Haplogrup DE

Haplogrupul DE  este un haplogrup Y-cromozomial uman . Este determinată de mutațiile polimorfismului cu o singură nucleotidă M1(YAP), M145(P205), M203, P144, P153, P165, P167, P183 [5] .

Este cunoscut datorită polimorfismului unic al evenimentului care îl definește,  inserția YAP . Această mutație a apărut atunci când o copie a ADN-ului lui Alu a adăugat o copie la cromozomul Y. Astfel, cromozomii Y care conțin mutația YAP se numesc YAP+ și nu conțin - YAP-.

Aspect

Ea provine dintr-o mutație a haplogrupului CT care a apărut la un bărbat care a trăit cu aproximativ 68,5 mii de ani în urmă (data este determinată de SNP-uri de YFull [6] ).

Conform unei versiuni, haplogrupul DE și YAP+ au apărut în Africa [7] . Acest lucru este confirmat de faptul că:

1. În Africa, YAP are cea mai mare distribuție (peste 80%).
2. DE conține două subgrupuri care nu se suprapun filogenetic sau geografic.
3. Haplogrupul C a apărut cam în același timp cu DE undeva în Asia și nu există dovezi, inclusiv dovezi arheologice, ale migrațiilor popoarelor din Asia în Africa în acea epocă.

Potrivit unei alte versiuni, YAP+ vine din Asia. Acest lucru este susținut de următoarele argumente:

1. Având în vedere prezența YAP în purtătorii de haplogrup D din nord-estul Indiei și Insulele Andaman , se poate presupune că în Asia de Sud unii dintre cromozomii M168 au condus la adăugarea YAP și a mutației M174 [4] .
2. Haplogrupul CT , din care derivă DE, este de origine non-africană [8] .
3. Există dovezi ale unor mișcări ceva mai târziu ale cromozomilor din Asia în Africa.

În 2016, Poznick și Underhill au arătat că haplogrupul E cromozomial Y își are originea în afara Africii, iar strămoșul comun al tuturor liniilor non-africane (TMRCA), inclusiv haplogrupurile DE și CF , a trăit în urmă cu aproximativ 76 de mii de ani [9] . Împărțirea haplogrupului DE în subcladele D și E a avut loc acum 69,0 ± 14,7 mii de ani. n., sosirea purtătorilor haplogrupului E în Africa a avut loc acum 65,5 ± 8,5 mii de ani [10] .

Chris Tyler-Smith și colegii săi cred că liniile DE și CF au divergen 77 de mii de litri. n. (pe baza unei rate de mutație de 0,76×10-9 per pereche de nucleotide pe an) [11] .

Distribuția etnogeografică

Până acum, nu a fost găsit un singur reprezentant în viață al paragrupului DE . 5 eșantioane găsite de la nigerieni s -au dovedit a fi de fapt o subcladă rară a haplogrupului D2 (A5580.2) [12] . Același lucru este valabil și pentru un eșantion din poporul Nalu din Guineea-Bissau [13] . Doi reprezentanți în Tibet [14] s-au dovedit a fi de fapt o subcladă D-M174, precum și un eșantion din Republica Altai din Beshpeltir [15] .

Arborele

Arbore filogenetic YCC 2008 [16] .

• DE (YAP, M145 [P205], M203, P144, P153, P165, P167, P183)
  • DE*
  • D (M174, (021355))
  • E (SRY4064, M96, P29, P150, P152, P154, P155, P156, P162)

Note

1. ↑ Karafet și colab. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromozomal Haplogroup Tree Arhivat 7 iunie 2008 la Wayback Machine , Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
2. ↑ Genomul siberian al paleoliticului superior dezvăluie descendența dublă a nativilor americani , Nature 505, 87–91 (02 ianuarie 2014)
3. ↑ Underhill. Cazul pentru o origine africană, mai degrabă decât cea asiatică, a inserției YAP a cromozomului Y uman // Perspective genetice, lingvistice și arheologice asupra diversității umane în Asia de Sud-Est  (engleză) . - 2001. - ISBN 9810247842 .
4. ↑ 1 2 Chandrasekar și colab. (2007), semnătură de inserare YAP în Asia de Sud Arhivat 7 noiembrie 2017 la Wayback Machine , 1: Ann Hum Biol. 2007 sept-oct;34(5):582-6.
5. ↑ Pagina web de referință ISOGG. . Consultat la 7 iulie 2009. Arhivat din original la 20 mai 2011. (nedefinit)
6. ↑ D.E. YTree . Preluat la 23 iulie 2016. Arhivat din original la 18 august 2016. (nedefinit)
7. ↑ Stone, Linda. Călătorii, expansiuni umane preistorice // Gene, cultură și evoluție umană  (neopr.) . — 2007.
8. ↑ Chuan-Chao Wang , Li Hui . Comparație între datarea liniei cromozomiale Y folosind rate de mutații Y-STR evolutive sau genealogice , bioRxiv postat online la 3 mai 2014
9. ↑ Posnik GD și colab. (2016) Explozii punctuate în demografia masculină umană deduse din 1.244 de secvențe ale cromozomilor Y din întreaga lume Arhivat 28 mai 2017 la Wayback Machine , Nature Genetics, 48, 593–599 .
10. ↑ Vicente M Cabrera și colab. Purtătorii de linii de bază macrohaplogrup L3 ADN mitocondrial au migrat înapoi în Africa din Asia cu aproximativ 70.000 de ani în urmă Arhivat 14 ianuarie 2018 la Wayback Machine , 13 decembrie 2017
11. ↑ Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciere, Elena; asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L.; Haber, Marc. Un haplogrup cromozomal Y african rar cu rădăcini adânci D0 și implicațiile sale pentru expansiunea oamenilor moderni din Africa  //  Genetica: jurnal. - 2019. - 13 iunie. - P. genetica.302368.2019 . — ISSN 0016-6731 . - doi : 10.1534/genetics.119.302368 . — PMID 31196864 .
12. ↑ Weale și colab. (2003), Rare Deep-Rooting Y Chromosome Lineages in Humans: Lessons for Phylogeography Arhivat 5 mai 2009 la Wayback Machine , Genetics, Vol. 165, 229-234
13. ↑ Rosa și colab. (2007), Diversitatea cromozomială Y în populația Guineei-Bissau: o perspectivă multietnică , BMC Evolutionary Biology vol . 7: 124, doi : 10.1186/1471-2148-7-124 , < http://www.biomedcentral. com/content/pdf/1471-2148-7-124.pdf > Arhivat 30 mai 2009 la Wayback Machine 
14. ↑ Shi și colab. (2008) Dovada cromozomului Y a celei mai vechi așezări umane moderne în Asia de Est și originile multiple ale populațiilor tibetane și japoneze Arhivat la 31 martie 2010 la Wayback Machine , BMC Biology
15. ↑ Harkov și colab. (2007)
16. ↑ Karafet și colab. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromozomal Haplogroup Tree Arhivat 7 iunie 2008 la Wayback Machine , Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008