XbaI

XbaI
Identificatori
Cod KF 3.1.21.4
Baze de date de enzime
IntEnz Vedere IntEnz
BRENDA intrare BRENDA
ExPASy Vedere NiceZyme
MetaCyc cale metabolică
KEGG intrare KEGG
PRIAM profil
Structuri PDB RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Căutare
PMC articole
PubMed articole
NCBI proteine ​​NCBI

XbaI este o endonuclează de restricție izolată din bacteria  Xanthomonas badrii [1] .

Proprietăți

XbaI este o endonuclează de restricție (Tipul II, subtipul P). Adică, XbaI recunoaște o secvență de ADN palindromic și face o restricție în cadrul palindromului la un punct fix. În prezența dimetilsulfoxidului (DMSO) și la concentrații mari de glicerol în mediu, XbaI își pierde capacitatea de a recunoaște un palindrom și efectuează restricții nespecifice ( activitate stelară ) . După restricție, se formează capete lipicioase cu proeminențe a patru baze.

Un exemplu de secvență palindromică recunoscută de Xbal și produșii de restricție rezultați
complot palindromic Produse de restricție
5'-TCTAGA-3' 3'-AGATCT-5' 5'-T CATGA-3' 3'-AGATC T-5'

Activitatea enzimei de restricție XbaI este inhibată de metilarea adeninei ( metilaza DAM ). Cu toate acestea, activitatea enzimei de restricție este păstrată atunci când citozina ( DCM- sau CpG -metilaza) este metilata. .

După ce restricția ADN este completă, Xbal poate fi inactivat prin denaturare la căldură la 65°C timp de 20 de minute. .

Aplicație

XbaI este utilizat pe scară largă în cercetarea în biologie moleculară. În special, XbaI este utilizat în donarea unor secvențe de nucleotide specifice [2] , în analiza de restricție .

De exemplu, XbaI a fost utilizat în analiza polimorfismelor receptorilor de estrogen α [3]   și lipoproteinei a (ApoB) [4] .

Link -uri

  1. Biolabs, New England XbaI | NEB . www.neb.com . Preluat la 8 mai 2016. Arhivat din original la 3 februarie 2022.
  2. Principii și tehnici de biochimie și biologie moleculară . — Ed. a VII-a. - Cambridge, Marea Britanie: Cambridge University Press, 2010. - xvi, 744 pagini p. — ISBN 9780521516358 .
  3. Hong Weng, Chao Zhang, Yuan-Yuan Hu, Rui-Xia Yuan, Hong-Xia Zuo. Asocierea dintre polimorfismele receptorului de estrogen-αGene XbaI și PvuII și sensibilitatea la parodontită: o meta-analiză  //  Markeri de boală. - 2015. - Vol. 2015 . — P. 1–9 . — ISSN 0278-0240 . - doi : 10.1155/2015/741972 . Arhivat din original pe 12 ianuarie 2018.
  4. Wei Gu, Mingduo Zhang, Shaojun Wen. Asocierea dintre polimorfismele și lipidele APOB XbaI și EcoRI în chineză: o meta-analiză  //  Lipidele în sănătate și boală. — 2015/12. - T. 14 , nr. 1 . - S. 123 . — ISSN 1476-511X . - doi : 10.1186/s12944-015-0125-z . Arhivat din original pe 12 ianuarie 2018.