represor al lactozei | |
---|---|
Identificatori | |
Simbol | LacI |
Pfam | PF00356 |
Structuri proteice disponibile | |
Pfam | structurilor |
PDB | RCSB PDB ; PDBe ; PDBj |
PDBsum | Model 3D |
Fișiere media la Wikimedia Commons |
Represorul de lactoză ( ing. Lac represor ) este o proteină care leagă ADN-ul care inhibă expresia genelor care codifică proteine ale operonului lactoză . Codificat de gena lacI . Proteinele operonului de lactoză sunt implicate în metabolismul lactozei în celulele bacteriene . Aceste gene sunt reglate în jos atunci când lactoza nu este disponibilă pentru celule, asigurându-se că celula bacteriană nu irosește energie sintetizând proteinele care metabolizează lactoza în absența lactozei . Când lactoza devine disponibilă, aceasta este convertită în alolactoză , care inhibă capacitatea represorului de lactoză de a se lega de ADN. Când represorul nu este asociat cu operatorul operon al lactozei, începe transcripția acestuia și sinteza ulterioară a enzimelor de metabolism al lactozei [1] .
Represorul de lactoză ( lac -represor) al Escherichia coli este un homotetramer cu o masă de 154.520 daltoni . Fiecare dintre cei patru monomeri conţine 360 de resturi de aminoacizi şi constă dintr -un domeniu N-terminal , o regiune balama sau linker, un domeniu de legare a zahărului şi un domeniu C-terminal . Domeniul N-terminal conține motivul structural „helix-turn-helix” , care este responsabil pentru interacțiunea cu operatorul. Acest motiv este format din două elice α (reziduuri de aminoacizi 6–25). Domeniul N-terminal este un domeniu globular mic, compact, cu un miez hidrofob bine definit , care este format din trei elice α. Linkerul sau regiunea balama (reziduurile 46-62) conectează domeniul N-terminal de legare la ADN la partea de legare a zahărului (nucleul) a represorului. Se crede că această regiune nu are o structură secundară pronunțată și constă din elice împrăștiate; totuși, în prezența ADN-ului, ea este ordonată și formează un α-helix, care interacționează cu operatorul și orientează domeniul de legare la ADN al represorul lac într - un anumit fel. Miezul represor, sau domeniul de legare a zahărului, este format din două subdomenii. Structura spațială a subdomeniilor este foarte asemănătoare, deși există puține similarități între ele în compoziția reziduurilor de aminoacizi. Fiecare subdomeniu conține 6 foi β paralele , cuprinse între patru elice α. Domeniul C-terminal este responsabil pentru asamblarea tetramerului [1] .
Represorul lactozei este un tetramer neobișnuit. Monomerii săi formează dimeri stabili . Această interacțiune este asigurată de cinci grupuri de aminoacizi. Dimerii, la rândul lor, se pot combina pentru a forma tetrameri datorită interacțiunii elice alfa C-terminale (reziduuri 340-357). Fiecare helix conține două secțiuni, constând din șapte reziduuri de leucină , care asigură interacțiunea celor patru elice alfa. Tetramerii represorului de lactoză sunt considerați mai corect ca dimeri ai dimerilor, deoarece nu au simetria caracteristică altor proteine oligomerice . Sunt dimerii care se leagă de ADN, adică fiecare tetramer al represorului de lactoză poate fi asociat cu doi operatori [1] .
După cum s-a menționat mai sus, legarea represorului de lactoză de ADN are loc prin motivul structural N-terminal helix-turn-helix, care se leagă de canalul major ADN . În plus, regiunile balamale se leagă de ADN. Legarea are loc datorită interacțiunii elicelor ordonate ale regiunilor balama și șanțul minor al ADN-ului [2] . Deoarece fiecare tetramer poate lega doi operatori în același timp, legarea mai multor secvențe de operatori de către un tetramer determină bucla ADN [3] . Legarea represorului de ADN crește afinitatea ARN polimerazei pentru promotor într-o asemenea măsură încât acesta nu îl poate părăsi și, prin urmare, alungirea transcripției genelor operonului lactozei nu poate începe. În prezența lactozei, alolactoza se leagă de represorul lac , modificându-și alosteric structura spațială, astfel încât represorul nu poate să se lege ferm de operator. În studiile in vitro , izopropil-β-D-1-tiogalactopiranozida (IPTG) este adesea folosită ca substanță care imită acțiunea alolactozei [1] .
Represorul de lactoză a fost izolat pentru prima dată Walter Gilbert și Benno Müller-Hill 1966 . Acest lucru s-a întâmplat la un an după ce Jacques Monod și François Jacob , care au descris operonul de lactoză, au primit Premiul Nobel pentru Fiziologie sau Medicină pentru cercetările lor în reglarea expresiei genelor. Gilbert și Muller-Hill au reușit să arate în condiții in vitro că proteina se leagă de ADN-ul care conține operonul de lactoză și se disociază de ADN atunci când este adăugat IPTG. De asemenea, au izolat porțiunea de ADN asociată cu proteina folosind enzima dezoxiribonucleaza , care scindează ADN-ul. După tratamentul complexului represor-ADN cu această enzimă, unele molecule de ADN au rămas neclivate; s-a sugerat că erau protejați de represor de acțiunea enzimei, ceea ce a fost confirmat ulterior. Aceste experimente au confirmat mecanismul operonului de lactoză propus anterior de Monod și Jacob [4] [1] .
Transcriere (biologie) | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Reglementarea transcripției |
| ||||||||||||
Activare | |||||||||||||
Iniţiere | Site de începere a transcripției | ||||||||||||
Elongaţie |
| ||||||||||||
Încetarea |