Element SECIS

Elementul SECIS (din engleză  se leno c ysteine ​​i insertion s equence - selenocysteine ​​insertion sequence ) este o regiune de ARN lungă de aproximativ 60 de nucleotide , formând o structură asemănătoare acului de păr [1] . Acest motiv structural (set de nucleotide) face ca codonul stop UGA să codifice selenocisteina. Prin urmare, elementul SECIS este un element integral al ARNm care codifică selenoproteine ​​( proteine ​​care conțin unul sau mai multe resturi de aminoacizi care conțin seleniu selenocisteină).

În bacterii , elementul SECIS este localizat aproape imediat după codonul UGA pe care îl afectează. În arhee și eucariote , este situat în regiunea 3 ' netradusă ( 3' UTR ) a ARNm, iar un element SECIS poate determina mai mulți codoni UGA să codifice selenocisteina. Într-un gen arheean, Methanococcus , elementul SECIS este situat în regiunea 5 ' netradusă ( 5' UTR ) .  

Elementul SECIS poate fi distins prin secvența sa de nucleotide caracteristică, adică anumite nucleotide ocupă locuri strict definite în el, precum și o structură secundară caracteristică. Structura secundară se datorează formării de legături de hidrogen între bazele azotate complementare , rezultând o structură asemănătoare acului de păr. SECIS eucariote conține perechi AG non-canonice , care sunt rare în natură, dar extrem de importante pentru funcționarea normală a SECIS. Deși la eucariote, arhei și bacterii, SECIS are o formă caracteristică în ac de păr, ele nu sunt compatibile între ele, adică aranjamentul nucleotidic caracteristic SECIS eucariotic nu este cel al SECIS arheal.

Au fost create mai multe programe de calculator pentru a căuta elementul SECIS în genom, munca lor se bazează pe căutarea unor secvențe specifice și elemente de structură secundară. Aceste programe au fost folosite pentru a căuta noi selenoproteine ​​[2] .

Elementul SECIS a fost găsit într-o mare varietate de organisme din toate cele trei domenii ale vieții, precum și în virusurile acestora [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] .

Note

1. ↑ Walczak, R; Westhof E., Carbon P., Krol A. Un nou motiv structural ARN în elementul de inserție de selenocisteină al ARNm-urilor selenoproteinei eucariote  //  ARN : jurnal. - 1996. - Vol. 2 , nr. 4 . - P. 367-379 . — PMID 8634917 .
2. ↑ 1 2 Lambert, A; Lescure A., Gautheret D. Un studiu al secvențelor de inserție a selenocisteinei metazoare  (engleză)  // Biochimie : jurnal. - 2002. - Vol. 84 , nr. 9 . - P. 953-959 . - doi : 10.1016/S0300-9084(02)01441-4 . — PMID 12458087 .
3. ↑ Mix H., Lobanov AV, Gladyshev VN Elementele SECIS din regiunile codificatoare ale transcriptelor selenoproteice sunt funcționale la eucariotele superioare  // Nucleic Acids Res  . : jurnal. - 2007. - Vol. 35 , nr. 2 . - P. 414-423 . doi : 10.1093 / nar/gkl1060 . — PMID 17169995 .
4. ↑ Cassago A., Rodrigues EM, Prieto EL, et al. Identificarea selenoproteinelor Leishmania și a elementului SECIS  (engleză)  // Mol. Biochim. parazitol. : jurnal. - 2006. - Vol. 149 , nr. 2 . - P. 128-134 . - doi : 10.1016/j.molbiopara.2006.05.002 . — PMID 16766053 .
5. ↑ Mourier T., Pain A., Barrell B., Griffiths-Jones S. A selenocysteine ​​​​tRNA and SECIS element in Plasmodium falciparum  (neopr.)  // ARN. - 2005. - T. 11 , nr 2 . - S. 119-122 . - doi : 10.1261/rna.7185605 . — PMID 15659354 .
6. ↑ G. V. Kryukov, S. Castellano, S. V. Novoselov, A. V. Lobanov, O. Zehtab, R. Guigó și V. N. Gladyshev. Caracterizarea selenoproteomilor de mamifere  (engleză)  // Știință. - 2003. - Vol. 300 , nr. 5624 . - P. 1439-1443 . - doi : 10.1126/science.1083516 . — PMID 12775843 .
7. ↑ Gregory V. Kryukov și Vadim N. Gladyshev.  Selenoproteomul procariot  // EMBO Rep : jurnal. - 2004. - Vol. 5 , nr. 5 . - P. 538-543 . - doi : 10.1038/sj.embor.7400126 . — PMID 15105824 .
8. ↑ Alain Krol. Motive ARN și complexe ARN-proteine ​​diferite din punct de vedere evolutiv pentru a realiza  sinteza selenoproteinei //  Biochimie : jurnal. - 2002. - Vol. 84 , nr. 8 . - P. 765-774 . - doi : 10.1016/S0300-9084(02)01405-0 . — PMID 12457564 .