Proteină membranară integrală

Proteina membranară integrală ( IMP , IMP sau pur și simplu proteina integrală ) este unul dintre tipurile de proteine ​​​​membranare care sunt puternic asociate cu membrana citoplasmatică (integrată). Ele alcătuiesc o parte semnificativă a proteinelor codificate în genomul oricărui organism [1] . Proteinele integrale pot fi complet scufundate în membrană, iar uneori chiar pătrund prin aceasta [2] . În acest sens, toate proteinele transmembranare sunt proteine ​​integrale, dar nu toate proteinele integrale sunt transmembranare. Legătura proteinelor integrale cu lipidele membranare este foarte puternică și este determinată în principal deinteracțiuni hidrofobe .

Structura

O caracteristică a proteinelor integrale este prezența în lanțul lor polipeptidic a secțiunilor destul de extinse, cu un conținut predominant de aminoacizi nepolari. De regulă, aceste situsuri au o conformație α-helix, pe partea exterioară a căreia se află fragmente laterale de hidrocarburi de reziduuri de aminoacizi, în urma cărora întregul helix, în ansamblu, capătă un caracter hidrofob. Proporția regiunilor elicoidale α din proteinele membranare este destul de mare (30-50%), restul lanțului polipeptidic este predominant sub formă de spirală. De regulă, există puține locuri cu o structură β, dar dacă sunt, atunci o astfel de proteină, de regulă, are forma unui butoi beta.

Proteinele integrale pot fi împărțite în două grupe:

Studii structurale

Unul dintre principalele obstacole în studiul structural al proteinelor integrale ale membranelor biologice este solubilitatea lor scăzută. Proteinele membranare sunt practic insolubile în sistemele tampon apoase, iar acest lucru elimină practic utilizarea enzimelor proteolitice în forma tradițională. Aceeași problemă împiedică obținerea exactă a structurilor lor atomice prin analiza de difracție de raze X : proteinele membranei cu greu formează cristale. Din acest motiv, modelarea bazată pe structura spațială a proteinelor omoloage este adesea folosită pentru a elucida structurile lor terțiare și cuaternare.

Funcții

Proteinele membranare integrale includ proteine ​​transportoare, linkeri, canale ionice, receptori , enzime , domenii structurale ale ancorelor membranare, proteine ​​implicate în acumularea și transferul de energie și proteinele responsabile de adeziunea celulară [3] .

Exemple de proteine ​​integrale

Note

  1. ↑ Wallin E., von Heijne G. Analiza la nivel de genom a proteinelor membranare integrale din organisme eubacteriene, arheene și eucariote  //  Protein Science : jurnal. - 1998. - Vol. 7 , nr. 4 . - P. 1029-1038 . - doi : 10.1002/pro.5560070420 . — PMID 9568909 .
  2. ↑ Gusev M.V., Mineeva L.A. Microbiologie. - M. : Mosk.un-ta, 1985. - 376 p.
  3. ↑ Saier MH, Yen MR, Noto K., Tamang DG, Elkan C. The Transporter Classification Database: recent advances  // Nucleic Acids Res  . : jurnal. - 2009. - Ianuarie ( vol. 37 , nr. Problema bazei de date ). - P.D274-8 . doi : 10.1093 / nar/gkn862 . — PMID 19022853 .
  Accesați articolul Wikidata  Dicționare și enciclopedii