; top2beta

ID-uri externe

OMIM: 126431 MGI : 98791 HomoloGene : 134711 ChEMBL : 3396 GeneCards : TOP2B Gene

numărul CE

5.99.1.3

ontologie genetică
Funcţie	• legarea cromatinei • Activitatea ADN-topoizomerazei de tip II (hidrolizarea ATP) • Legarea proteinei kinazei C • Legarea ATP • Legarea la proteina C-terminală • Legarea ADN-ului, curbarea • Legarea enzimelor • Legarea histonei deacetilazei • Legarea ionilor metalici • activitate de heterodimerizare a proteinelor
componenta celulara	• heterocromatina • nucleu • nucleoplasmă • nucleol • citoplasmă • citosol • nucleoid • Complex ADN-topoizomerază (hidroliza ATP)
proces biologic	• rezoluția intermediarilor de recombinare meiotică • segregarea cromatidelor surori • migrarea neuronilor • proces catabolic ATP • modificarea topologică a ADN • derularea ADN-ului implicată în replicarea ADN • recombinare mitotică • axonogeneză • dezvoltarea creierului anterior • punct de control al integrității ADN mitotic
Surse: Amigo / QuickGO

Profilul expresiei ARN

Mai multe informatii

ortologii

Vedere

Uman

Mouse

Entrez

RefSeq (ARNm)

RefSeq (proteină)

Locus (UCSC)

Chr 3:
25,64 – 25,71 Mb

Chr 14:
16,37 – 16,43 Mb

Căutați în PubMed

[unu]

[2]

ADN-topoizomeraza 2-beta este o enzimă codificată la om de gena TOP2B [1] [2] .

Această genă codifică ADN topoizomeraza , o enzimă care controlează și modifică stările topologice ale ADN-ului în timpul transcripției . Această enzimă nucleară este implicată în procese precum condensarea cromozomilor , separarea cromatidelor și reducerea stresului de torsiune care are loc în timpul transcripției și replicării ADN . Catalizează hacking-ul de tranziție și reunirea a două catene de ADN duplex, permițând catenelor să treacă una prin alta, schimbând astfel topologia ADN-ului. Două forme ale acestei enzime există ca produse probabile în cazul duplicării genelor. Gena care codifică forma beta este localizată pe cromozomul 3, în timp ce forma alfa este localizată pe cromozomul 17. Gena care codifică această enzimă funcționează ca țintă pentru mai mulți agenți antitumorali, cum ar fi mitoxantrona , și multe mutații ale acestei gene sunt asociate cu dezvoltarea rezistenței la medicamente. Scăderea activității acestei enzime poate juca, de asemenea, un rol în ataxie-telangiectazie . Îmbinarea alternativă a acestei gene are ca rezultat două variante de transcriere; totuși, a doua opțiune nu este încă pe deplin descrisă [3] .

Interacțiuni

S-a demonstrat că TOP2B interacționează cu BAZ1B [4] , HDAC1 [5] [6] , histon deacetilaza 2 [5] , CD3E [7] , SUMO1 [8] și P53 [9] .

Note

↑ Tan KB, Dorman TE, Falls KM, Chung TD, Mirabelli CK, Crooke ST, Mao J. Topoisomerase II alpha and topoisomerase II beta genes: characterization and mapping to human chromosomes 17 and 3, respectiv // Cancer Research : jurnal. - 1992. - ianuarie ( vol. 52 , nr. 1 ). - P. 231-234 . — PMID 1309226 .
^ Jenkins JR, Ayton P., Jones T., Davies SL, Simmons DL, Harris AL, Sheer D., Hickson ID Izolarea clonelor de ADNc care codifică izoenzima beta a ADN-ului topoizomerazei umane II și localizarea genei la cromozomul 3p24 .) // Cercetarea acizilor nucleici : jurnal. - 1993. - ianuarie ( vol. 20 , nr. 21 ). - P. 5587-5592 . doi : 10.1093 / nar/20.21.5587 . — PMID 1333583 .
↑ Gena Entrez: TOP2B topoizomeraza (ADN) II beta 180kDa . (nedefinit)
↑ Kitagawa, Hirochika; Fujiki Ryoji, Yoshimura Kimihiro, Mezaki Yoshihiro, Uematsu Yoshikatsu, Matsui Daisuke, Ogawa Satoko, Unno Kiyoe, Okubo Mataichi, Tokita Akifumi, Nakagawa Takeya, Ito Takashi, Ishimi Yukio, Nagasawa Hiromichi, Matsumoto Shiroshio, Matsumoto. Complexul de remodelare a cromatinei WINAC vizează un receptor nuclear către promotori și este afectat în sindromul Williams // Cell : journal. — Statele Unite ale Americii: Cell Press , 2003. — iunie ( vol. 113 , nr. 7 ). - P. 905-917 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)00436-7 . — PMID 12837248 .
↑ 1 2 Tsai, SC; Valkov N; Yang W.M.; Gump J; Sullivan D; Seto E. Histone deacetilaza interacționează direct cu ADN topoizomeraza II // Nature Genetics : journal . - STATELE UNITE, 2000. - noiembrie ( vol. 26 , nr. 3 ). - P. 349-353 . — ISSN 1061-4036 . - doi : 10.1038/81671 . — PMID 11062478 .
↑ Johnson, CA; PadgetK; Austin CA; Turner B M. Activitatea deacetilazei se asociază cu topoizomeraza II și este necesară pentru apoptoza indusă de etoposide // Journal of Biological Chemistry : journal. - Statele Unite ale Americii, 2001. - Februarie ( vol. 276 , nr. 7 ). - P. 4539-4542 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.C000824200 . — PMID 11136718 .
↑ Nakano, H; Yamazaki T; Miyatake S; Nozaki N; Kikuchi A; Saito T. Interacțiunea specifică a topoizomerazei II beta și lanțul epsilon CD3 al complexului receptor al celulelor T (engleză) // Journal of Biological Chemistry : journal. - STATELE UNITE, 1996. - Martie ( vol. 271 , nr. 11 ). - P. 6483-6489 . — ISSN 0021-9258 . doi : 10.1074 / jbc.271.11.6483 . — PMID 8626450 .
↑ Mao, Y; Desai SD; Liu L F. Conjugarea SUMO-1 la izoenzimele ADN topoizomerazei II umane (engleză) // Journal of Biological Chemistry : journal. - STATELE UNITE, 2000. - august ( vol. 275 , nr. 34 ). - Str. 26066-26073 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M001831200 . — PMID 10862613 .
↑ Cowell, I.G.; Okorokov A.L.; Cutts SA; PadgetK; Clopot M; Milner J; Austin C A. Topoizomeraza umană IIalpha și IIbeta interacționează cu regiunea C-terminală a p53 // Experimental Cell Research : jurnal. - STATELE UNITE, 2000. - Februarie ( vol. 255 , nr. 1 ). - P. 86-94 . — ISSN 0014-4827 . - doi : 10.1006/excr.1999.4772 . — PMID 10666337 .

Literatură

ADN-topoizomerazele Champoux JJ : structură, funcție și mecanism. (Engleză) // Revizuirea anuală a biochimiei : jurnal. - 2002. - Vol. 70 . - P. 369-413 . - doi : 10.1146/annurev.biochem.70.1.369 . — PMID 11395412 .
Austin CA, Fisher LM Izolarea și caracterizarea unei clone de ADNc uman care codifică un nou omolog de ADN topoizomerazei II din celulele HeLa. (Engleză) // Scrisori FEBS : jurnal. - 1990. - Vol. 266 , nr. 1-2 . - P. 115-117 . - doi : 10.1016/0014-5793(90)81520-X . — PMID 2163884 .
Chung TD, Drake FH, Tan KB și colab. Caracterizarea și identificarea imunologică a clonelor de ADNc care codifică două izoenzime ADN topoizomerazei II umane (engleză) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1990. - Vol. 86 , nr. 23 . - P. 9431-9435 . - doi : 10.1073/pnas.86.23.9431 . — PMID 2556712 .
Austin CA, Sng JH, Patel S., Fisher LM Novel HeLa topoizomeraza II este izoforma beta II: secvență de codificare completă și omologie cu alte topoizomeraze de tip II // Biochimica et Biophysica Acta : jurnal. - 1993. - Vol. 1172 , nr. 3 . - P. 283-291 . - doi : 10.1016/0167-4781(93)90215-Y . — PMID 8383537 .
Davies SL, Jenkins JR, Hickson ID Celulele umane exprimă două forme diferențiate de ARNm topoizomerazei II beta // Nucleic Acids Research : jurnal. - 1993. - Vol. 21 , nr. 16 . - P. 3719-3723 . doi : 10.1093 / nar/21.16.3719 . — PMID 8396237 .
Nakano H., Yamazaki T., Miyatake S., et al. Interacțiunea specifică a topoizomerazei II beta și lanțul epsilon CD3 al complexului receptor al celulelor T (engleză) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1996. - Vol. 271 , nr. 11 . - P. 6483-6489 . doi : 10.1074 / jbc.271.11.6483 . — PMID 8626450 .
Biersack H., Jensen S., Gromova I., et al. Heterodimerii activi sunt formați din izoformele topoizomerazei II alfa și II beta ale ADN-ului uman (engleză) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Vol. 93 , nr. 16 . - P. 8288-8293 . - doi : 10.1073/pnas.93.16.8288 . — PMID 8710863 .
Meyer KN, Kjeldsen E., Straub T., et al. Relocarea cuplată cu ciclul celular a topoizomerazelor de tip I și II și modularea activităților enzimelor catalitice // Journal of Cell Biology : jurnal. - 1997. - Vol. 136 , nr. 4 . - P. 775-788 . doi : 10.1083/ jcb.136.4.775 . — PMID 9049244 .
Fukunaga R., Hunter T. MNK1, o nouă protein kinază activată de kinază MAP, izolată printr-o metodă nouă de screening a expresiei pentru identificarea substraturilor protein kinazei // Jurnalul EMBO : jurnal. - 1997. - Vol. 16 , nr. 8 . - P. 1921-1933 . - doi : 10.1093/emboj/16.8.1921 . — PMID 9155018 .
Ng SW, Liu Y., Schnipper LE Clonarea și caracterizarea secvenței de flancare 5’ pentru gena ADN topoizomeraza II beta umană (engleză) // Gene: journal. - 1998. - Vol. 203 , nr. 2 . - P. 113-119 . - doi : 10.1016/S0378-1119(97)00500-3 . — PMID 9426241 .
Yamane K., Kawabata M., Tsuruo T. O proteină care leagă ADN-topoizomeraza-II cu opt regiuni repetate similare cu enzimele de reparare a ADN-ului și cu un regulator al ciclului celular // FEBS Journal : jurnal. - 1998. - Vol. 250 , nr. 3 . - P. 794-799 . - doi : 10.1111/j.1432-1033.1997.00794.x . — PMID 9461304 .
Cowell IG, Willmore E., Chalton D., et al. Distribuția nucleară a topoizomerazei ADN uman IIbeta: un semnal de țintire nucleară rezidă în coada C-terminală cu 116 reziduuri // Experimental Cell Research : jurnal. - 1998. - Vol. 243 , nr. 2 . - P. 232-240 . - doi : 10.1006/excr.1998.4150 . — PMID 9743583 .
Lang AJ, Mirski SE, Cummings HJ, et al. Organizarea structurală a genelor umane TOP2A și TOP2B (engleză) // Gene : journal. - 1998. - Vol. 221 , nr. 2 . - P. 255-266 . - doi : 10.1016/S0378-1119(98)00468-5 . — PMID 9795238 .
Sng JH, Heaton VJ, Bell M., et al. Clonarea moleculară și caracterizarea genelor topoizomerazei umane IIalpha și IIbeta: dovezi pentru evoluția izoformelor prin duplicarea genelor // Biochimica et Biophysica Acta : jurnal. - 1999. - Vol. 1444 , nr. 3 . - P. 395-406 . - doi : 10.1016/S0167-4781(99)00020-2 . — PMID 10095062 .
Bjergbaek L., Jensen S., Westergaard O., Andersen AH Utilizarea unei abordări biochimice pentru a identifica regiunile de dimerizare primară în topoizomeraza ADN umană IIalpha // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1999. - Vol. 274 , nr. 37 . - P. 26529-26536 . doi : 10.1074 / jbc.274.37.26529 . — PMID 10473615 .
Cowell IG, Okorokov AL, Cutts SA, et al. Topoizomeraza umană IIalpha și IIbeta interacționează cu regiunea C-terminală a p53 // Experimental Cell Research : jurnal. - 2000. - Vol. 255 , nr. 1 . - P. 86-94 . - doi : 10.1006/excr.1999.4772 . — PMID 10666337 .
Mao Y., Desai SD, Liu LF SUMO-1 conjugarea la izoenzimele ADN topoizomerazei II umane (engleză) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 34 . - Str. 26066-26073 . - doi : 10.1074/jbc.M001831200 . — PMID 10862613 .
Mirski SE, Voskoglou-Nomikos T., Young LC, et al. Cuantificarea simultană a topoizomerazei II alfa și beta izoforme ARNm în celulele tumorale pulmonare și țesutul pulmonar normal și malign // Investigații de laborator : jurnal. - 2000. - Vol. 80 , nr. 6 . - P. 787-795 . - doi : 10.1038/labinvest.3780083 . — PMID 10879730 .