Haplogrup R (ADNmt)

Haplogrupul R  este un haplogrup ADN mitocondrial uman.

Origine

Haplogrupul R este un descendent al macrogrupului N și, în funcție de vechimea sa, lărgimea de distribuție și numărul de grupuri descendente, poate fi numit în sine macrogrup. Probabil că își are originea în Orientul Apropiat la scurt timp (la doar câteva mii de ani) după ce a fost colonizat de oameni (acum aproximativ 55 de mii de ani). Mai târziu, expansiunea a fost efectuată din această regiune, astfel încât purtătorii grupului R (adesea împreună cu alte subclade ale grupului N) s-au răspândit: la sud până în Arabia și nord-estul Africii , la est de-a lungul Podișului Iranian , mai departe în Asia Centrală până în Altai . şi Hindustan , la nord în Anatolia , Caucaz şi mai departe în estul Europei .

Subcladele R5, R6 , R7 , R8, R30, R31 sunt haplogrupuri autohtone din India. În setul de date pentru Asia Centrală (Comas et al. 2004), din 232 de filiații, doar 2 aparțin lui R5 [1] .

Descendenții acestui grup includ B , UK (și descendenții săi U și K ), F , R0 (și descendenții săi HV , H și V ) și pre-JT (și descendenții săi JT , J și T ).

Paleogenetica

Haplogrupul mitocondrial R* a fost descoperit la un paleo-siberian din Ust-Ishim ( bărbatul Ust-Ishim ), care a trăit acum 45 de mii de ani [2] , dar în 2016 echipa lui Poznik a clasificat haplogrupul mitocondrial U* în Ust-Ishim [3] ] .

Haplogrupul R a fost determinat în proba din Paleoliticul târziu CC7-2289 (acum aproximativ 44 de mii de ani) din peștera Bacho Kiro din Bulgaria [4]

Haplogrupul R* include genomul mitocondrial al unui dinte de lapte din Peștera Fumane ( it: Grotta di Fumane ), găsit într-un strat vechi de 41.110–38.500 de ani (Proto-Aurignacian) [5] .

S-a descoperit că rămășițele fetei Paglichci 23 ( en: Paglicci 23 ) din peștera italiană Paglichci , de aproximativ 28 de mii de ani, au secvența de referință Cambridge ( en: Cambridge Reference Sequence ) HVR1, ceea ce indică faptul că individul avea fie haplogrupul mitocondrial R sau haplogrupul mitocondrial H [6] . Analiza ADN-ului Cro-Magnon Paglicci-12 , care a trăit în urmă cu aproximativ 24 de mii de ani, a arătat că el aparține haplogrupului mitocondrial R [7] .

Subclada R1b a fost găsită la locuitorul de pe Muntele Afontova AG-3, care a trăit acum 16.930–16.490 de ani.

R1 a fost determinat în proba yak025 (14865-14590 î.Hr.) din Peștera Khaiyrgas (Peștera Khaiyrgas, cultura Dyuktai ) [8] . În proba Khaiyrgas-1 din Yakutia (acum 16,9 mii de ani), a fost determinat R1b [9] .

R9c1b a fost identificat într-un specimen Qihe3 (acum 11.747–11.356 de ani ) din provincia Fujian din China [10] .

R2-a* a fost identificat în proba AH2 (8205-7756 î.Hr.) de la Tepe Abdul Hosein din Iran (Shahrestan Nurabad ) [11] .

R11 [12] a fost determinat în proba NE35 (AR8.9K, ARpost9K, acum 9131-8770 de ani ) din regiunea Amur ( China ) [13] .

R3 se găsește la un reprezentant al neoliticului Ungariei, care a trăit cca. acum 7500 de ani [14] .

R1b a fost identificat la un locuitor mezolitic al Insulei South Deer [15] .

R1a a fost determinată în exemplarele eneolitice I2055 (Unakozovskaya, acum 6533 ani) și I2056 (Unakozovskaya, acum 6477,5 ani) din Caucazul de Nord (peștera Unakozovskaya de pe pârâul Meshoko) [16] .

R1b1 a fost identificat de la un reprezentant al culturii estoniene de topoare de luptă SOP002 (2864–2495 î.Hr.) din cimitirul Sope din județul Ida-Viru [17] .

R1a a fost identificat într-un reprezentant al stadiului Novosvobodnensky al culturii Maikop I6268 (acum 5564 de ani) din tractul Klady din Adygea [16] .

R1a1a a fost determinat în specimenul MK5009.A0101 din Caucazul de Nord (Marinskaya 5, acum 4710 ani) [16] .

R1b1 a fost determinat în specimenul GLZ003 de la Glazkovo (Glazkovskoe predmestie), datat cu 4519–4417 ani în urmă. n. (Epoca timpurie a bronzului din Baikal) [18] .

R1a a fost identificat printre reprezentanții culturii Darkveti-Meshokovskaya (ceramica cu perle) din Eneoliticul târziu [19] .

R1b a fost determinat din specimenul din epoca bronzului Anosovo-1 din Transbaikalia (acum aproximativ 4 mii de ani) [9] .

R1b a fost identificat într-un reprezentant al culturii Lolin post-Catacomb NV3001 (Nevinnomiskiy 3, 3970,5 ani în urmă) în Kalmykia ( Lola ) [16] .

R1b1 a fost identificat în proba BIY002.A0101 (secolele III-II î.Hr., orizontul Sargat) din tractul Gornaya Bitiya de pe râul Ishim, situat la 8 km sud-vest de satul Nizhnyaya Ilyinka (regiunea Omsk) [20] .

R1b1 a fost identificat în mumia Tarim L5213 (acum 2000–1800 de ani) [21] .

R11 [12] a fost găsit în specimenul neclasificat KHI001 (Epoca Bronzului Mediu-Târzie) din stepa Eurasiatică de Est din Altai [22] .

R1a a fost determinat în proba ALA135 (1876-1636 î.Hr.) de la Tell-Atchan ( Alalakh , Turcia) [23] .

R1b1 a fost identificat în reprezentanții culturii Unetice din Republica Cehă I14191 (Czech_EBA_Unetice, acum 3850 de ani) [24] .

R1b1 a fost găsit în specimenul I3860 (Oy-Dzhaylau III, acum 3626 de ani) din Epoca Bronzului Mijlociu-Târzie a Kazahstanului (Oy_Dzhaylau_MLBA_o) [25] .

R9b1a3 a fost identificat în proba LayiKD01 (acum 1532–1403 ani), R9b1b în proba QinchangKD14 (acum 1545–1407 ani) din China (Regiunea Autonomă Guangxi Zhuang) [10] .

R1a1a a fost găsit într-o probă de la cimintul Kanagegh (Kanagegh, Armenia) datată 1500-1300 î.Hr. [26] .

R1b1 a fost găsit la un locuitor din Nerkin Getashen (Nerqin Getashen, Armenia), care a trăit în anii 1400-1200 î.Hr. [26] .

Haplogrupurile mitocondriale R2 și R5 au fost identificate în probe din regiunea Haft-Tape din perioada Middle Elam [27] .

R6 a fost identificat într-un reprezentant al culturii Koban din cimitirul Zayukovo-3, situat în apropierea satului Zayukovo din regiunea Baksan din Republica Kabardino-Balkaria (secolele VIII-VI î.Hr.) [28] .

R9 a fost determinat dintr-o probă de sicrie suspendate din Yunnan [29] .

R30 a fost determinat la o persoană cu un amestec din Asia de Sud de 40-50% din cimitirul Wat Komnou (Vat Komnou) din Angkor Borei ( Cambodgia ), care a trăit la începutul mileniului I (interval de încredere 95% - 78-). 234, data calibrată) [30] .

R0a1 a fost determinat în specimene de la cimitirul creștin R (~650–1000) de pe insula Kulubnarti din nordul Sudanului [31] .

R11a a fost găsit în specimenul medieval târziu DEC01/SHR001 din Mongolia [22] .

R1a1a a fost găsit în specimenul norvegian VK114 de la Trondheim (sec. XII-XIII) [32] .

R9b1b a fost determinat în eșantionul HuatuyanNL18 (acum 500 de ani), R+16189 în eșantionul HuatuyanNL19 (acum 455–294 de ani) din China (Regiunea Autonomă Guangxi Zhuang) [10] .

Note

1. ↑ Malliya gounder Palanichamy și colab. Filogeneza ADN-ului mitocondrial Macrohaplogrup N în India, bazată pe secvențierea completă: Implicații pentru populația Asiei de Sud Arhivat 5 mai 2021 la Wayback Machine , decembrie 2004
2. ↑ INFORMAȚII SUPLIMENTARE 8. ANALIZA GENOMULUI MITOCONDRIAL . Preluat la 23 octombrie 2014. Arhivat din original la 24 martie 2016. (nedefinit)
3. ↑ Posnik GD și colab. (2016) Explorări punctuate în demografia masculină umană deduse din 1.244 de secvențe de cromozom Y din întreaga lume Arhivat 28 mai 2017 la Wayback Machine , Nature Genetics, 48, 593–599 (Poznik supp. fig. 15).
4. ↑ Jean-Jacques Hublin și colab. Homo sapiens inițial din paleoliticul superior din peștera Bacho Kiro, Bulgaria Arhivat 19 iunie 2020 la Wayback Machine , 11 mai 2020
5. ↑ Datele paleogenetice au confirmat că creatorii culturii proto-aurignaciane au fost oameni moderni Arhivat 29 aprilie 2015 la Wayback Machine , 27.04.2015
6. ↑ O secvență de ADNmt Cro-Magnon veche de 28.000 de ani diferă de toate secvențele moderne cu potențial contaminare
7. ↑ ADN antic . Data accesului: 1 februarie 2015. Arhivat din original pe 23 aprilie 2015. (nedefinit)
8. ↑ Gülşah Merve Kılınç şi colab. Investigarea istoriei populației umane din Holocen în Asia de Nord folosind mitogenome antice Arhivată la 31 iulie 2020 la Wayback Machine , 12 iunie 2018 // Setul de date 1 / Tabelul S4
9. ↑ 1 2 Gülşah Merve Kılınç şi colab. Dinamica populației umane și Yersinia pestis în Asia antică de nord-est Arhivat 17 iunie 2021 la Wayback Machine , 2021
10. ↑ 1 2 3 Tianyi Wang și colab. Istoria populației umane la răscrucea Asiei de Est și de Sud-Est de acum 11.000 de ani // Cell, 24 iunie 2021
11. ↑ Broushaki F. și colab. (iulie 2016). „Genomul neolitic timpuriu din Semiluna Fertilă de Est” . stiinta . 353 (6298). doi : 10.1126/science.aaf7943 . PMC  5113750 . PMID  27417496 . Arhivat din original pe 22.02.2020 . Accesat 2021-05-30 . Parametru depreciat folosit |deadlink=( ajutor );Verificați data la |date=( ajutor în engleză )
12. ↑ 12 R11 MTree
13. ↑ Xiaowei Mao și colab. Istoria profundă a populației din nordul Asiei de Est de la Pleistocenul târziu până la Holocen Arhivat 28 iunie 2021 la Wayback Machine , 27 mai 2021
14. ↑ Fu. Q. şi colab. Istoria genetică a Epocii de gheață Europe , Nature, publicat online la 2 mai 2016.
15. ↑ Alissa Mittnik și colab. Istoria genetică a Europei de Nord Arhivat 25 aprilie 2017 la Wayback Machine , 03.03.2017
16. ↑ 1 2 3 4 Chuan-Chao Wang și colab. Preistoria genetică a Caucazului Mare Arhivat 9 mai 2020 la Wayback Machine , 16 mai 2018
17. ↑ Lehti Saag, Sergey V. Vasilyev, Svetlana V. Oshibkina et al. Modificări genetice ale strămoșilor în tranziția din epoca pietrei la epoca bronzului în câmpia est-europeană Arhivată la 23 ianuarie 2021 la Wayback Machine (Tabelul 1), 03 iulie 2020 ( bioRxiv Arhivată la 30 ianuarie 2021 la Wayback Machine )
18. ↑ He Yu și colab. Siberienii de la Paleolitic până la Epoca Bronzului dezvăluie legături cu primii americani și din Eurasia Arhivat 2 iulie 2020 la Wayback Machine , 20 mai 2020
19. ↑ Chuan-Chao Wang și colab. Preistoria genetică a Caucazului Mare Arhivat 18 mai 2018 la Wayback Machine , 16 mai 2018
20. ↑ Guido Alberto Gnecchi-Ruscone și colab. Transectul de timp genomic antic din stepa din Asia Centrală dezvăluie istoria sciților Arhivat 18 august 2021 la Wayback Machine // Science Advances. Vol. 7, numărul 13, 26 mai 2021
21. ↑ Tabelul cu date extinse 1 Un rezumat al indivizilor din Xinjiang din Epoca Bronzului raportați în acest studiu Arhivat la 29 octombrie 2021 la Wayback Machine . De la: Fan Zhang și colab. Originile genomice ale mumiilor din Bazinul Tarim din Epoca Bronzului Arhivat 30 octombrie 2021 la Wayback Machine // Nature, 2021
22. ↑ 1 2 Choongwon Jeong și colab. O istorie genetică dinamică de 6.000 de ani a stepei de est a Eurasiei Arhivată 3 noiembrie 2020 la Wayback Machine , 2020
23. ↑ Tara Ingman și colab. Mobilitatea umană la Tell Atchana (Alalakh), Hatay, Turcia în timpul mileniului al II-lea î.Hr.: Integrarea probelor izotopice și genomice Arhivat 24 mai 2022 la Wayback Machine // Plos One, 30 iunie 2021
24. ↑ Nick Patterson și colab. Migrație pe scară largă în Marea Britanie în timpul epocii bronzului mijlociu și târzie Arhivat la 1 ianuarie 2022 la Wayback Machine // Nature, 22 decembrie 2021
25. ↑ Vagheesh M. Narasimhan și colab. Formarea populațiilor umane în Asia de Sud și Centrală  (engleză)  // Știință. — 06-09-2019. — Vol. 365 , iss. 6457 . — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203 . - doi : 10.1126/science.aat7487 . Arhivat din original pe 4 aprilie 2021. ( The Genomic Formation of South and Central Asia, bioRxiv Arhivat 17 martie 2021 la Wayback Machine )
26. ↑ 1 2 Margaryan, Derenko și colab. Opt milenii de continuitate genetică matriliniară în Caucazul de Sud
27. ↑ ت lf توالی ADN میوکوکوک icles (mtdna) وقای ا icles ی دوره‌ی ایلام inct محوطه‌ی وه‌ی وه‌ی وه‌ی وه‌ی وه‌ی وه‌ی lf وه‌ی وه‌ی وه‌ی وه‌ی وه‌ی lf وه‌ی și ‌ ‌ eT . Preluat la 21 martie 2020. Arhivat din original la 21 martie 2020. (nedefinit)
28. ↑ Eugenia Boulygina și colab. Diversitatea mitocondrială și a cromozomilor Y a culturii preistorice Koban din Caucazul de Nord , 2020
29. ↑ Xiaoming Zhang și colab. O perspectivă genetică matriliniară a sicriului agățat în sudul Chinei și nordul Thailandei , 24 aprilie 20
30. ↑ Piya Changmai și colab. ADN-ul antic din perioada protoistorică Cambodgia indică faptul că sud-asiaticii s-au amestecat cu populațiile locale încă din secolele I-III d.Hr. , 05 iulie 2022
31. ↑ Kendra A. Sirak și colab. Stratificare socială fără diferențiere genetică la locul lui Kulubnarti în perioada creștină Nubia Arhivată la 6 martie 2021 la Wayback Machine , 17 februarie 2021 ( Figura suplimentară 5, 6 Arhivată la 23 octombrie 2021 la Wayback Machine )
32. ↑ Ashot Margaryan și colab. Genomica populației din lumea vikingă Arhivată 12 februarie 2020 la Wayback Machine , 2019

Vezi și

Link -uri

Informații generale

• Site-ul ADN mitocondrial al lui Ian Logan
• PhyloTree.org - mtDNA tree Build 17 (18 februarie 2016): subtree R
• R YFull MTree 1.02.00 (în construcție)

Haplogrup R

• • Răspândirea haplogrupului R , de la National Geographic