Histon deacetilaza 5

Identificatori

HDAC5 ; HD5; NY-CO-9

ID-uri externe

OMIM: 605315 MGI : 1333784 HomoloGene : 3995 IUPHAR : ChEMBL : 2563 GeneCards : HDAC5 Gene

3.5.1.98

ontologie genetică
Funcţie	• activitate corepresoare de transcripţie • activitate histon deacetilazei • legarea protein kinazei C • legarea proteinelor • legarea factorului de transcripție • Activitate histon deacetilazei dependentă de NAD (specifică H3-K14) • legarea ADN-ului regiunii reglatoare a transcripției • legarea ionilor metalici • Activitatea histon deacetilazei dependentă de NAD (H3-K9) specific) • activitate histon deacetilazei dependentă de NAD (specific H4-K16) • reprimarea legării factorului de transcripție • Activitate histon deacetilazei dependentă de NAD (specifică H3-K18)
componenta celulara	• complex de histon deacetilază • nucleu • nucleoplasmă • nucleol • citoplasmă • aparat Golgi • citosol • corp nuclear
proces biologic	• reglarea negativă a transcripției din promotorul ARN polimerazei II • dezvoltarea osteoblastelor • organizarea cromatinei • remodelarea cromatinei • tăcere cromatinei • transcripție, model ADN • răspuns inflamator • cale de semnalizare Notch • dezvoltarea inimii • reglarea diferențierii miotubului • reglarea negativă a diferențierii miotubului • modificarea cromatinei • deacetilarea histonelor • diferențierea celulelor B • răspunsul celular la stimulul insulinic • răspunsul organismului multicelular la stres • activarea celulelor B • răspunsul la cocaină • răspunsul la medicamente • reglarea legării proteinelor • reglarea negativă a diferențierii osteoblastelor • reglarea negativă a transcripției, model ADN • reglarea pozitivă a transcripției din ARN promotorul polimerazei II • reglarea dezvoltării fibrelor musculare scheletice • reglarea pozitivă a activității factorului de transcripție de legare a ADN-ului specific secvenței • deacetilarea histonei H3 • deacetilarea histonei H4 • reglarea negativă a migrației celulare implicată în angiogeneza germinativă
Surse: Amigo / QuickGO

Profilul expresiei ARN

Mai multe informatii

ortologii

Vedere

Uman

Mouse

Entrez

RefSeq (ARNm)

RefSeq (proteină)

Locus (UCSC)

Chr 17:
42,15 - 42,2 Mb

Chr 11:
102,19 – 102,23 Mb

Căutați în PubMed

[unu]

[2]

Histone deacetilaza 5 este o enzimă codificată la om de gena HDAC5 [1] [2] [3] .

Funcția

Histonele joacă un rol critic în reglarea transcripției , a ciclului celular și a evenimentelor de dezvoltare. Acetilarea/dezacetilarea histonelor modifică structura cromozomială și afectează accesul factorilor de transcripție la ADN . Proteina codificată de această genă aparține clasei II a familiei histon deacetilază /acuc/Apha. Are capacitatea histon-deacetilazei de a reprima transcripția atunci când este legat de un promotor . De asemenea, interacționează cu proteinele factor-2 de amplificare a miocitelor (MEF2), rezultând în reprimarea genelor dependente de MEF2. Se crede că aceste gene sunt asociate cu cancerul de colon. Pentru această genă au fost găsite două variante de transcrieri care codifică izoforme diferite [3] .

Protein kinaza activată de AMP reglează transportorul de glucoză GLUT4 prin fosforilare la HDAC5 [4] .

HDAC5 este implicat în consolidarea memoriei și sugerează că țintirea HDAC5 [5] ar trebui evitată atunci când se dezvoltă inhibitori HDAC cu o selectivitate mai mare pentru tratamentul bolii Alzheimer .

Interacțiuni

S-a demonstrat că histona deacetilaza 5 interacționează cu:

BCL6 [6] ,
CBX5 [7] ,
GATA1 [8] ,
HDAC3 [9] [10] [11] [12] ,
IKZF1 [13] ,
MEF2A [14] ,
NRIP1 [15] ,
NCOR1 [10] [16] ,
NCOR2 [16] ,
YWHAQ [17] și
ZBTB16 [6] [18] .

Vezi și

Histon deacetilaza

Note

↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Trei proteine definesc o clasă de histon deacetilaze umane legate de drojdia Hda1p // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 1999. - iunie ( vol. 96 , nr. 9 ). - P. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
↑ Scanlan MJ, Chen YT, Williamson B., Gure AO, Stockert E., Gordan JD, Tureci O., Sahin U., Pfreundschuh M., Old LJ Caracterizarea antigenelor umane de cancer de colon recunoscute de anticorpi autologi / / Int J Cancer : jurnal. - 1998. - iunie ( vol. 76 , nr. 5 ). - P. 652-658 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19980529)76:5<652::AID-IJC7>3.0.CO;2-P . — PMID 9610721 .
↑ 1 2 Gena Entrez: HDAC5 histon deacetilaza 5 . (nedefinit)
↑ McGee SL, van Denderen BJ, Howlett KF, Mollica J., Schertzer JD, Kemp BE, Hargreaves M. Protein kinaza activată de AMP reglează transcripția GLUT4 prin fosforilarea histonei deacetilază 5 // Diabet ( jurnal) : jurnal. - 2008. - Vol. 57 , nr. 4 . - P. 860-867 . - doi : 10.2337/db07-0843 . — PMID 18184930 .
↑ Agis-Balboa RC, Pavelka Z., Kerimoglu C., Fischer A. Loss of HDAC5 impairs memory function: implications for Alzheimer's disease // J Alzheimers Dis : jurnal. - 2013. - ianuarie ( vol. 33 , nr. 1 ). - P. 35-44 . - doi : 10.3233/JAD-2012-121009 . — PMID 22914591 .
↑ 1 2 Lemercier C., Brocard MP, Puvion-Dutilleul F., Kao HY, Albagli O., Khochbin S. Clasa II histone deacetylases sunt recrutate direct de represorul transcripțional BCL6 (engleză) // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 24 . - P. 22045-22052 . - doi : 10.1074/jbc.M201736200 . — PMID 11929873 .
↑ Zhang CL, McKinsey TA, Olson EN Asociația histone deacetilazelor de clasă II cu proteina heterocromatină 1: rol potențial pentru metilarea histonelor în controlul diferențierii musculare // Mol . celulă. Biol. : jurnal. - 2002. - Vol. 22 , nr. 20 . - P. 7302-7312 . - doi : 10.1128/MCB.22.20.7302-7312.2002 . — PMID 12242305 .
↑ Watamoto K., Towatari M., Ozawa Y., Miyata Y., Okamoto M., Abe A., Naoe T., Saito H. Interacțiunea alterată a HDAC5 cu GATA-1 în timpul diferențierii celulelor MEL // Oncogene : jurnal. - 2003. - Vol. 22 , nr. 57 . - P. 9176-9184 . - doi : 10.1038/sj.onc.1206902 . — PMID 14668799 .
↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Trei proteine definesc o clasă de histon deacetilaze umane legate de drojdia Hda1p // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 1999. - Vol. 96 , nr. 9 . - P. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
↑ 1 2 Zhang J., Kalkum M., Chait BT, Roeder RG Complexul corepresor al receptorului nuclear N-CoR-HDAC3 inhibă calea JNK prin subunitatea integrală GPS2 // Mol . celulă : jurnal. - 2002. - Vol. 9 , nr. 3 . - P. 611-623 . - doi : 10.1016/S1097-2765(02)00468-9 . — PMID 11931768 .
↑ Fischle W., Dequiedt F., Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W., Verdin E. Activitatea enzimatică asociată cu HDAC de clasa II este dependentă de un complex multiproteic care conține HDAC3 și SMRT/N- CoR // Mol. celulă : jurnal. - 2002. - Vol. 9 , nr. 1 . - P. 45-57 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00429-4 . — PMID 11804585 .
↑ Grozinger CM, Schreiber SL Reglarea histonei deacetilazei 4 și 5 și a activității transcripționale prin localizare celulară dependentă de 14-3-3 // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2000. - Vol. 97 , nr. 14 . - P. 7835-7840 . - doi : 10.1073/pnas.140199597 . — PMID 10869435 .
↑ Koipally J., Georgopoulos K. A molecular dissection of the repression circuity of Ikaros // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 31 . - P. 27697-27705 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
↑ Lemercier C., Verdel A., Galloo B., Curtet S., Brocard MP, Khochbin S. mHDA1/HDAC5 histon deacetilaza interacționează cu și reprimă activitatea transcripțională MEF2A // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 20 . - P. 15594-15599 . - doi : 10.1074/jbc.M908437199 . — PMID 10748098 .
↑ Castet A., Boulahtouf A., Versini G., Bonnet S., Augereau P., Vignon F., Khochbin S., Jalaguier S., Cavailllès V. Multiple domains of the Receptor-Interacting Protein 140 contribuie la inhibarea transcripției ( engleză) // Acizi nucleici Res. : jurnal. - 2004. - Vol. 32 , nr. 6 . - P. 1957-1966 . doi : 10.1093 / nar/gkh524 . — PMID 15060175 .
↑ 1 2 Huang EY, Zhang J., Miska EA, Guenther MG, Kouzarides T., Lazar MA Corepresorii receptorilor nucleari se asociază cu histon deacetilaze de clasa II într-o cale de represiune independentă de Sin3 (Eng.) // Genes Dev. : jurnal. - 2000. - Vol. 14 , nr. 1 . - P. 45-54 . — PMID 10640275 .
↑ Vega RB, Harrison BC, Meadows E., Roberts CR, Papst PJ, Olson EN, McKinsey TA Protein kinazele C și D mediază hipertrofia cardiacă dependentă de agonist prin exportul nuclear al histonei deacetilază 5 // Mol . celulă. Biol. : jurnal. - 2004. - Vol. 24 , nr. 19 . - P. 8374-8385 . - doi : 10.1128/MCB.24.19.8374-8385.2004 . — PMID 15367659 .
↑ Chauchereau A., Mathieu M., de Saintignon J., Ferreira R., Pritchard LL, Mishal Z., Dejean A., Harel-Bellan A. HDAC4 mediates transcriptional repression by the acute promyelocytic leucemia-associated protein PLZF . ) / / Oncogene : jurnal. - 2004. - Vol. 23 , nr. 54 . - P. 8777-8784 . - doi : 10.1038/sj.onc.1208128 . — PMID 15467736 .

Literatură

Verdin E., Dequiedt F., Kasler HG Class II histon deacetylazes: versatile regulators // Trends Genet . : jurnal. - 2003. - Vol. 19 , nr. 5 . - P. 286-293 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . — PMID 12711221 .
Huang EY; Zhang J; Miska EA; Guenther, M.G.; Kouzarides, T; Lazar, MA Corepresorii receptorilor nucleari se asociază cu histon deacetilaze de clasa II într-o cale de represiune independentă de Sin3 // Genes Dev . : jurnal. - 2000. - Vol. 14 , nr. 1 . - P. 45-54 . — PMID 10640275 .
Lemercier C; Verdel A; Galoo B; Curtet, S; Brocard, deputat; Khochbin, S. mHDA1/HDAC5 histon deacetilaza interacționează cu și reprimă activitatea transcripțională MEF2A // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2000. - Vol. 275 , nr. 20 . - P. 15594-15599 . - doi : 10.1074/jbc.M908437199 . — PMID 10748098 .
Grozinger CM, Schreiber SL Reglarea histonei deacetilazei 4 și 5 și a activității transcripționale prin localizarea celulară dependentă de 14-3-3 (engleză) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2000. - Vol. 97 , nr. 14 . - P. 7835-7840 . - doi : 10.1073/pnas.140199597 . — PMID 10869435 .
Huynh KD, Fischle W., Verdin E., Bardwell VJ BCoR, un nou corepresor implicat în reprimarea BCL-6 // Genes Dev . : jurnal. - 2000. - Vol. 14 , nr. 14 . - P. 1810-1823 . - doi : 10.1101/gad.14.14.1810 . — PMID 10898795 .
Mahlknecht U ; Schnittger S; Ottmann OG; Schoch, C; Mosebach, M; Hidemann, W; Hoelzer, D. Organizarea cromozomală și localizarea genei histonei deacetilazei umane 5 (HDAC5 ) // Biochim. Biophys. Acta : jurnal. - 2000. - Vol. 1493 , nr. 3 . - P. 342-348 . - doi : 10.1016/S0167-4781(00)00191-3 . — PMID 11018260 .
Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN Asociația proteinei de legare la terminalul COOH (CtBP) și represorul transcripției care interacționează cu MEF2 (MITR) contribuie la reprimarea transcripțională a factorului de transcripție MEF2 // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2001. - Vol. 276 , nr. 1 . - P. 35-9 . - doi : 10.1074/jbc.M007364200 . — PMID 11022042 .
McKinsey TA, Zhang CL, Lu J., Olson EN Exportul nuclear dependent de semnal al unei histon deacetilaze reglează diferențierea musculară // Nature . - 2000. - Vol. 408 , nr. 6808 . - P. 106-111 . - doi : 10.1038/35040593 . — PMID 11081517 .
McKinsey TA, Zhang CL, Olson EN Activarea factorului de transcripție factor-2 de amplificare a miocitelor prin legarea 14-3-3 stimulată de protein kinaza dependentă de calciu/calmodulină la histon deacetilază 5 // Proceedings of the National Academy of Sciences of the Statele Unite ale Americii : jurnal. - 2001. - Vol. 97 , nr. 26 . - P. 14400-14405 . - doi : 10.1073/pnas.260501497 . — PMID 11114197 .
Fischle W; Dequiedt F; Fillion M; Hendzel, MJ; Voelter, W; Verdin, E. Activitatea histonă deacetilază HDAC7 umană este asociată cu HDAC3 in vivo // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2001. - Vol. 276 , nr. 38 . - P. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
McKinsey TA, Zhang CL, Olson EN Identificarea unei secvențe de export nucleare sensibile la semnal în histone deacetilaze de clasa II // Mol . celulă. Biol. : jurnal. - 2001. - Vol. 21 , nr. 18 . - P. 6312-6321 . - doi : 10.1128/MCB.21.18.6312-6321.2001 . — PMID 11509672 .
Ozawa Y; Towatari M; Tsuzuki S; Hayakawa, F; Maeda, T; Miyata, Y; Tanimoto, M; Saito, H. Histone deacetilaza 3 se asociază cu și reprimă factorul de transcripție GATA- 2 // Sânge : jurnal. — Societatea Americană de Hematologie, 2001. - Vol. 98 , nr. 7 . - P. 2116-2123 . - doi : 10.1182/sânge.V98.7.2116 . — PMID 11567998 .
Potter GB; Beaudoin GM; Derenzo CL; Zarach, JM; Chen, S.H.; Thompson, CC Gena fără păr mutată în tulburările congenitale de cădere a părului codifică un nou corepresor al receptorului nuclear // Genes Dev . : jurnal. - 2001. - Vol. 15 , nr. 20 . - P. 2687-2701 . - doi : 10.1101/gad.916701 . — PMID 11641275 .
Fischle W; Dequiedt F; Henzel MJ; Guenther, Matthew G; Lazar, Mitchell A; Voelter, Wolfgang; Verdin, Eric. Activitatea enzimatică asociată cu HDAC de clasa II este dependentă de un complex multiproteic care conține HDAC3 și SMRT/N-CoR // Mol . celulă : jurnal. - 2002. - Vol. 9 , nr. 1 . - P. 45-57 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00429-4 . — PMID 11804585 .
Lemercier C; Brocard MP; Puvion-Dutilleul F; Kao, HY; Albagli, O; Khochbin, S. Histone deacetilazele clasa II sunt recrutate direct de represorul transcripțional BCL6 // J. Biol. Chim. : jurnal. - 2002. - Vol. 277 , nr. 24 . - P. 22045-22052 . - doi : 10.1074/jbc.M201736200 . — PMID 11929873 .
Huang Y; Tan M; Gosink M; Wang, KK; Sun, Y. Histone deacetilaza 5 nu este o genă țintă p53, dar supraexpresia sa inhibă creșterea celulelor tumorale și induce apoptoza , Cancer Res . : jurnal. - 2002. - Vol. 62 , nr. 10 . - P. 2913-2922 . — PMID 12019172 .