XbaI | |
---|---|
Identificatori | |
Cod KF | 3.1.21.4 |
Baze de date de enzime | |
IntEnz | Vedere IntEnz |
BRENDA | intrare BRENDA |
ExPASy | Vedere NiceZyme |
MetaCyc | cale metabolică |
KEGG | intrare KEGG |
PRIAM | profil |
Structuri PDB | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
Căutare | |
PMC | articole |
PubMed | articole |
NCBI | proteine NCBI |
XbaI este o endonuclează de restricție izolată din bacteria Xanthomonas badrii [1] .
XbaI este o endonuclează de restricție (Tipul II, subtipul P). Adică, XbaI recunoaște o secvență de ADN palindromic și face o restricție în cadrul palindromului la un punct fix. În prezența dimetilsulfoxidului (DMSO) și la concentrații mari de glicerol în mediu, XbaI își pierde capacitatea de a recunoaște un palindrom și efectuează restricții nespecifice ( activitate stelară ) . După restricție, se formează capete lipicioase cu proeminențe a patru baze.
complot palindromic | Produse de restricție |
---|---|
5'-TCTAGA-3' 3'-AGATCT-5' | 5'-T CATGA-3' 3'-AGATC T-5' |
Activitatea enzimei de restricție XbaI este inhibată de metilarea adeninei ( metilaza DAM ). Cu toate acestea, activitatea enzimei de restricție este păstrată atunci când citozina ( DCM- sau CpG -metilaza) este metilata. .
După ce restricția ADN este completă, Xbal poate fi inactivat prin denaturare la căldură la 65°C timp de 20 de minute. .
XbaI este utilizat pe scară largă în cercetarea în biologie moleculară. În special, XbaI este utilizat în donarea unor secvențe de nucleotide specifice [2] , în analiza de restricție .
De exemplu, XbaI a fost utilizat în analiza polimorfismelor receptorilor de estrogen α [3] și lipoproteinei a (ApoB) [4] .