Haplogrup D (Y-ADN)

Versiunea actuală a paginii nu a fost încă examinată de colaboratori experimentați și poate diferi semnificativ de versiunea revizuită pe 25 octombrie 2020; verificările necesită 19 modificări .
Haplogrupul D
Tip de Y-ADN
Ora de apariție acum 64,7-83 mii de ani [1]
Locația de apariție Africa , Asia [1]
Grup ancestral DE
grupuri surori E
Subcladele D1, D2
Mutații marker CTS3946, CTS4030/Z1605

Haplogrupul D (CTS3946) este un haplogrup ADN al cromozomului Y. Ambele haplogrup D și E conțin polimorfismul unic de nucleotide M168 , care se găsește în toate haplogrupurile, cu excepția A și B (vezi grupul CT ), precum și polimorfismul evenimentului unic YAP , unic pentru haplogrupul DE  , strămoșul comun al lui D și E.

Origine

Haplogrupul D provine dintr-o mutație a haplogrupului DE cromozomial Y , care a apărut la un bărbat care se presupune că a trăit acum 65,2 mii de ani. Durata de viață a strămoșului comun al tuturor purtătorilor vii ai haplogrupului D cromozomial Y este de acum 46,5 mii de ani (datele sunt determinate de SNP de către compania YFull [2] ).

Chris Tyler-Smith și colegii săi cred că haplogrupul D s-a format în Africa cu aproximativ 73 de mii de ani în urmă. n., iar în urmă cu aproximativ 71 de mii de ani, linia vest-africană D0 s-a despărțit [1] . Atât haplogrupul D, cât și haplogrupul E conțin caracteristica unui polimorfism unic al evenimentului YAP , dar prezintă o origine comună. Subclada haplogrupului D1-M174 a apărut, cu o mare probabilitate, în Asia, cu aproximativ 60 de mii de ani în urmă. Subclada haplogrupului D1-M174 nu se găsește în afara Asiei. Haplogrupul D2 a fost găsit nesemnificativ în Africa și Asia Mică [3] .

Potrivit lui T. Karafet , haplogrupul D a apărut în Asia cu aproximativ 60 de mii de ani în urmă [4] [5] .

Paleogenetica

Prezentare generală

În prezent, se găsește cu mare frecvență în rândul populației din Tibet , arhipelagul japonez [10] și Insulele Andaman , însă, din cauza unor circumstanțe necunoscute, nu a fost încă găsit în peninsula Hindustan . Ainu din Japonia, precum și popoarele Jarawa și Onge din Insulele Andaman, au aproape exclusiv acest haplogrup, deși ainui, pe lângă haplogrupul D1a2 (81,3% [11] ), au și un haplogrup cromozomial Y C3. cu o frecvență de aproximativ 15% .

De asemenea, haplogrupul cromozomial Y a fost găsit cu frecvență scăzută sau moderată în rândul popoarelor din Asia Centrală și din nordul Asiei de Est, precum și printre chinezii Han și popoarele Miao-Yao din China și unele minorități naționale ale chinezilor. provinciile Sichuan și Yunnan , care vorbesc limbi tibeto-birmane și trăiesc în imediata apropiere a tibetanilor. Subclada D1a1a-M15 identificată în populația poporului Yi ( Prefectura Autonomă Liangshan Yi ) a fost o ramificare a expansiunii grupurilor tibetane de la vest la est pe platou [12] .

Spre deosebire de Haplogrupul C , Haplogrupul D nu a migrat din Asia prin Beringia în Lumea Nouă .

Haplogrupul D este de asemenea remarcabil pentru diferențierea sa geografică excepțională, atunci când o anumită subclasă a haplogrupului este clar localizată în orice populație în care un procent mare de indivizi au haplogrup D:

Aceasta, aparent, diversificarea antică a haplogrupului D sugerează că ar trebui mai degrabă caracterizată ca un „superhaplogrup”, „macrohaplogrup”.

Deosebit de caracteristice sunt exemplele de haplogrup D din populația insulelor japoneze, deoarece acestea conțin un complex de cel puțin cinci mutații separate, caracteristice haplogrupului D, care le deosebește clar de haplogrupul D găsit la locuitorii din Tibet și Insulele Andaman. . Acest fapt este o dovadă că haplogrupul D1a2 a fost un haplogrup modal al culturii preistorice Jomon din insulele japoneze.

Subclase

Arbore filogenetic

ISOGG (versiunea: 14.151) [13] .

Note

  1. ↑ 1 2 3 4 Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciere, Elena; asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L.; Haber, Marc. Un haplogrup cromozomal Y african rar cu rădăcini adânci D0 și implicațiile sale pentru expansiunea oamenilor moderni din Africa  //  Genetica: jurnal. - 2019. - 13 iunie. - P. genetica.302368.2019 . — ISSN 0016-6731 . - doi : 10.1534/genetics.119.302368 . — PMID 31196864 .
  2. ↑ DYTree . Preluat la 30 martie 2018. Arhivat din original la 31 august 2019.
  3. ↑ 1 2 Estes, Roberta Descoperiri interesante ale haplogrupului D ADN-ului Y!  (engleză) . DNAeXplained - Genealogie genetică (21 iunie 2019). Preluat la 8 iulie 2019. Arhivat din original la 6 iulie 2019.
  4. ↑ Shi și colab. (2008) Dovada cromozomului Y a celei mai vechi așezări umane moderne în Asia de Est și originile multiple ale populațiilor tibetane și japoneze Arhivat la 31 martie 2010 la Wayback Machine , BMC Biology
  5. ↑ Tatiana M. Karafet și colab. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromozomal Haplogroup Tree, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
  6. ↑ Hugh McColl și colab. Genomica antică dezvăluie patru valuri de migrație preistorice în Asia de Sud-Est , 2018
  7. ↑ POB-162 Fenotipul și filogenia vânătorilor-culegători japonezi din Neolitic, poporul Jomon, bazat pe secvențe întregi ale genomului nuclear // SMBE 2018 Arhivat 7 iulie 2018 la Wayback Machine
  8. ↑ 1 2 Chuan-Chao Wang și colab. Perspective genomice asupra formării populațiilor umane în Asia de Est Arhivată la 31 iulie 2021 la Wayback Machine (Tabele suplimentare // Tabel 1. Indivizi antici recent raportați), 2021
  9. ↑ Eugenia Boulygina și colab. Diversitatea mitocondrială și a cromozomilor Y a culturii preistorice Koban din Caucazul de Nord , 2020
  10. ↑ Michael F. Hammer, Tatiana M. Karafet, Hwayong Park, Keiichi Omoto, Shinji Harihara, Mark Stoneking și Satoshi Horai, „Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes”, Journal of Human Genetics Volume 51, Numărul 1 / ianuarie 2006.
  11. ↑ Yusuke Watanabe, Izumi Naka, Seik-Soon Khor, Hiromi Sawai, Yuki Hitomi, Katsushi Tokunaga, Jun Ohashi Analiza secvențelor întregi de cromozomi Y dezvăluie istoria populației japoneze în perioada Jomon Arhivată la 30 septembrie 2019 la Wayback Machine , 2019
  12. ↑ Fei Wang, Feng Song, Mengyuan Song, Jienan Li, Mingkun Xie, Yiping Hou . Reconstrucție genetică și analiză filogenetică de către 193 Y-SNP și 27 Y-STR într-un grup etnic chinez Yi Arhivat la 16 iulie 2021 la Wayback Machine , 28 aprilie 2021
  13. ↑ Y-DNA Haplogroup D și subcladele sale - 2019 . Preluat la 6 septembrie 2019. Arhivat din original pe 11 octombrie 2019.
  14. ↑ 1 2 3 Hammer MF, Karafet TM, Park H și colab. (2006). „Originile duble ale japonezilor: un punct comun pentru cromozomii Y vânători-culegători și fermieri”. J. Hum. Genet. 51(1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082 .
  15. ↑ DYTree . www.yfull.com _ Preluat la 3 septembrie 2019. Arhivat din original la 31 august 2019.
  16. ↑ Y-DNA Haplogroup D și subcladele sale - 2014 . Preluat la 11 septembrie 2017. Arhivat din original la 28 mai 2017.

Literatură

Vezi și

Arborele evolutival haplogrupurilor de cromozomi Y umani
Adam cromozomial Y
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   CT
DE   CF
D   E C F
F1 F2 F3     GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
eu J LT(K1) K2
L(K1a)   T(K1b)       K2a/K2a1/ NU /NO1 K2b
N O   K2b1     P(K2b2) /P1  
  S(K2b1a) M(K2b1b) Q R  

Link -uri