Cutie TATA

Cutia TATA ( o casetă este o secvență repetată de nucleotide care formează un semnal transcripțional sau de reglare), sau o cutie Hogness  este un motiv conservator de ADN ( element cis-regulator ) al eucariotelor cu o secvență 5’ TATAAA-3’ [1] . Cutia TATA este situată în regiunea promotoare a genelor în arhee și eucariote [2] la aproximativ 30 de nucleotide în amonte de locul de începere a transcripției [3] . Prin prezența casetei TATA, se poate recunoaște șablonul de ADN care va fi transcris [1] . Leagă factorii de transcripție care atrag ARN polimeraza la locul de începere a transcripției [1] (de exemplu, factorul TFIID sau factorul TATA [4] ). Astfel, cutia TATA este echivalentă din punct de vedere funcțional cu caseta Pribnow în bacterii [5] .

Funcționare

În mod normal, cutia TATA de la începutul transcripției se leagă de proteina de legare a TATA (TBP), care desfășoară ADN-ul. Situl bogat în AT facilitează desfășurarea deoarece cele 2 legături de hidrogen dintr-o pereche А-Тsunt mai puțin puternice decât cele 3 dintr-o pereche G-C. TBP este o proteină neobișnuită care se leagă de șanțul minor al ADN-ului și este compusă din foi β [6] .

Cutia TATA este de obicei găsită la locurile de legare a ARN polimerazei II . Factorul de transcripție TFIID se leagă de caseta TATA, iar după acesta, un alt factor de transcripție, TFIIA , se unește cu partea superioară , iar TFIIB se unește cu partea inferioară . Legarea la acești factori este facilitată și de derularea ADN-ului indusă de TBP [3] . ARN polimeraza II recunoaște și se leagă de acest complex multiproteic , însoțit de diverși alți factori de transcripție, cum ar fi TFIIF , TFIIE și TFIIH . Aceasta inițiază transcripția, iar ARN polimeraza II se mișcă de-a lungul lanțului ADN, în timp ce TFIID și TFIIA rămân asociate cu caseta TATA. În viitor, acest lucru poate facilita atașarea unor molecule suplimentare de ARN polimerază II. În plus, s-a demonstrat că cutia TATA poate iniția transcripția efectuată nu numai de ARN polimeraza II, ci și de ARN polimeraza III [7] .

Distribuție

Cutia TATA este un motiv promotor eucariotic foarte vechi, foarte conservat de-a lungul evoluției și primul astfel de motiv identificat. Totuși, cutia TATA nu este foarte răspândită la vertebrate [3] . Majoritatea genelor umane nu au o cutie TATA, iar în ele își joacă rolul elementul inițiator sau un promotor mai complex de tip CpG . Aproximativ 24% dintre genele umane conțin cutia TATA situată în promotorul central [8] (conform altor cercetători, caseta TATA se găsește în 10% dintre promotorii genei umani [9] ). Puțin mai devreme, o analiză a aproximativ o mie de gene a relevat prezența cutiei TATA în promotorii a 32% dintre ele [10] . S-a stabilit că cutia TATA este cel mai larg distribuită printre genele implicate în răspunsurile celulare și organogeneză. Aparent, promotorii cu o cutie TATA sunt caracteristici unor gene specifice anumitor tipuri de celule , în timp ce promotorii CpG sunt caracteristici genelor menajere [3] .

Vezi și

• Cutia Pribnov

Note

1. ↑ 1 2 3 SCitable Glosar: ​​TATA box . Preluat la 6 martie 2014. Arhivat din original la 8 martie 2014. (nedefinit)
2. ↑ Smale ST , Kadonaga JT Promotorul central al ARN polimerazei II.  (engleză)  // Revizuirea anuală a biochimiei. - 2003. - Vol. 72. - P. 449-479. - doi : 10.1146/annurev.biochem.72.121801.161520 . — PMID 12651739 .
3. ↑ 1 2 3 4 Barrett et. al., 2013 , p. patru.
4. ↑ Konichev, Sevastyanova, 2012 , p. 265.
5. ↑ Arefiev V. A., Lisovenko L. A. TATA-box // Dicționar explicativ englez-rus al termenilor genetici. - M . : Editura VNIRO, 1995. - ISBN 5-85382-132-6 .
6. ↑ Patikoglou GA , Kim JL , Sun L. , Yang SH , Kodadek T. , Burley SK Recunoașterea elementelor TATA de către proteina de legare a casetei TATA a fost conservată de-a lungul evoluției.  (engleză)  // Gene și dezvoltare. - 1999. - Vol. 13, nr. 24 . - P. 3217-3230. — PMID 10617571 .
7. ^ Wang Y. , Jensen RC , Stumph WE Rolul secvenței și orientării casetei TATA în determinarea specificității transcripției ARN polimerazei II/III.  (engleză)  // Cercetarea acizilor nucleici. - 1996. - Vol. 24, nr. 15 . - P. 3100-3106. — PMID 8760900 .
8. ↑ Yang C. , Bolotin E. , Jiang T. , Sladek FM , Martinez E. Prevalența inițiatorului peste caseta TATA în genele umane și de drojdie și identificarea motivelor ADN îmbogățite în promotori umani fără TATA.  (engleză)  // Gene. - 2007. - Vol. 389, nr. 1 . - P. 52-65. - doi : 10.1016/j.gene.2006.09.029 . — PMID 17123746 .
9. ^ Carninci P. , Sandelin A. , Lenhard B. , Katayama S. , Shimokawa K. , Ponjavic J. , Semple CA , Taylor MS , Engström PG , Frith MC , Forrest AR , Alkema WB , Tan SL , Plessy C. . Kodzius R. , Ravasi T. , Kasukawa T. , Fukuda S. , Kanamori-Katayama M. , Kitazume Y. , Kawaji H. , Kai C. , Nakamura M. , Konno H. , Nakano K. , Mottagui-Tabar S . , Arner P. , Chesi A. , Gustincich S. , Persichetti F. , Suzuki H. , Grimmond SM , Wells CA , Orlando V. , Wahlestedt C. , Liu ET , Harbers M. , Kawai J. , Bajic VB , Hume DA , Hayashizaki Y. Analiza la nivel de genom a arhitecturii și evoluției promotorului mamiferelor.  (engleză)  // Genetica naturii. - 2006. - Vol. 38, nr. 6 . - P. 626-635. - doi : 10.1038/ng1789 . — PMID 16645617 .
10. ↑ Suzuki Y. , Tsunoda T. , Sese J. , Taira H. , Mizushima-Sugano J. , Hata H. , Ota T. , Isogai T. , Tanaka T. , Nakamura Y. , Suyama A. , Sakaki Y. , Morishita S. , Okubo K. , Sugano S. Identificarea și caracterizarea regiunilor potențiale promotoare a 1031 de tipuri de gene umane.  (engleză)  // Cercetarea genomului. - 2001. - Vol. 11, nr. 5 . - P. 677-684. - doi : 10.1101/gr.164001 . — PMID 11337467 .

Literatură

• Lucy W. Barrett, Sue Fletcher, Steve D. Wilton. Regiunile genelor netraduse și alte elemente necodificate . - SpringerBriefs in Biochemistry and Molecular Biology, 2013. - 57 p. - ISBN 978-3-0348-0679-4 .
• Konichev A.S., Sevastyanova G.A. Biologie moleculară. - Centrul de Editură „Academia”, 2012. - 400 p. — ISBN 978-5-7695-9147-1 .