Proiectul genomului uman

Versiunea actuală a paginii nu a fost încă examinată de colaboratori experimentați și poate diferi semnificativ de versiunea revizuită la 6 iulie 2021; verificările necesită 6 modificări .

Proiectul Genomului Uman ( HGP  ) a fost un proiect internațional de cercetare al cărui scop principal a fost de a determina perechile de baze care alcătuiesc ADN -ul uman , precum și de a identifica, cartografi și secvența toate genele genomului uman atât din punct de vedere fizic, cât și din punct de vedere fizic. un punct de vedere funcțional [1] . Acest proiect rămâne cel mai mare proiect biologic internațional întreprins vreodată în biologie [2] . Până în 2003, doar 85% din genomul uman fusese secvențial, proiectul a fost finalizat în 2022, când a fost realizată secvențierea completă a genomului uman.

Proiectul a început în 1990 sub conducerea lui James Watson sub auspiciile Organizației Naționale a Sănătății din SUA . În 2000, a fost lansat un proiect de lucru al structurii genomului, un genom complet în 2003 , cu toate acestea, nici astăzi, analiza suplimentară a unor secțiuni nu a fost încă finalizată. Compania privată Celera Corporation a lansat un proiect paralel similar, finalizat ceva mai devreme decât cel internațional. Cea mai mare parte a secvențierii a fost efectuată la douăzeci de universități și centre de cercetare din SUA, Marea Britanie, Japonia, Franța, Germania și China. [3] Pe lângă importanța sa fundamentală evidentă, determinarea structurii genelor umane este un pas important pentru dezvoltarea de noi medicamente și dezvoltarea altor aspecte ale sănătății publice.

În timp ce scopul proiectului de secvențiere a genomului uman a fost de a înțelege structura genomului speciei umane , proiectul s-a concentrat, de asemenea, pe alte câteva organisme, inclusiv bacterii precum Escherichia coli , insecte precum musca de fructe și mamifere precum șoarecele . .

Inițial, s-a planificat secvențierea celor peste trei miliarde de nucleotide conținute în genomul uman haploid . „Genomul” oricărui individ este unic; cartografierea „genomului uman” a implicat secvențierea unui număr mic de oameni și apoi reasamblarea pentru a obține secvența completă pentru fiecare cromozom. Prin urmare, „genomul uman” finit este un mozaic care nu reprezintă un singur individ. Utilitatea proiectului constă în faptul că marea majoritate a genomului uman este aceeași pentru toți oamenii.

Genomul oricărui organism individual (excluzând gemenii identici și animalele clonate ) este unic, astfel încât secvențierea genomului uman ar trebui să includă, în principiu, secvențierea variațiilor multiple ale fiecărei gene. Totuși, scopul Proiectului Genomului Uman nu a fost de a determina secvența întregului ADN găsit în celulele umane: unele regiuni heterocromatine (aproximativ 8% în total) au rămas nesecvențiate. Abia în aprilie 2022 s-a raportat că o echipă internațională de cercetători a secvențiat ultimii 8% din genomul uman [4]

Proiect

Fundal

Proiectul a fost punctul culminant al lucrului de mai mulți ani susținut de Departamentul de Energie al SUA , în special atelierele desfășurate în 1984 [5] și 1986, și activitățile ulterioare [6] de către Departamentul de Energie [7] . Un raport din 1987 afirmă: „Scopul final al acestui demers este de a înțelege genomul uman” și „Cunoașterea genomului uman este la fel de esențială pentru progresul medicinei și al altor științe ale sănătății, pe cât a fost necesară cunoașterea anatomiei pentru a ajunge la starea sa actuală. " Căutarea tehnologiilor adecvate pentru rezolvarea problemei propuse a început în a doua jumătate a anilor 1980 [8] .

Începând cu 1988, șeful Centrului Național pentru Cercetarea Genomului Uman din cadrul Organizației Naționale a Sănătății din Statele Unite (NIH) a fost James Watson . În 1992, a fost forțat să demisioneze, în principal din cauza dezacordului cu poziția liderului său, Bernadine Healy privind brevetarea genelor . El a fost înlocuit în aprilie 1993 de Francis Collins , iar în 1997 numele centrului a fost schimbat în Institutul Național de Cercetare a Genomului Uman NHGRI

Proiectul de 3 miliarde de dolari a fost lansat oficial în 1990 de Departamentul de Energie al SUA și de National Institutes of Health și era de așteptat să dureze 15 ani. Pe lângă Statele Unite, consorțiul internațional a inclus geneticieni din China , Franța , Germania , Japonia și Regatul Unit .

Datorită cooperării internaționale extinse și a noilor progrese în genomică (în special în secvențiere), precum și a progreselor semnificative în tehnologia de calcul, „proiectul” genomului a fost finalizat în 2000 (care a fost anunțat împreună de președintele american Bill Clinton și prim-ministrul britanic ). Tony Blair 26 iunie 2000 [9] ). Continuarea secvențierii a dus la anunțul în aprilie 2003 de aproape finalizare, cu doi ani mai devreme decât era planificat [10] . În mai 2006, o altă piatră de hotar a fost trecută pe drumul spre finalizarea proiectului, când secvența ultimului cromozom, cromozomul 1 , a fost publicată în revista Nature [11] .

Finalizare

Există numeroase definiții pentru „secvențierea completă a genomului uman”. Potrivit unora dintre ei, genomul a fost deja complet secvențial, iar conform altora, acest lucru nu a fost încă realizat. Au existat multe articole în presa populară care raportau „finalizarea” genomului. În momentul de față, etapa de secvențiere a genomului este în curs de finalizare, adică determinarea ordinii nucleotidelor din lanțurile nucleice ale ADN-ului uman. De fapt, lucrările privind interpretarea rezultatelor secvențierii sunt încă înainte. Aceasta va fi decodificarea sau citirea genomului. Graficul istoric al descifrarii proiectului arată că cea mai mare parte a secvențierii genomului uman a fost finalizată la sfârșitul anului 2003. Cu toate acestea, există încă mai multe regiuni care sunt considerate neterminate:

Majoritatea ADN-ului rămas este foarte repetitiv și este puțin probabil să conțină gene, dar acest lucru va rămâne necunoscut până când vor fi secvențiați complet. Înțelegerea funcțiilor tuturor genelor și a reglării lor rămâne departe de a fi completă. Rolul ADN-ului nedorit , evoluția genomului, diferențele dintre indivizi și multe alte probleme sunt încă subiectul unor cercetări intense în laboratoarele din întreaga lume.

Goluri

Secvența de ADN uman este stocată în baze de date accesibile oricărui utilizator prin Internet . Centrul Național pentru Informații Biotehnologice din SUA (și partenerii săi din Europa și Japonia) mențin secvențele genomice într-o bază de date cunoscută sub numele de GenBank , împreună cu secvențe de gene și proteine ​​​​cunoscute și ipotetice. Alte organizații precum UC Santa Cruz12] Ensembl [ 13] mențin date și adnotări suplimentare, precum și instrumente puternice pentru vizualizarea și căutarea acestor baze de date Au fost dezvoltate programe de calculator pentru analiza datelor deoarece datele în sine sunt aproape imposibil de interpretat fără astfel de programe.

Procesul de identificare a limitelor genelor și a altor motive în secvențele brute de ADN se numește și aparține domeniului bioinformaticii Oamenii fac această muncă cu computere, dar o fac încet și, pentru a îndeplini cerințele de debit mare ale proiectelor de secvențiere a genomului , aici sunt, de asemenea, folosite din ce în ce mai mult programe speciale de calculator. Cele mai bune tehnologii de adnotare din ziua de azi folosesc modele statistice bazate pe paralelele dintre secvențele ADN și limbajul uman , profitând de conceptele informatice precum gramatica formală .

Un alt obiectiv adesea trecut cu vederea al Proiectului Genomului Uman este de a explora implicațiile etice, legale și sociale ale secvențierii genomului. Este important să explorezi aceste probleme și să găsim cele mai potrivite soluții înainte de a deveni un teren propice pentru controverse și probleme politice.

Toți oamenii au, într-o măsură sau alta, secvențe genomice unice. Prin urmare, datele publicate de Human Genome Project nu conțin secvența exactă a genomului fiecărei persoane în parte. Acesta este genomul combinat al unui număr mic de donatori anonimi. Secvența genomică rezultată este baza pentru lucrările viitoare de identificare a diferențelor dintre indivizi. Efortul principal aici se concentrează pe identificarea polimorfismelor cu un singur nucleotide .

Aproape toate obiectivele pe care proiectul și le-a propus au fost atinse mai repede decât se aștepta. Proiectul de secvențiere a genomului uman a fost finalizat cu doi ani mai devreme decât era planificat. Proiectul a stabilit un obiectiv rezonabil, realizabil, de secvențiere a 95% din ADN. Cercetătorii nu numai că au reușit acest lucru, dar și-au depășit propriile predicții și au reușit să secvențeze 99,99% din ADN-ul uman. Proiectul nu numai că a depășit toate obiectivele și standardele dezvoltate anterior, dar continuă și să îmbunătățească rezultatele deja obținute.

Cum au fost obținute rezultatele

Proiectul a fost finanțat de guvernul SUA prin National Institutes of Health și de către organizația britanică de caritate Wellcome Trust , care a finanțat Institutul Sanger , precum și multe alte grupuri din întreaga lume. Finanțarea a fost împărțită între mai multe centre majore de secvențiere, inclusiv Institutul Whitehead Sanger Universitatea Washington din St. Louis și Colegiul Baylor

Genomul a fost împărțit în secțiuni mici, de aproximativ 150.000 de perechi de baze în lungime. Aceste piese sunt apoi inserate într- un vector cunoscut sub numele de Cromozom bacterian artificial sau BAC. Acești vectori sunt creați din cromozomi bacterieni modificați genetic . Vectorii care conțin genele pot fi apoi inserați în bacterii, unde sunt replicați prin mecanisme de replicare bacteriană . Fiecare dintre bucățile genomului a fost apoi secvențiat separat prin metoda pușcă , apoi toate secvențele rezultate au fost reunite sub forma unui text computerizat. Dimensiunea bucăților mari de ADN rezultate, colectate pentru a recrea structura întregului cromozom, a fost de aproximativ 150.000 de perechi de baze. Un astfel de sistem este cunoscut sub numele de „metoda pușcă ierarhică” deoarece genomul este mai întâi rupt în bucăți de dimensiuni diferite, a căror poziție în cromozom trebuie cunoscută în prealabil.

Comparația datelor proiectelor publice și private

În 1998, cercetătorul american Craig Venter și firma sa Celera Corporation au lansat un studiu similar, finanțat din privat. La începutul anilor 1990, când proiectul genomului uman tocmai începea, Venter a lucrat și la National Institutes of Health din SUA . Scopul propriului său proiect Celera de 300 de milioane de dolari a fost secvențierea mai rapidă și mai ieftină a genomului uman decât proiectul guvernamental de 3 miliarde de dolari.

Celera a folosit o variantă mai riscantă a metodei de fragmentare a genomului (metoda cu pușcă), care fusese folosită anterior pentru a secvenționa genomuri bacteriene cu o lungime de până la șase milioane de perechi de baze, dar niciodată pentru ceva atât de mare ca genomul uman de trei miliarde de perechi de baze.

Celera a anunțat inițial că va căuta protecție prin brevet pentru „200 sau 300” de gene, dar ulterior a modificat că caută „protecția proprietății intelectuale” pentru „descrieri complete ale structurilor critice” care alcătuiesc aproximativ 100-300 de ținte. În cele din urmă, firma a depus [14] cereri provizorii de brevet pentru 6500 de gene întregi sau parțiale. Celera a promis, de asemenea, că va publica rezultatele muncii sale în condițiile Declarației , noi date trimestrial (Proiectul Genomului Uman a lansat date noi zilnic), dar, spre deosebire de proiectul finanțat din fonduri publice, firma

În martie 2000, președintele american Bill Clinton a declarat că secvența genomului nu poate fi brevetată și ar trebui să fie disponibilă gratuit pentru toți cercetătorii. În urma anunțului președintelui, acțiunile Celera au scăzut brusc, trăgând în jos întregul sector biotehnologic Nasdaq , care a pierdut aproximativ 50 de miliarde de dolari din capitalizarea bursieră în două zile.

Deși o versiune funcțională a genomului a fost anunțată în iunie 2000, Celera și oamenii de știință care lucrează la Proiectul Genomului Uman nu au făcut publice detaliile muncii lor până în februarie 2001. Numerele speciale ale revistei Nature (care a publicat lucrări științifice din proiectul guvernamental [15] ) și ale revistei Science (care a publicat lucrarea „Celera” [16] ) au descris metodele utilizate pentru a produce o schiță a secvenței și au oferit o analiză. din ea. Aceste schițe au acoperit aproximativ 83% din genom (90% din regiunile eucromatice cu 150.000 de goluri și au inclus, de asemenea, ordinea și orientarea multor dintre segmentele încă incomplete). În februarie 2001, în timpul pregătirii publicațiilor comune, au fost emise comunicate de presă în care se menționau că proiectul a fost finalizat de ambele grupuri. În 2003 și 2005 S-au anunțat schițe îmbunătățite care conțin aproximativ 92% secvență.

Competiția a funcționat foarte bine pentru proiect, forțând participanții la proiect guvernamental să-și modifice strategia pentru a accelera progresul lucrării. Concurenții au fost de acord inițial să pună în comun rezultatele, dar alianța s-a destramat după ce Celera a refuzat să-și pună la dispoziție rezultatele printr-o bază de date publică GenBank, cu acces nelimitat pentru toți utilizatorii. Celera a inclus datele Proiectului Genomului Uman în propria sa secvență, dar a interzis încercările de a-și folosi datele pentru toți utilizatorii terți.

Genomul uman este cel mai cunoscut dintre numeroasele proiecte genomice internaționale care vizează secvențierea ADN-ului unui anumit organism. În prezent, cunoașterea secvenței ADN-ului uman aduce cele mai tangibile beneficii. În plus, sunt așteptate progrese importante în biologie și medicină din secvențierea organismelor model , care includ șoareci, muștele de fructe , Danio rerio , drojdii , nematode , unele plante și o varietate de microbi și paraziți .

În 2004, cercetătorii de la Consorțiul Internațional de Secvențiere a Genomului Uman ( IHGSC  ) al Proiectului Genomului Uman au anunțat o nouă estimare a numărului de gene din genomul uman, care a variat între 20 și 25 de mii [17] Prevăzut anterior de la 3 până la 40. mii, iar la începutul proiectului, estimările erau de până la 2 milioane. Acest număr continuă să fluctueze, iar în prezent este de așteptat ca timp de mulți ani să nu se poată ajunge la un acord asupra numărului exact de gene din genomul uman.

Istoria proiectului privat

Pentru detalii despre acest subiect, consultați articolul Istoria geneticii .

În 1976, Walter Fiers și echipa sa de la Universitatea din Gent ( Ghent , Belgia ) au identificat primul genom complet al unui virus  , bacteriofagul MS2 [18] . Ideea tehnicii de fragmentare a ADN-ului ( poșca engleză  ) a venit din utilizarea unui algoritm care combina informațiile de secvență din multe fragmente mici de ADN pentru a reconstrui genomul. Această tehnică a fost introdusă de Sanger pentru a secvenționa genomul fagului Phi-X174 , un virus care infectează bacteriile ( bacterofagul ); a fost primul genom secvențial complet (secvența ADN) în 1977 [19] . Tehnica a fost numită „shotgun sequencing” deoarece genomul este spart în multe bucăți, ca și cum ar fi fost împușcat cu o pușcă. Pentru a scala metoda, atât secvențierea , cât și asamblarea genomului au trebuit să fie automatizate, ceea ce s-a întâmplat în anii 1980 .

În 1995, s-a dovedit că această tehnică este aplicabilă la secvențierea primului genom bacterian (1,8 milioane de perechi de baze) al organismului cu viață liberă Haemophilus influenzae [20] și a primului genom animal (~100 milioane de perechi de baze) [21] . Metoda implică utilizarea de secvențiere automate, ceea ce permite determinarea unor secvențe individuale mai lungi (la acel moment se obțineau aproximativ 500 de perechi de baze o dată). Secvențele suprapuse de aproximativ 2.000 de perechi de baze au fost „citite” în două direcții, acestea au fost elementele critice care au condus la dezvoltarea primelor programe computerizate de asamblare a genomului necesare pentru a reconstrui regiuni mari de ADN cunoscute sub numele de „contigs”.

Trei ani mai târziu, în 1998, anunțul companiei în curs de dezvoltare Celera Corporation că va scala fragmentarea ADN-ului la genomul uman a fost întâmpinat cu scepticism în unele cercuri . Tehnica fragmentării sparge ADN-ul în fragmente de diferite dimensiuni, de la 2 la 300 kb în lungime, formând ceea ce se numește „bibliotecă de ADN”. ADN-ul este apoi „citit” folosind un secvențietor automat în bucăți de 800 de perechi de baze lungi de la ambele capete ale fiecărui fragment. Folosind un algoritm de asamblare complex și un supercomputer , piesele sunt puse împreună, după care genomul poate fi reconstruit din milioane de fragmente scurte de 800 de perechi de baze. Succesul proiectelor atât publice, cât și private a depins de o nouă mașină de secvențiere a ADN-ului capilar, mai automatizată, numită Applied Biosystems 3700 . Ea a trecut firele de ADN printr-un tub capilar neobișnuit de subțire , mai degrabă decât printr-un gel plat, așa cum s-a făcut în modelele timpurii de secvențiere. Un factor și mai critic a fost dezvoltarea unui nou program mai mare de asamblare a genomului , un asamblator care ar putea procesa cele 30-50 de milioane de secvențe necesare pentru a secvența întregul genom uman. La acea vreme nu exista un astfel de program. Unul dintre primele proiecte majore de la Celera a fost dezvoltarea acestui asamblator, care a fost scris în paralel cu crearea unei mari fabrici de secvențiere a genomului extrem de automată. Dezvoltarea asamblatorului a fost condusă de Brian Ramos ( ing.  Brian Ramos ). Prima versiune a apărut în 2000, când echipa Celera Corporation și-a unit forțele cu profesorul Gerald Rubin genomul muștei de fructe melanogaster folosind fragmentarea genomului [22] Colectând 130 de milioane de perechi de baze, programul a procesat de cel puțin 10 ori mai multe date decât orice alte colectate anterior din rezultatele metodei de fragmentare a genomului. Un an mai târziu, echipa Celera Corporation și-a publicat ansamblul celor trei miliarde de perechi de baze ale genomului uman.

Cum au fost obținute rezultatele

IHGSC a folosit secvențierea vârfurilor combinată cu cartografierea clonelor plasmide de fragmentare a genomului mari (aproximativ 100 kb) pentru a viza și valida ansamblul secvenței fiecărui cromozom uman și, de asemenea, a folosit metoda de fragmentare a subclonelor mai mici ale acelorași plasmide, precum și multe alte date [15] .

Celera Corporation a înțeles importanța metodei de fragmentare a genomului și a folosit, de asemenea, secvența în sine pentru a orienta și a găsi locația corectă a fragmentelor secvențiate în cromozom. Cu toate acestea, compania a folosit și date disponibile public din Proiectul Genomului Uman pentru a controla procesul de asamblare și orientare, ceea ce a pus sub semnul întrebării independența datelor sale [16] [23] [24] .

Donatori ai genomului

În cadrul Proiectului interstatal al genomului uman (HGP), cercetătorii de la IHGSC au prelevat mostre de sânge (feminin) și sperma (bărbați) de la un număr mare de donatori. Din probele colectate, doar câteva au devenit sursa de ADN. Astfel, identitățile donatorilor au fost ascunse, astfel încât nici donatorii, nici oamenii de știință nu puteau ști al cui ADN a fost secvențial. Numeroase clone de ADN din diferite biblioteci au fost folosite pe Majoritatea acestor biblioteci au fost create de Dr. Pieter J. de Jong .  S-a raportat informal, și este bine cunoscut în comunitatea genetică, că cea mai mare parte a ADN-ului din proiectul guvernamental provine de la un singur donator anonim, un mascul Bivol ( nume de cod RP11) [25] .

Oamenii de știință HGP au folosit celule albe din sângele a doi donatori de sex masculin și a doi donatori de sex feminin (selectați aleatoriu din 20 de mostre de fiecare gen) - fiecare donator a devenit sursa unei biblioteci ADN separate. Una dintre aceste biblioteci (RP11) a fost folosită semnificativ mai mult decât celelalte din motive de calitate. O ușoară nuanță tehnică este că mostrele masculine au conținut doar jumătate din cantitatea de ADN care a provenit de la cromozomii X și Y, comparativ cu ceilalți 22 de cromozomi ( autozomi ); acest lucru se datorează faptului că fiecare celulă masculină (sperma) conține doar un cromozom X și un cromozom Y , și nu două ca celelalte celule.

Deși faza principală de secvențiere a Proiectului Genomului Uman a fost finalizată, cercetările privind variația ADN-ului continuă în cadrul proiectului internațional HapMap, care își propune să identifice structura grupurilor de polimorfism cu un singur nucleotide (SNP) (numite haplotipuri ). Probele de ADN pentru HapMap provin de la un total de 270 de persoane: poporul Yoruba din Ibadan ( Nigeria ), japonezii din Tokyo , chinezii din Beijing și sursa franceză Centre d'Etude du Polymorphisms Humain ( CEPH ), care este alcătuită din rezidenți din SUA originari din Europa de Vest și de Nord .

Proiectul Celera Genomics a folosit ADN-ul de la cinci indivizi pentru secvențiere. Craig Venter , fondatorul companiei, care la acea vreme era și directorul științific al Celerei, a raportat ulterior (într-o scrisoare publică către revista Science ) că ADN-ul său, fiind unul dintre cele 21 de mostre din bazin, a fost unul dintre cele cinci selectate pentru utilizare în proiectul [26] [27] .

Pe 4 septembrie 2007, o echipă condusă de Craig Venter a publicat secvența completă a propriului său ADN [28] , demitificând pentru prima dată secvența de șase miliarde de nucleotide a unui singur genom uman.

Perspective

Lucrările privind interpretarea datelor genomului sunt încă în stadii incipiente. Cunoașterea detaliată a genomului uman este de așteptat să deschidă noi căi către progresele în medicină și biotehnologie . Rezultate practice clare ale proiectului au apărut chiar înainte de finalizarea lucrărilor. Mai multe companii, cum ar fi Myriad Genetics , au început să ofere modalități simple de a efectua teste genetice care pot arăta susceptibilitatea la o varietate de boli, inclusiv cancer de sân , tulburări de sângerare , fibroză chistică , boli hepatice și multe altele. De asemenea, este de așteptat ca informațiile despre genomul uman să ajute la căutarea cauzelor cancerului , bolii Alzheimer și a altor domenii de importanță clinică și ar putea duce, eventual, la progrese semnificative în tratamentul acestora în viitor.

De asemenea, sunt așteptate multe rezultate utile pentru biologi. De exemplu, un cercetător care studiază o anumită formă de cancer și-ar putea limita căutarea la o singură genă. Vizitând o bază de date online a genomului uman , acest cercetător poate verifica ce au scris alți oameni de știință despre această genă, inclusiv structura (potențial) tridimensională a proteinei sale derivate, funcția sa, relația sa evolutivă cu alte gene umane sau cu genele la șoareci sau drojdie sau muște de fructe, posibile mutații dăunătoare, asocieri cu alte gene, țesuturi corporale în care gena este activată, boli asociate cu acea genă sau alte date.

Mai mult, o înțelegere profundă a procesului bolii la nivelul biologiei moleculare poate oferi noi proceduri terapeutice. Având în vedere rolul enorm stabilit al ADN-ului în biologia moleculară și rolul său central în determinarea principiilor fundamentale ale modului în care funcționează procesele celulare , este probabil ca extinderea cunoștințelor în acest domeniu să contribuie la progrese medicale în diverse domenii de importanță clinică care nu ar au fost posibile fără ele.

Analiza asemănărilor în secvențele ADN ale diferitelor organisme deschide, de asemenea, noi căi în studiul teoriei evoluției . În multe cazuri, întrebările de evoluție pot fi acum puse în termeni de biologie moleculară . Într-adevăr, multe dintre cele mai importante repere din istoria evoluției (apariția ribozomilor și a organitelor , dezvoltarea embrionului , sistemul imunitar al vertebratelor ) pot fi urmărite la nivel molecular. Este de așteptat ca acest proiect să pună în lumină multe întrebări despre asemănările și diferențele dintre oameni și rudele noastre cele mai apropiate ( primate și, de fapt, toate mamiferele ).

Proiectul privind diversitatea genomului uman , un studiu independent care vizează cartografierea regiunilor ADN-ului care diferă între grupurile etnice . [29] În viitor, este posibil ca HGDP să poată obține date noi în domeniile controlului bolilor, dezvoltării umane și antropologiei. HGDP poate dezvălui secretele vulnerabilității grupurilor etnice la anumiteboli și poate sugera noi strategii pentru a le depăși vezi Rasa și sănătateaDe asemenea, poate arăta modul în care populațiile umane s-au adaptat la aceste boli.

Metodele de secvențiere de nouă generație deschid perspective speciale pentru studiul genomului uman . În legătură cu dezvoltarea de noi metode, procesul de secvențiere a genomului a fost mult simplificat și accelerat . Acest lucru permite secvențierea unui număr mare de genomi umani pentru a determina polimorfismul unei singure nucleotide (proiect 1000 de genomi). În plus, secvențierea de generație următoare a făcut posibilă lansarea unui proiect de cartografiere a elementelor genomului (secvențe de reglementare și alte secvențe) - ENCODE .

Metodele de secvențiere mai ieftine fac deja posibilă secvențarea genomului unui individ în scopuri terapeutice.

Vezi și

Note

  1. ↑ Robert Krulwich .  _ Schimbarea codului vieții [emisiune TV] . PBS . ISBN 1-5375-16-9.   Arhivat pe 6 noiembrie 2018 la Wayback Machine
  2. ↑ Impactul economic al proiectului genomului uman - Battelle . Preluat la 1 august 2013. Arhivat din original la 23 decembrie 2012.
  3. ↑ Finalizarea proiectului genomului uman: Întrebări frecvente . genom.gov . Preluat la 6 aprilie 2022. Arhivat din original la 11 decembrie 2017.
  4. ↑ Oamenii de știință au descifrat complet genomul uman . Consultat la 4 aprilie 2022. Arhivat din original pe 3 aprilie 2022.
  5. ↑ Cook-Deegan R. The Alta Summit, decembrie 1984  (nedeterminat)  // Genomics . - Presa Academică , 1989. - V. 5 . - S. 661-663 . - doi : 10.1016/0888-7543(89)90042-6 .
  6. ↑ Raport privind inițiativa genomului uman pentru Biroul de Cercetare pentru Sănătate și Mediu . Data accesului: 27 octombrie 2008. Arhivat din original la 22 septembrie 2008.
  7. ↑ Barnhart, Benjamin J. DOE Human Genome Program  (nedefinit)  // Human Genome Quarterly. - 1989. - T. 1 . - S. 1 . Consultat 2005-02-03.
  8. ↑ DeLisi, Charles. Genomul: 15 ani mai târziu, o perspectivă de Charles DeLisi, Pioneer HGP  //  Știri despre genom uman: jurnal. - 2001. - Vol. 11 . - P. 3-4 . Arhivat din original pe 8 septembrie 2005. .
  9. ↑ Comunicat de presă al Casei Albe . Data accesului: 22 iulie 2006. Arhivat din original pe 20 martie 2012.
  10. ↑ BBC NEWS / Science/Nature / Genomul uman în sfârșit complet . Data accesului: 22 iulie 2006. Arhivat din original pe 20 martie 2012.
  11. ↑ Guardian Unlimited / Marea Britanie Ultimele / Proiectul genomului uman finalizat . Data accesului: 22 iulie 2006. Arhivat din original la 12 octombrie 2007.
  12. ↑ Pagina principală a browserului UCSC Genome . Preluat la 14 aprilie 2022. Arhivat din original la 27 ianuarie 2018.
  13. ↑ Ensembl Genome Browser . Consultat la 27 octombrie 2008. Arhivat din original la 15 august 2000.
  14. ↑ BBC News | SCI/TECH | Brevete ale genelor umane apărate . Consultat la 27 octombrie 2008. Arhivat din original la 28 august 2017.
  15. ↑ 1 2 Consorțiul Internațional de Secvențiere a Genomului Uman. Secvențierea și analiza inițială a genomului uman.  (engleză)  // Natura: jurnal. - 2001. - Vol. 409 . — P. 860?921 . - doi : 10.1038/35057062 .
  16. ↑ 1 2 Venter, JC, et al. Secvența genomului uman.  (engleză)  // Știință. - 2001. - Vol. 291 . — P. 1304?1351 . - doi : 10.1126/science.1058040 . — PMID 11181995 .
  17. ↑ IHGSC. Finalizarea secvenței eucromatice a genomului uman.  (engleză)  // Natura: jurnal. - 2004. - Vol. 431 . - P. 931-945 . - doi : 10.1038/nature03001 .
  18. ↑ Fiers W, Contreres R, Duerinck F, Haegeman G, Iserentant D, Merregaert J, Min Jou W, Molemans F, Raeymaekers A, Van den Berghe A, Volckaert G, Ysebaert M. Secvența completă de nucleotide a bacteriofagului MS2 ARN: primar și structura secundară a genei replicazei, Nature. 1976 Apr 8;260(5551):500-7.
  19. ^ Sanger F, Air GM, Barrell BG, Brown NL, Coulson AR, Fiddes CA, Hutchison CA, Slocombe PM, Smith M., Nucleotide sequence of bacteriophage phi X174 DNA, Nature. 1977 24 februarie;265(5596):687-95
  20. ↑ Fleischmann, R.D. și colab. Secvențierea aleatorie a întregului genom și asamblarea Haemophilus influenzae Rd. (engleză)  // Știință: jurnal. - 1995. - Vol. 269 . — P. 496?512 . - doi : 10.1126/science.7542800 . — PMID 7542800 .
  21. ↑ C. elegans Sequencing Consortium. Secvența genomului nematodului Caenorhabditis elegans : O platformă pentru investigarea biologiei. (engleză)  // Știință: jurnal. - 1998. - Vol. 282 . - P. 2012-18 . - doi : 10.1126/science.282.5396.2012 . — PMID 9851916 .
  22. ↑ Adams, MD. et al. Secvența genomului Drosophila melanogaster . (engleză)  // Știință: jurnal. - 2000. - Vol. 287 . — P. 2185?2195 . - doi : 10.1126/science.287.5461.2185 . — PMID 10731132 .
  23. ^ Waterston RH, Lander ES, Sulston JE Despre secvențierea genomului uman  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2002. - Vol. 99 . - P. 3712-6 . - doi : 10.1073/pnas.042692499 . — PMID 11880605 .
  24. ↑ Waterston RH, Lander ES, Sulston JE Mai multe despre secvențierea genomului uman  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2003. - Vol. 100 . - P. 3022-4 . - doi : 10.1073/pnas.0634129100 . — PMID 12631699 .
  25. ↑ Osoegawa, Kazutoyo. O bibliotecă de cromozomi artificiali bacterieni pentru secvențierea genomului uman complet  // Cercetarea  genomului : jurnal. - 2001. - Vol. 11 . - P. 483-496 . - doi : 10.1101/gr.169601 . — PMID 11230172 .
  26. ↑ Kennedy D. Nu rău, poate, dar lipicios   // Știință . - 2002. - Vol. 297 . — P. 1237 . - doi : 10.1126/science.297.5585.1237 . — PMID 12193755 .
  27. ↑ Venter D. O parte din secvența genomului uman   // Știință . - 2003. - Vol. 299 . - P. 1183-1184 . - doi : 10.1126/science.299.5610.1183 . — PMID 12595674 .
  28. ↑ Levy S., Sutton G., Ng PC, Feuk L., Halpern AL, et al. Secvența genomului diploid a unui om individual  // PLoS Biology  : journal  . - 2007. - Vol. 5 , nr. 10 . —P.e254 . _ - doi : 10.1371/journal.pbio.0050254 .
  29. ↑ Proiectul privind diversitatea genomului uman . Consultat la 23 noiembrie 2009. Arhivat din original la 12 februarie 2010.

Link -uri

  Accesați articolul Wikidata  Site-uri tematice
Dicționare și enciclopedii