Cod de bare ADN

Versiunea actuală a paginii nu a fost încă examinată de colaboratori experimentați și poate diferi semnificativ de versiunea revizuită pe 4 mai 2020; verificările necesită 2 modificări .

Codul de bare ADN (Codul de bare ADN, cod de bare genetic, cod de bare ADN, ing.  Codul de bare ADN ) este o metodă de identificare moleculară care permite markerilor genetici scurti din ADN să determine dacă un organism aparține unui anumit taxon [1] . Spre deosebire de metodele de filogenetică moleculară , codul de bare ADN este folosit pentru a determina locul unui anumit organism într-o clasificare deja existentă și nu pentru a construi arbori filogenetici și a completa o clasificare existentă [2] , deci problema utilizării codului de bare ADN pentru a identifica speciile unui nou organism este controversată [3] . Locul cel mai frecvent utilizat pentru codarea genetică de bare la animale este regiunea de aproximativ 600 bp a genei citocrom oxidazei I mitocondriale .

Aplicarea codurilor de bare ADN se extinde la sarcini precum, de exemplu, identificarea unei plante numai după frunze (de exemplu, dacă florile sau fructele nu sunt disponibile), identificarea larvelor de insecte (care pot avea mai puține caracteristici de diagnosticare decât adulții și sunt adesea mai puțin studiat) , determinarea dietei animalelor prin conținutul stomacului sau al fecalelor și mai mult [2] [4] .

Selectarea locului

Lociurile pentru codurile de bare ADN ar trebui:

• reprezintă secțiuni nu foarte lungi de ADN ;
• să fie prezent la majoritatea reprezentanților taxonilor considerați și să conțină în același timp un număr mic de variații la reprezentanții aceleiași specii [5] ;
• destul de ușor de secvențial folosind tehnologii moderne de secvențiere fără utilizarea unor primeri specifici [6] [7] .

Sunt propuși diferiți loci pentru diferiți taxoni, selecția acestor loci este efectuată de comitete speciale. Folosit oficial în prezent:

• Pentru animale și multe alte eucariote , gena citocrom oxidazei  mitocondriale ;
• Pentru plante, concatenarea genelor de cloroplast rbcL și matK (cu toate acestea, acești loci oferă o rezoluție scăzută pentru identificarea plantelor terestre [8] , astfel încât acestea încearcă să găsească un înlocuitor [9] );
• Pentru ciuperci , este un distanțier transcris  intern (ITS) [10] .

ADN mitocondrial

Secvențele de ADN mitocondrial (mtDNA) atrag atenția oamenilor ca țintă pentru codurile de bare ADN din mai multe motive:

• Practic, toate celulele eucariote conțin mitocondrii care poartă genomul mitocondrial . Excepție fac o serie de forme parazitare unicelulare , precum Trachipleistophora , Entamoeba , Giardia , în care a avut loc degradarea secundară a mitocondriilor. Cu toate acestea, organele rudimentare se găsesc în celulele acestor organisme , care sunt rămășițele mitocondriilor cândva funcționale [11] [12] .
• ADN-ul mitocondrial al animalelor se caracterizează printr-o rată relativ mare de acumulare a mutațiilor , ceea ce duce la formarea de diferențe în secvența genelor mitocondriale între populații și în cadrul populațiilor pe perioade de timp relativ scurte (în termeni evolutivi ), de ordinul mii de generații.
• Mitocondriile sunt moștenite matern , astfel încât dimensiunea efectivă a populației în acest caz este proporțională cu numărul de femele reproducătoare, în timp ce pentru genomul nuclear această cifră este de două ori mai mare decât numărul tuturor indivizilor reproducători din populație (deoarece fiecare individ conține două copii ale genomului). Dimensiunea efectivă redusă a populației duce la o selecție mai rapidă a liniilor de gene mtDNA în interiorul și între populații datorită diferențelor în fecunditatea indivizilor (principiul coalescenței ).

Combinația dintre acumularea rapidă a mutațiilor și selecția rapidă duce la faptul că secvențele de ADN mitocondrial diferă relativ slab în cadrul unei specii și relativ puternic între specii, ceea ce este necesar pentru codarea de bare eficientă. Locul ADNmt cel mai frecvent utilizat pentru codarea de bare este regiunea de 658 bp a genei subunității I a citocromului c oxidazei mitocondriale (COI) (așa-numita regiune Folmer) [1] .

Diferențele dintre secvențele de ADNmt nu pot fi o măsură obiectivă a apartenenței organismelor la aceeași specie sau la diferite specii într-un număr de situații care duc la o creștere a diversității secvenței în cadrul unei specii:

• În cazul prezenței actelor de recombinare (recombinarea directă a ADNmt a fost demonstrată pentru un număr de moluște bivalve , de exemplu, genul Mytilus [13] );
• În cazul hibridizării (prezentat pentru iepuri de câmp din genul Lepus ) [14] ;
• Dacă există mai multe linii de ADNmt în cadrul speciei care ies în evidență în cadrul aceleiași populații;
• În prezența endosimbioților care ucid în mod selectiv bărbații [15] ;
• În prezența simbioților intracelulari, ceea ce duce la incompatibilitatea citoplasmei în timpul fertilizării , ceea ce este foarte tipic, de exemplu, pentru insecte (se crede că de la 15 la 75% din toate speciile de insecte sunt infectate cu bacterii din genul Wolbachia ) [ 16] [17] .

Alegerea locului pentru codurile de bare ale plantelor terestre

O serie de cercetători [2] consideră că utilizarea locusului COI pentru a identifica majoritatea speciilor din plante este inaplicabilă, deoarece rata de evoluție a genei citocromului c oxidazei la plantele superioare este mult mai mică decât la animale. Pentru a găsi un loc mai potrivit pentru utilizarea în codurile de bare ADN în genomul angiospermelor , care reprezintă cel mai numeros grup de plante superioare (terestre) , au fost efectuate mai multe studii. Ca candidați, secvențele distanțierului intern transcris nuclear (ITS) ale distanțierului plastidului dintre genele trnH și psbA [2] , precum și gena plastidiană matK , care codifică enzima splicing -ului intronului din cloroplaste. [7] , au fost propuse .

În 2009, un grup mare de specialiști în codificarea ADN-ului plantelor a propus utilizarea unei combinații de rbcL și matK  , două gene codificate în genomul cloroplastei [6] . Pentru o mai bună rezoluție a speciilor, se propune adăugarea distanțierului nuclear ITS2 la acești loci [18] . Începând cu 2015, căutarea locilor adecvați continuă, în special, locusul genei cloroplastei ycf1 a fost prezentat ca un candidat promițător pentru utilizarea în identificarea plantelor folosind coduri de bare [8] .

Folosind

Definiţia birds

În încercarea de a găsi o potrivire între limitele speciilor determinate folosind taxonomia convențională și cele identificate folosind codul de bare ADN, Paul Gebert și colegii au codificat 260 de specii de păsări (mai mult de o treime din toate speciile de reproducere din America de Nord ). Ca rezultat, s-a constatat că toate secvențele genelor COI au fost diferite între specii, în timp ce în cadrul speciilor (130 de specii au fost reprezentate de două sau mai multe probe), nu au existat diferențe sau diferențe nesemnificative în secvența COI. În medie, secvențele au diferit cu 7,93% între specii și cu 0,43% în cadrul speciilor [19] .

În patru cazuri, a fost observată o diferență neobișnuit de mare între secvențele de loci în cadrul speciei, ceea ce a dat motive să presupunem prezența unor noi specii. Interesant este că în trei din patru cazuri, unii taxonomiști au împărțit deja o astfel de specie politipică în două. Datele lui Gebert și colab. susțin această separare și, de asemenea, demonstrează în general eficiența utilizării codurilor de bare ADN pentru a determina speciile de păsări. În plus, autorii au propus un prag universal, pe care își propun să-l folosească atunci când identifică noi specii: se propune să se considere astfel de grupuri de indivizi ca specii diferite, diferența medie între secvențele loci de coduri de bare a cărora este de zece ori mai mare decât diferența intraspecifică medie pentru lotul studiat [19] .

Alte exemple de utilizare a codurilor de bare ADN în taxonomia păsărilor pot fi studiul speciilor cu o gamă largă și variabilitate morfologică intraspecifică ridicată, care s-a realizat pe exemplul bufniței [20] , precum și reorganizarea grupelor. cu relații interne neclare, cum ar fi familia Thymeliaceae [21] .

Definiția fish

Inițiativa Fish Barcode of Life (FISH-BOL) [22] este un proiect de colectare, standardizare și sistematizare a datelor codurilor de bare ADN pentru specimenele de pește care au fost identificate ca fiind valide din punct de vedere taxonomic. Lansată în 2005, începând cu 2016, baza de date conține informații despre secvența locusurilor pentru peste 11.000 de specii de pești, reprezentând aproximativ 35% din biodiversitatea totală a grupului . Pe lângă secvențe, FISH-BOL conține fotografii și coordonatele geografice ale exemplarelor studiate, informații despre distribuția speciilor, nomenclatură și referințe la literatură. Astfel, FISH-BOL duplică și completează foarte mult informațiile disponibile din alte surse precum Catalogul Peștilor și FishBase .

Codul de bare ADN pentru toate speciile de pești poate fi util din mai multe motive: va permite identificarea speciilor pentru o gamă largă de oameni, identificarea speciilor necunoscute anterior și identificarea speciilor în situațiile în care metodele tradiționale nu sunt aplicabile. Un exemplu de astfel de situație este analiza filogenetică a grupelor folosind coduri de bare, care poate fi folosită pentru a determina speciile de pești care au provocat boala cigauteru din reziduurile alimentare [23] .

Vizualizări ascunse

Una dintre sarcinile în care codul de bare ADN poate juca un rol important este determinarea granițelor dintre așa-numitele specii criptice sau ascunse. De regulă, acesta este un complex de specii care nu se pot distinge din punct de vedere morfologic; împărțirea unor astfel de complexe în taxoni separati este adesea dificilă.

Codul de bare ADN a fost folosit în mod repetat în studiul speciilor criptice din rezervația Guanacaste din nord-vestul Costa Rica [24] [25] [26] [27] [28] .

Una dintre primele specii latente care a arătat eficacitatea codurilor de bare ADN în separarea sa a fost fluturii neotropici cu cap gras Astraptes fulgerator . Acesta este un complex de specii cu diferențe morfologice implicite și o varietate neobișnuit de mare de plante alimentare în omizile lor. Analiza rezultatelor secvențierii genei COI de la 484 de organisme înrudite morfologic cu A. fulgerator a provocat controverse: în 2004, autorii au sugerat că A. fulgerator este format din cel puțin 10 specii [24] ; în 2006, aceleași secvențe au fost reanalizate folosind bootstrap vecin joining , analiză de agregare a populației [29] și analiza haplotipului cladistic , s-a obținut o divizare în 3 (maximum 7) clade, iar lucrările anterioare au fost criticate [25] . Astfel de diferențe au arătat că interpretarea rezultatelor obținute prin codarea de bare ADN depinde de alegerea metodelor analitice, iar diferențierea speciilor latente folosind coduri de bare ADN poate fi la fel de subiectivă ca și alte forme de taxonomie.

Alte exemple de specii din Rezervația Guanacaste care au demonstrat eficacitatea metodei codurilor de bare ADN sunt studiul și identificarea omizilor tropicale [26] , precum și taxonizarea muștelor parazitare Belvosia [en] ( Tachinidae ) din omizi [ 27] ] [28] .

Cu toate acestea, o altă familie de muște înrudite, Calliphoridae , din genul Protocalliphora nu a reușit să separe ADN-ul prin coduri de bare: a fost investigată eficiența utilizării codurilor de bare pentru a separa muștele din genul Protocalliphora , despre care se știe că sunt infectate cu bacteria endosimbiotică Wolbachia . . Împărțirea în taxoni a fost imposibilă pentru 60% dintre specii, iar la identificarea unor noi specii, eroarea în estimarea numărului de specii din gen ar putea fi de 75%. Se presupune că acest rezultat s-a datorat lipsei de monofileticitate a speciilor la nivel mitocondrial (de exemplu, într-un caz, 4 specii diferite au avut aceleași coduri de bare), lipsa monofiliei intraspecifice se poate datora hibridizării interspecifice asociate cu infecția cu Wolbachia . Wolbachia este un endosimbiont între 15% și 75% din speciile de insecte, ceea ce face ca identificarea la nivel de specie bazată pe secvența mitocondrială să nu fie posibilă pentru multe insecte [16] .

Clasificarea organismelor fosile

Posibilitatea utilizării codurilor de bare ADN pentru a evalua diversitatea istorică a biotei Pământului a fost evaluată folosind exemplul unui grup de ratite dispărute, moa . Cele 10 specii de moa identificate prin coduri de bare pentru gena citocrom oxidazei din oasele moa subfosile au corespuns speciilor cunoscute anterior, cu o singură excepție, care poate reprezenta un grup de specii neidentificat anterior. Folosind un prag standard de 2,7% varianță intraspecifică, 6 specii au fost găsite pe aceleași date, totuși, având în vedere ratele lente de creștere și reproducere ale moasului, există posibilitatea ca variația intraspecifică să fie destul de scăzută, drept urmare autorii au luat un prag de 1,24%. Pe de altă parte, nu există o valoare prag stabilită la care să se poată considera că populațiile au început ireversibil să sufere procesul de speciație [30] .

Critica

Codul de bare ADN s-a întâlnit cu reacții mixte din partea oamenilor de știință, în special a taxonomiștilor, variind de la aprobarea entuziastă până la opoziția vocală [31] [32] .

S-a sugerat că unele specii recent divergente nu pot fi distinse pe baza secvențelor genei COI [33] . În plus, aproximativ 23% dintre speciile de animale sunt polifiletice , presupunând că datele lor mtDNA sunt corecte [34] , adică atribuirea unei specii unui animal folosind codul de bare mtDNA va da un rezultat ambiguu sau inexact în aproximativ 23% din cazuri [35]. ] .

În studiile cu insecte, poate apărea o rată de eroare egală sau chiar mai mare, din cauza lipsei frecvente de corelație între genomul mitocondrial și nuclear sau a lipsei de diferență între distanțele intra și inter-specii pentru genele luate în considerare [36] [16] [37] . Problemele cu ADNmt cauzate de simbioți care induc incompatibilitate citoplasmatică (de exemplu Wolbachia ) sau microorganisme care ucid bărbați sunt, de asemenea, frecvente în rândul insectelor. Având în vedere că insectele reprezintă peste 75% din toate organismele cunoscute [38] , se poate observa că, deși codul de bare mtDNA poate funcționa pentru vertebrate , este posibil să nu fie eficient pentru majoritatea organismelor cunoscute.

Acum se crede că codurile de bare ADN ar trebui folosite alături de instrumentele taxonomice tradiționale și forme alternative de taxonomie moleculară pentru a identifica cazurile problematice și a detecta erorile. Situațiile cu specii non-criptice pot fi de obicei rezolvate fără ambiguitate prin taxonomie convențională sau moleculară. Cu toate acestea, în cazuri mai complexe, doar o combinație de abordări va da rezultatul. În cele din urmă, deoarece o mare parte din biodiversitatea globală rămâne necunoscută, codurile de bare moleculare nu pot decât să sugereze existența unor noi taxoni, dar nu să le izoleze sau să le descrie [39] .

Vezi și

• Filogenetica moleculară
• Amprentarea genetică
• ADN mitocondrial
• Citocrom c oxidaza

Note

1. ↑ 1 2 Hebert PD , Cywinska A. , Ball SL , deWaard JR. Identificări biologice prin coduri de bare ADN.  (engleză)  // Proceedings. Științe biologice / Societatea Regală. - 2003. - Vol. 270, nr. 1512 . - P. 313-321. - doi : 10.1098/rspb.2002.2218 . — PMID 12614582 .
2. ↑ 1 2 3 4 Kress WJ , Wurdack KJ , Zimmer EA , Weigt LA , Janzen DH Utilizarea codurilor de bare ADN pentru a identifica plantele cu flori.  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2005. - Vol. 102, nr. 23 . - P. 8369-8374. - doi : 10.1073/pnas.0503123102 . — PMID 15928076 .
3. ↑ Seberg O. , Petersen G. Câți loci sunt necesare pentru codul de bare ADN unui crocus?  (Engleză)  // Public Library of Science ONE. - 2009. - Vol. 4, nr. 2 . - P. e4598. - doi : 10.1371/journal.pone.0004598 . — PMID 19240801 .
4. ↑ Soininen EM , Valentini A. , Coissac E. , Miquel C. , Gielly L. , Brochmann C. , Brysting AK , Sønstebø JH , Ims RA , Yoccoz NG , Taberlet P. Analiza dietei micilor ierbivore: eficiența codurilor de bare ADN cuplată cu pirosecvențierea de mare performanță pentru descifrarea compoziției amestecurilor complexe de plante.  (engleză)  // Frontiere în zoologie. - 2009. - Vol. 6. - P. 16. - doi : 10.1186/1742-9994-6-16 . — PMID 19695081 .
5. ^ Lahaye R. , van der Bank M. , Bogarin D. , Warner J. , Pupulin F. , Gigot G. , Maurin O. , Duthoit S. , Barraclough TG , Savolainen V. Codurile de bare ADN ale florelor hotspot-urilor biodiversităţii.  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2008. - Vol. 105, nr. 8 . - P. 2923-2928. - doi : 10.1073/pnas.0709936105 . — PMID 18258745 .
6. ↑ 1 2 Un cod de bare ADN pentru plante terestre.  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2009. - Vol. 106, nr. 31 . - P. 12794-12797. - doi : 10.1073/pnas.0905845106 . — PMID 19666622 .
7. ↑ 1 2 Kress WJ , Erickson DL DNA codes: gene, genomics, and bioinformatics.  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2008. - Vol. 105, nr. 8 . - P. 2761-2762. - doi : 10.1073/pnas.0800476105 . — PMID 18287050 .
8. ↑ 1 2 Dong W. , Xu C. , Li C. , Sun J. , Zuo Y. , Shi S. , Cheng T. , Guo J. , Zhou S. ycf1, cel mai promițător cod de bare ADN plastid al plantelor terestre.  (engleză)  // Rapoarte științifice. - 2015. - Vol. 5. - P. 8348. - doi : 10.1038/srep08348 . — PMID 25672218 .
9. ↑ Li DZ , Gao LM , Li HT , Wang H. , Ge XJ , Liu JQ , Chen ZD , Zhou SL , Chen SL , Yang JB , Fu CX , Zeng CX , Yan HF , Zhu YJ , Sun YS , Chen SY , Zhao L. , Wang K. , Yang T. , Duan GW Analiza comparativă a unui set de date mare indică faptul că distanțierul transcris intern (ITS) ar trebui încorporat în codul de bare de bază pentru plantele de semințe.  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2011. - Vol. 108, nr. 49 . - P. 19641-19646. - doi : 10.1073/pnas.1104551108 . — PMID 22100737 .
10. ↑ Schoch CL , Seifert KA , Huhndorf S. , Robert V. , Spouge JL , Levesque CA , Chen W. Nuclear ribosomal internal transcrited spacer (ITS) region as a ADN universal barcode marker for Fungi.  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2012. - Vol. 109, nr. 16 . - P. 6241-6246. - doi : 10.1073/pnas.1117018109 . — PMID 22454494 .
11. ↑ Chan KW , Slotboom DJ , Cox S. , Embley TM , Fabre O. , van der Giezen M. , Harding M. , Horner DS , Kunji ER , León-Avila G. , Tovar J. A roman ADP/ATP transporter in mitozomul parazitului uman microaerofil Entamoeba histolytica.  (Engleză)  // Biologie actuală : CB. - 2005. - Vol. 15, nr. 8 . - P. 737-742. - doi : 10.1016/j.cub.2005.02.068 . — PMID 15854906 .
12. ↑ Williams BA , Hirt RP , Lucocq JM , Embley TM A mitocondrial rest in the microsporidian Trachipleistophora hominis.  (engleză)  // Natură. - 2002. - Vol. 418, nr. 6900 . - P. 865-869. - doi : 10.1038/nature00949 . — PMID 12192407 .
13. ↑ Ladoukakis ED , Zouros E. Dovezi directe pentru recombinarea omoloagă în ADN-ul mitocondrial de midii (Mytilus galloprovincialis).  (Engleză)  // Biologie moleculară și evoluție. - 2001. - Vol. 18, nr. 7 . - P. 1168-1175. — PMID 11420358 .
14. ↑ Melo-Ferreira J. , Boursot P. , Suchentrunk F. , Ferrand N. , Alves PC Invazie din trecutul rece: introgresiune extensivă a ADN-ului mitocondrial de iepure de munte (Lepus timidus) în alte trei specii de iepuri din nordul Iberiei.  (engleză)  // Ecologie moleculară. - 2005. - Vol. 14, nr. 8 . - P. 2459-2464. - doi : 10.1111/j.1365-294X.2005.02599.x . — PMID 15969727 .
15. ↑ Rufus A. Johnstone, Gregory D. D. Hurst. Microorganismele moștenite de la mamă care ucid bărbați pot confunda interpretarea variabilității ADN-ului mitocondrial  //  Biological Journal of the Linnean Society. - 1996-08-01. — Vol. 58 , iss. 4 . - P. 453-470 . — ISSN 1095-8312 . - doi : 10.1111/j.1095-8312.1996.tb01446.x . Arhivat din original la 1 iunie 2016.
16. ↑ 1 2 3 Whitworth TL , Dawson RD , Magalon H. , Baudry E. Codul de bare ADN nu poate identifica în mod fiabil speciile din genul blowfly Protocalliphora (Diptera: Calliphoridae).  (engleză)  // Proceedings. Științe biologice / Societatea Regală. - 2007. - Vol. 274, nr. 1619 . - P. 1731-1739. - doi : 10.1098/rspb.2007.0062 . — PMID 17472911 .
17. ^ Perlman SJ , Kelly SE , Hunter MS Biologia populației a incompatibilității citoplasmatice: menținerea și răspândirea simbioților Cardinium la o viespe parazită.  (engleză)  // Genetică. - 2008. - Vol. 178, nr. 2 . - P. 1003-1011. - doi : 10.1534/genetics.107.083071 . — PMID 18245338 .
18. ↑ Chen S. , Yao H. , Han J. , Liu C. , Song J. , Shi L. , Zhu Y. , Ma X. , Gao T. , Pang X. , Luo K. , Li Y. , Li X. , Jia X. , Lin Y. , Leon C. Validarea regiunii ITS2 ca un nou cod de bare ADN pentru identificarea speciilor de plante medicinale.  (Engleză)  // Public Library of Science ONE. - 2010. - Vol. 5, nr. 1 . - P. e8613. - doi : 10.1371/journal.pone.0008613 . — PMID 20062805 .
19. ↑ 1 2 Hebert PD , Stoeckle MY , Zemlak TS , Francis CM Identificarea păsărilor prin codurile de bare ADN.  (engleză)  // Public Library of Science Biology. - 2004. - Vol. 2, nr. 10 . - P. e312. - doi : 10.1371/journal.pbio.0020312 . — PMID 15455034 .
20. ↑ Nijman V. , Aliabadian M. Codul de bare ADN ca instrument pentru elucidarea delimitării speciilor în specii cu gamă largă, așa cum este ilustrat de bufnițe (Tytonidae și Strigidae).  (engleză)  // Știință zoologică. - 2013. - Vol. 30, nr. 11 . - P. 1005-1009. - doi : 10.2108/zsj.30.1005 . — PMID 24199866 .
21. ↑ Huang ZH , codurile de bare ADN Ke DH și relațiile filogenetice în Timaliidae.  (engleză)  // Genetică și cercetare moleculară : GMR. - 2015. - Vol. 14, nr. 2 . - P. 5943-5949. - doi : 10.4238/2015.Iunie.1.11 . — PMID 26125793 .
22. ↑ Ward RD , Hanner R. , Hebert PD Campania pentru codul de bare ADN tuturor peștilor, FISH-BOL.  (engleză)  // Jurnal de biologie a peștilor. - 2009. - Vol. 74, nr. 2 . - P. 329-356. doi : 10.1111/ j.1095-8649.2008.02080.x . — PMID 20735564 .
23. ↑ Schoelinck C. , Hinsinger DD , Dettaï A. , Cruaud C. , Justine JL O reanaliza filogenetică a grupelor cu aplicații pentru otrăvirea peștilor cu ciguatera.  (Engleză)  // Public Library of Science ONE. - 2014. - Vol. 9, nr. 8 . — P. e98198. - doi : 10.1371/journal.pone.0098198 . — PMID 25093850 .
24. ↑ 1 2 Hebert PD , Penton EH , Burns JM , Janzen DH , Hallwachs W. Zece specii în una: codurile de bare ADN dezvăluie specii criptice în fluturele neotropical skipper Astraptes fulgerator.  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2004. - Vol. 101, nr. 41 . - P. 14812-14817. - doi : 10.1073/pnas.0406166101 . — PMID 15465915 .
25. ↑ 1 2 Andrew VZ Brower. Probleme cu codurile de bare ADN pentru delimitarea speciilor: „Zece specii” de Astraptes fulgerator reevaluate (Lepidoptera: Hesperiidae)  // Sistematică și biodiversitate. - 01-06-2006. - T. 4 , nr. 2 . — S. 127–132 . — ISSN 1477-2000 . - doi : 10.1017/S147720000500191X .
26. ↑ 1 2 Pagina de pornire a bazei de date pentru bazele de date de creștere a omizilor ACG (Lepidoptera) (link în jos) . janzen.sas.upenn.edu. Preluat la 28 aprilie 2016. Arhivat din original la 2 noiembrie 2019. (nedefinit) 
27. ↑ 1 2 Smith MA , Woodley NE , Janzen DH , Hallwachs W. , Codurile de bare ADN Hebert PD dezvăluie specificitatea criptică a gazdei în cadrul presupusilor membri polifagi ai unui gen de muște parazitoide (Diptera: Tachinidae).  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2006. - Vol. 103, nr. 10 . - P. 3657-3662. - doi : 10.1073/pnas.0511318103 . — PMID 16505365 .
28. ↑ 1 2 Smith MA , Wood DM , Janzen DH , Hallwachs W. , Hebert PD Codurile de bare ADN afirmă că 16 specii de muște parazitoide tropicale aparent generaliste (Diptera, Tachinidae) nu sunt toate generaliste.  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2007. - Vol. 104, nr. 12 . - P. 4967-4972. - doi : 10.1073/pnas.0700050104 . — PMID 17360352 .
29. ↑ Jerrold I. Davis, Kevin C. Nixon. Populațiile, variația genetică și delimitarea speciilor filogenetice  //  Biologie sistematică. — 01-12-1992. — Vol. 41 , iss. 4 . — P. 421–435 . — ISSN 1063-5157 . - doi : 10.1093/sysbio/41.4.421 .
30. ↑ Lambert DM , Baker A. , ​​Huynen L. , Haddrath O. , Hebert PD , Millar CD Este posibil un inventar pe scară largă bazat pe ADN al vieții antice?  (engleză)  // Jurnalul eredității. - 2005. - Vol. 96, nr. 3 . - P. 279-284. doi : 10.1093 / jhered/esi035 . — PMID 15731217 .
31. ↑ Rubinoff D. , Cameron S. , Will K. O perspectivă genomică asupra deficiențelor ADN-ului mitocondrial pentru identificarea „codării de bare”.  (engleză)  // Jurnalul eredității. - 2006. - Vol. 97, nr. 6 . - P. 581-594. doi : 10.1093 / jhered/esl036 . — PMID 17135463 .
32. ↑ Malte C. Ebach, Marcelo R. de Carvalho. Anti-intelectualism in DNA Barcoding Enterprise  // Zoologia (Curitiba). - T. 27 , nr. 2 . — S. 165–178 . — ISSN 1984-4670 . - doi : 10.1590/S1984-46702010000200003 . Arhivat din original pe 20 decembrie 2010.
33. ^ Kerr KC , Stoeckle MY , Dove CJ , Weigt LA , Francis CM , Hebert PD Acoperirea completă a codurilor de bare ADN a păsărilor din America de Nord. (Engleză)  // Note de ecologie moleculară. - 2007. - Vol. 7, nr. 4 . - P. 535-543. - doi : 10.1111/j.1471-8286.2007.01670.x . — PMID 18784793 .  
34. ↑ Daniel J. Funk, Kevin E. Omland. Parafilie și polifilie la nivel de specie: frecvență, cauze și consecințe, cu perspective din ADN-ul mitocondrial animal  // Revizuirea anuală a ecologiei, evoluției și sistematicii. - 2003-01-01. - T. 34 , nr. 1 . — S. 397–423 . - doi : 10.1146/annurev.ecolsys.34.011802.132421 .
35. ↑ Meyer CP , Paulay G. Codul de bare ADN: rate de eroare bazate pe eșantionare cuprinzătoare.  (engleză)  // Public Library of Science Biology. - 2005. - Vol. 3, nr. 12 . — P. e422. - doi : 10.1371/journal.pbio.0030422 . — PMID 16336051 .
36. ↑ Hurst GD , Jiggins FM Probleme cu ADN-ul mitocondrial ca marker în studiile populației, filogeografice și filogenetice: efectele simbioților moșteniți.  (engleză)  // Proceedings. Științe biologice / Societatea Regală. - 2005. - Vol. 272, nr. 1572 . - P. 1525-1534. - doi : 10.1098/rspb.2005.3056 . — PMID 16048766 .
37. ↑ Wiemers M. , Fiedler K. Does the DNA barcode gap exist? - un studiu de caz la fluturi albaștri (Lepidoptera: Lycaenidae).  (engleză)  // Frontiere în zoologie. - 2007. - Vol. 4. - P. 8. - doi : 10.1186/1742-9994-4-8 . — PMID 17343734 .
38. ↑ ABRS - Numbers of living species in Australia and the World Report - Excutive Summary (11 septembrie 2007). Consultat la 29 aprilie 2016. Arhivat din original pe 11 septembrie 2007. (nedefinit)
39. ↑ Desalle R. Descoperirea speciilor versus identificarea speciilor în eforturile de codificare a ADN-ului: răspuns la Rubinoff.  (engleză)  // Conservation biology: revista Societății pentru Conservation Biology. - 2006. - Vol. 20, nr. 5 . - P. 1545-1547. - doi : 10.1111/j.1523-1739.2006.00543.x . — PMID 17002772 .