Secvență de replicare autonomă

O secvență de replicare autonomă ( ARS) este o secvență de ADN a  genomului de drojdie care conține originea replicării (ori) și este responsabilă pentru inițierea replicării .

Funcționare și structură

Inițial, secvențele ARS au fost descrise în drojdia în devenire Saccharomyces cerevisiae ca fragmente de ADN cromozomial care măresc frecvența transformării și asigură stabilitatea plasmidelor . Astfel, plasmidele care le conțin au transformat celulele de drojdie cu o frecvență înaltă [1] . Ulterior, elemente similare au fost găsite în drojdia Schizosaccharomyces pombe [2] .

În urma unor studii suplimentare, s-a dovedit că ARS conțin o origine a replicării, adică sunt elemente responsabile pentru inițierea replicării - replicatori . Pe o întindere de ADN lungă de 5 mii bp. n. există trei elemente separate ale ARS. Inițierea lor are loc o dată în fiecare fază S a ciclului celular , deși eficacitatea și timpul de activare (la începutul sau la sfârșitul fazei S) pot diferi pentru diferite ARS [3] .

În S. cerevisiae , lungimea ARS este de 100–200 nt. n. ARS include următoarele 2 elemente obligatorii: domeniul A , care conține o secvență conservatoare de 11 n. n. - ACS, care se leagă la un complex de 6 proteine ​​- complexul de recunoaștere a originii  (ORC ) și un domeniu mare B bogat în perechi A - T adiacent elementului A, cu toate acestea, nu există nicio similitudine între secvențele lor. Secvența ACS este: unde Y este pirimidină și R este purină . ORC are omologi în alte eucariote , cum ar fi Drosophila , Xenopus , șoareci și oameni. În S. cerevisiae , legarea factorilor de inițiere de ORC a fost bine studiată până în prezent [1] . 5'-T/ATTTAYRTTTT/A-3'

Trebuie remarcat faptul că, în ciuda asemănării mecanismelor de replicare eucariote și a proteinelor implicate în aceasta , originile replicării lor pot prezenta diferențe semnificative. De exemplu, în drojdia S. pombe , care are multe asemănări cu celulele eucariote superioare, ARS este mult mai lung decât în ​​S. cerevisiae și conține 600-1500 bp. n., iar asemănarea în secvențele lor de ADN constă numai în prezența regiunilor bogate în A-T în ambele [1] .

S-a stabilit că mutațiile din domeniul B reduc activitatea elementului ARS, totuși, atunci când domeniul A este mutat, întregul element devine complet inactiv.

Note

  1. 1 2 3 VINAY KUMAR SRIVASTAVA, DHARANI DHAR DUBEY. Cartografierea elementelor de secvență cu replicare autonomă într-o regiune de 73 kb a cromozomului II a drojdiei de fisiune, Schizosaccharomyces pombe  // Journal of Genetics. - 2007. - T. 86 , nr 2 . - S. 139-148 .
  2. Clyne RK, Kelly TJ Identificarea elementelor secvenței cu replicare autonomă (ARS) în celulele eucariote. // Metode .. - 1997. - T. 13 , nr 3 . - S. 221-233 .
  3. Konichev, Sevastyanova, 2012 , p. 230.

Literatură