Hsp90

Histidin kinaza-, ADN-giraza B- și ATP-Hsp90

Model de bandă solidă a unui dimer Hsp90 de drojdie (α-helices = roșu, β-sheets = cyan, bucle = gri) complexat cu ATP (tijă roșie). [unu]
Identificatori
Simbol HATPaza_c
Pfam PF02518
Clanul Pfam CL0025
InterPro IPR003594
INTELIGENT SM00387
SCOP 1ei1
SUPERFAMILIE 1ei1
Structuri proteice disponibile
Pfam structurilor
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum Model 3D
 Fișiere media la Wikimedia Commons
proteina Hsp90

Structura domeniului N-terminal al însoțitorului Hsp90 de drojdie. [2]
Identificatori
Simbol Hsp90
Pfam PF00183
InterPro IPR020576
PROZITA PDOC00270
SCOP 1ah6
SUPERFAMILIE 1ah6
Structuri proteice disponibile
Pfam structurilor
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum Model 3D
 Fișiere media la Wikimedia Commons

Hsp90 (abreviat din engleza  H eat s hock protein 90 ) , de asemenea heat shock protein 90 , este o proteină însoțitoare care ajută alte proteine ​​să se plieze corect (participă la pliere ), stabilizează proteinele de la stresul termic și promovează degradarea proteinelor . De asemenea, stabilizează o serie de proteine ​​necesare creșterii tumorii, motiv pentru care inhibitorii Hsp90 sunt investigați ca medicamente anti-cancer.

Proteinele de șoc termic , ca clasă, sunt printre cele mai expresive proteine ​​celulare din toate speciile [3] . După cum sugerează și numele, proteinele de șoc termic protejează celulele atunci când sunt expuse la temperaturi ridicate. Acestea reprezintă 1-2% din conținutul total de proteine ​​din celulele nestresate. Cu toate acestea, atunci când celulele sunt încălzite, proporția proteinelor de șoc termic crește la 4-6% din conținutul total de proteine ​​celulare [4] .

Proteina de șoc termic 90 (Hsp90) este una dintre cele mai comune proteine ​​care conțin căldură. Numele „90” provine de la faptul că greutatea sa moleculară este de aproximativ 90 de kilodaltoni. O proteină cu o masă de 90 kDa este considerată destul de mare pentru proteinele nefibrotice. Hsp90 se găsește în bacterii și în toate liniile de eucariote , dar pare să fie absent din arhee [5] . În timp ce Hsp90 citoplasmatic este necesar pentru viabilitate în toate condițiile la eucariote, omologul bacterian al HtpG poate fi utilizat în condiții de stres fără căldură [6] .

Izoforme

Hsp90 este foarte conservat și este exprimat într-o varietate de organisme de la bacterii la mamifere , inclusiv analogul procariotic HtpG (proteina G de temperatură înaltă) cu 40% identitate de secvență și 55% similaritate cu proteina umană [5] . Drojdia Hsp90 este 60% identică cu Hsp90α umană.

În celulele de mamifere, există două sau mai multe gene care codifică omologi citosolici ai Hsp90 [5] , Hsp90α umană având identitate de secvență de 85% cu Hsp90β [7] . Se presupune că formele α și β sunt rezultatul unui eveniment de duplicare a genelor care a avut loc cu milioane de ani în urmă [5] .

Cinci gene umane funcționale care codifică izoforme ale proteinelor Hsp90 sunt prezentate sub forma unui tabel [7] :

familie localizare intracelulară subfamilie gena familie
HSP90A citoplasmatic HSP90AA
(inductibil)
HSP90AA1 Hsp90-α 1
HSP90AA2 Hsp90-a 2
HSP90AB
(exprimat constitutiv)
HSP90AB1 Hsp90-p
HSP90B reticulul endoplasmatic HSP90B1 Endoplasmină/
GRP-94
CAPCANĂ mitocondriale CAPCANĂ1 proteină asociată TNF1

Există 12 pseudogene umane (gene nefuncționale) care codifică izoforme suplimentare ale Hsp90 și nu sunt exprimate ca proteine.

Recent, a fost identificată o variantă citosolică legată de membrană a Hsp90 care nu avea un site de legare a ATP și a fost numită Hsp90N [8] . Acest transcript HSP90α-Δ-N este o himeră cu primii 105 bp. secvența de codificare derivată din gena CD47 de pe cromozomul 3q13.2 și secvența de codificare rămasă derivată din HSP90AA1 [7] . Cu toate acestea, mai târziu s-a descoperit că gena care codifică Hsp90N nu există în genomul uman . Acesta este posibil un artefact de clonare sau un produs al unei rearanjamente cromozomiale care apare într-o singură linie celulară [9] .

Structura

Structura generală

Structura generală a Hsp90 este similară cu cea a altor proteine ​​prin aceea că conține toate blocurile de construcție secundare comune (de exemplu , elice alfa , foi beta și bobine aleatorii). Fiind o proteină citoplasmatică, Hsp90 are structură globulară, care constă în principal din reziduuri de aminoacizi nepolare în interior și polare în exterior, această proprietate îi permite să interacționeze cu apa. Hsp90 conține nouă elice și opt foi antiparalele beta, care se combină pentru a forma mai multe structuri sandwich alfa/beta. Cele 310 elice alcătuiesc aproximativ 11% din resturile de aminoacizi ale proteinei, ceea ce este mult mai mare, în medie de 4%, decât în ​​alte proteine.

Structura domeniului

Hsp90 constă din patru domenii structurale [10] [11] [12] :

Structurile cristaline sunt disponibile pentru domeniul N-terminal al drojdiei și Hsp90 uman [13] [14] [2] , pentru complexele de la capătul N-terminal cu inhibitori și nucleotide și pentru domeniul mijlociu al drojdiei Hsp90 [13] [14 ] ] [15] . Recent, au fost elucidate structurile de lungime completă ale proteinelor Hsp90 din E. coli (2IOP, 2IOQ) [16] , drojdie (2CG9, 2CGE) [17] și reticulul endoplasmatic de câine (2O1U, 2O1V) [18] [19] .

Hsp90 formează homodimeri , în care contactele locale sunt localizate în interiorul capătului C-terminal într-o conformație de dimer deschis. N-terminalele contactează, de asemenea, într-o conformație de dimer închis [15] .

Domeniu N-terminal

Domeniul N-terminal împărtășește omologie nu numai între membrii familiei de însoțitori Hsp90, ci și printre membrii superfamiliei kinazei ATPaze/GHKL (abreviat de la G yrase , H sp90, Histidin Kinase, Mut L ) [11] .

Buzunarul obișnuit de legare pentru ATP și inhibitorul geldanamicina este situat în domeniul N-terminal. Aminoacizii care sunt direct implicați în interacțiunea cu ATP sunt Leu34, Asn37, Asp79, Asn92, Lys98, Gly121 și Phe124. În plus, ionii de Mg 2+ și mai multe molecule de apă formează interacțiuni de legătură, prin legături electrostatice și, respectiv, de hidrogen, între moleculele Hsp90 și ATP. În plus, reziduul Glu33 este necesar pentru hidroliza ATP.

Domeniu mediu

Domeniul de mijloc este împărțit în trei zone:

  • Sandviș α-β-α cu 3 straturi
  • Helix α cu 3 ture și bucle neregulate
  • α-helix cu 6 ture.

Domeniul mijlociu (MD) este, de asemenea, implicat în legarea la proteina client. De exemplu, proteinele cunoscute că interacționează cu acest MD Hsp90 includ PKB/Akt1, eNOS [20] [21] , Aha1, Hch1. În plus, legarea substratului (de exemplu, Aha1 și Hch1) la MD este de asemenea cunoscută pentru a crește activitatea ATPazei Hsp90 [15] [22] .

Domeniul C-terminal

Domeniul C-terminal are un site alternativ de legare ATP care devine disponibil atunci când buzunarul Bergerat al capătului N-terminal al proteinei este ocupat [23] [24] .

La capătul C-terminal al proteinei se află site-ul de recunoaștere a motivului repetitiv al tetratripeptidei (TPR), o pentapeptidă MEEVD conservată care este responsabilă de interacțiunile cu cofactori precum imunofilinele FKBP51 și FKBP52, fosfoproteina 1 indusă de stres (Sti1/Hop), ciclofilina-40, PP5, Tom70 și multe altele [25] .

Funcții efectuate

În celulele normale

În celulele nestresate, Hsp90 joacă un număr de roluri importante, care includ sprijinirea în pliere, transport intracelular, întreținere și degradare a proteinelor și facilitarea semnalizării celulare.

Plierea proteinelor și rolul însoțitorului

Se știe că Hsp90 se asociază cu structurile non-native ale multor proteine, ceea ce duce la sugestia că Hsp90 este implicată în plierea proteinelor în general. S-a demonstrat că Hsp90 inhibă agregarea unei game largi de proteine ​​„client” sau „substrat” și, prin urmare, acționează ca o însoțitoare de protecție comună. Cu toate acestea, Hsp90 este ceva mai selectiv (selectiv) decât celelalte însoțitori.

Degradarea proteinelor

Proteinele eucariote care nu mai sunt necesare sau pliate greșit sau deteriorate în alt mod sunt de obicei marcate pentru degradare (distrugere) prin poliubiquitinare . Aceste proteine ​​ubiquitin sunt recunoscute și destructurate de proteazomii 26S . Prin urmare, proteazomii 26S sunt o parte integrantă a mecanismului de degradare a proteinelor celulare. În plus, este necesară o sursă constantă de Hsp90 funcțional pentru a menține structura terțiară a proteazomului. În cele din urmă, experimentele cu mutanți Hsp90 sensibili la căldură și proteazomii 26S sugerează că Hsp90 este responsabil pentru cea mai mare parte, dacă nu pentru toată, activitatea ATPazei proteazomului.

Interacțiunea cu receptorii de steroizi

Receptorul de glucocorticoizi (GR) este cel mai amănunțit exemplu studiat de receptor de steroizi a cărui funcție depinde în mod critic de interacțiunea cu Hsp90 [26] [27] . În absența cortizolului , un hormon steroidian, GR se află în citosol, complexat cu mai multe proteine ​​însoțitoare, inclusiv Hsp90 (vezi figura din dreapta). Aceste însoțitori mențin GH într-o stare capabilă să lege hormonul. Al doilea rol al Hsp90 este de a lega imunofilinele (de exemplu, FKBP52), care atașează complexul GR de calea proteinei dineinei , care translocă (transferă) receptorul activat din citoplasmă la nucleul celular [28] . Odată ajuns în nucleu, GR se dimerizează și se leagă de anumite secvențe de ADN și, prin urmare, îmbunătățește expresia genelor sensibile la GR. Hsp90 este, de asemenea, necesar pentru funcționarea corectă a unui număr de alți receptori steroizi , inclusiv cei responsabili pentru legarea aldosteronului [29] , androgenului [30] estrogenului [31] și progesteronului [32] .

Celulele tumorale

Celulele canceroase supraexprimă un număr de proteine, inclusiv receptorii factorului de creștere, cum ar fi EGFR sau proteine ​​de transducție a semnalului, cum ar fi PI3K și AKT (inhibarea acestor proteine ​​poate induce apoptoza ). Hsp90 stabilizează diverși receptori ai factorilor de creștere și mai multe molecule de semnalizare, inclusiv proteinele PI3K și AKT. Prin urmare, inhibarea Hsp90 poate induce apoptoza prin inhibarea căii de semnalizare PI3K/AKT și a semnalelor factorului de creștere în general.

Un alt rol important al Hsp90 în carcinogeneză este stabilizarea proteinelor mutante, cum ar fi v-Src, fuziunile de oncogene Bcr/Abl și formele mutante p53 care apar în timpul transformării celulare.

În plus, Hsp90 este implicat în multe procese cheie ale oncogenezei, cum ar fi autosuficiența semnalelor de creștere, stabilizarea proteinelor mutante, angiogeneza și metastaza.

Semnificație clinică

Note

  1. PDB 2CG9 ; Ali MM, Roe SM, Vaughan CK, Meyer P., Panaretou B., Piper PW, Prodromou C., Pearl LH Structura cristalină a unui complex de însoțitori închis Hsp90-nucleotide-p23/Sba1  (engleză)  // Nature : journal. - 2006. - Aprilie ( vol. 440 , nr. 7087 ). - P. 1013-1017 . - doi : 10.1038/nature04716 . — PMID 16625188 .
  2. 1 2 Prodromou C., Roe SM, Piper PW, Pearl LH O clemă moleculară în structura cristalină a domeniului N-terminal al drojdiei însoțitoare Hsp90   // Nat . Struct. Biol.  : jurnal. - 1997. - iunie ( vol. 4 , nr. 6 ). - P. 477-482 . - doi : 10.1038/nsb0697-477 . — PMID 9187656 .
  3. Csermely P., Schnaider T., Soti C., Prohászka Z., Nardai G. The 90-kDa molecular chaperone family: structure, function, and clinical applications. O revizuire cuprinzătoare   // Pharmacol . Acolo.  : jurnal. - 1998. - august ( vol. 79 , nr. 2 ). - P. 129-168 . - doi : 10.1016/S0163-7258(98)00013-8 . — PMID 9749880 .
  4. Crevel G., Bates H., Huikeshoven H., Cotterill S. Proteina Drosophila Dpit47 este un co-chaperon nuclear Hsp90 care interacționează cu ADN polimeraza alfa  //  Journal of Cell Science : jurnal. — Compania de biologi, 2001. - 1 iunie ( vol. 114 , nr. Pt 11 ). - P. 2015-2025 . — PMID 11493638 .
  5. 1 2 3 4 Chen B., Zhong D., Monteiro A. Genomica comparativă și evoluția familiei de gene HSP90 în toate regnurile de organisme  //  BMC Genomics : jurnal. - 2006. - Vol. 7 . — P. 156 . - doi : 10.1186/1471-2164-7-156 . — PMID 16780600 .
  6. Thomas JG, Baneyx F. Roles of the Escherichia coli Small Heat Shock Proteins IbpA and IbpB in Thermal Stress Management: Comparison with ClpA, ClpB, and HtpG In Vivo  //  Journal of Bacteriology : jurnal. - 1998. - octombrie ( vol. 180 , nr. 19 ). - P. 5165-5172 . — PMID 9748451 .
  7. 1 2 3 Chen B., Piel WH, Gui L., Bruford E., Monteiro A. Familia HSP90 de gene în genomul uman: perspective asupra divergenței și evoluției lor  // Genomics  :  journal. - Academic Press , 2005. - Decembrie ( vol. 86 , nr. 6 ). - P. 627-637 . - doi : 10.1016/j.ygeno.2005.08.012 . — PMID 16269234 .
  8. Grammatikakis N., Vultur A., ​​​​Ramana CV, Siganou A., Schweinfest CW, Watson DK, Raptis L. Rolul Hsp90N, un nou membru al familiei Hsp90, în transducția semnalului și transformarea neoplazică  (engleză)  / / J Biol. Chim.  : jurnal. - 2002. - Martie ( vol. 277 , nr. 10 ). - P. 8312-8320 . - doi : 10.1074/jbc.M109200200 . — PMID 11751906 .
  9. Zurawska A., Urbanski J., Bieganowski P. Hsp90n - Un produs accidental al unei translocații cromozomiale fortuite, mai degrabă decât un membru obișnuit al familiei Hsp90 al proteomului uman  //  Biochimica et Biophysica Acta : jurnal. - 2008. - noiembrie ( vol. 1784 , nr. 11 ). - P. 1844-1846 . - doi : 10.1016/j.bbapap.2008.06.013 . — PMID 18638579 .
  10. Pearl LH, Prodromou C. Structure and in vivo function of Hsp90   // Curr . Opinează. Struct. Biol.. - 2000. - Februarie ( vol. 10 , nr. 1 ). - P. 46-51 . - doi : 10.1016/S0959-440X(99)00047-0 . — PMID 10679459 .
  11. 1 2 Prodromou C., Pearl LH Structura și relațiile funcționale ale Hsp90  //  Curr Cancer Drug Targets : jurnal. - 2003. - octombrie ( vol. 3 , nr. 5 ). - P. 301-323 . - doi : 10.2174/1568009033481877 . — PMID 14529383 .
  12. Pearl LH, Prodromou C. Structure, function, and mechanism of the Hsp90 molecular chaperone   // Adv . chimică proteică. : jurnal. - 2001. - Vol. 59. Progrese în chimia proteinelor . - P. 157-186 . - ISBN 978-0-12-034259-4 . - doi : 10.1016/S0065-3233(01)59005-1 . — PMID 11868271 .
  13. 1 2 Stebbins CE, Russo AA, Schneider C., Rosen N., Hartl FU, Pavletich NP Structura cristalină a unui complex Hsp90-geldanamicin: țintirea unei proteine ​​însoțitoare de către un agent antitumoral  (engleză)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1997. - Aprilie ( vol. 89 , nr. 2 ). - P. 239-250 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80203-2 . — PMID 9108479 .
  14. 1 2 Prodromou C., Roe SM, O'Brien R., Ladbury JE, Piper PW, Pearl LH Identificarea și caracterizarea structurală a site-ului de legare ATP/ADP în chaperonul molecular Hsp90  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1997. - Iulie ( vol. 90 , nr. 1 ). - P. 65-75 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80314-1 . — PMID 9230303 .
  15. 1 2 3 Meyer P., Prodromou C., Hu B., Vaughan C., Roe SM, Panaretou B., Piper PW, Pearl LH Analiza structurală și funcțională a segmentului mijlociu al hsp90: implicații pentru hidroliza ATP și proteina client și interacțiuni cochaperone  (engleză)  // Mol. celulă : jurnal. - 2003. - Martie ( vol. 11 , nr. 3 ). - P. 647-658 . - doi : 10.1016/S1097-2765(03)00065-0 . — PMID 12667448 .
  16. Shiau AK, Harris SF, Southworth DR, Agard DA Analiza structurală a E. coli hsp90 dezvăluie rearanjamente conformaționale dramatice dependente de nucleotide   // Cell . - Cell Press , 2006. - Octombrie ( vol. 127 , nr. 2 ). - P. 329-340 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.09.027 . — PMID 17055434 .
  17. Ali MM, Roe SM, Vaughan CK, Meyer P., Panaretou B., Piper PW, Prodromou C., Pearl LH Structura cristalină a unui complex de însoțitori închis Hsp90-nucleotide-p23/Sba1  //  Nature : journal . - 2006. - Aprilie ( vol. 440 , nr. 7087 ). - P. 1013-1017 . - doi : 10.1038/nature04716 . — PMID 16625188 .
  18. Dollins DE, Warren JJ, Immormino RM, Gwirth DT Structurile complexelor GRP94-nucleotide dezvăluie diferențe mecanice între însoțitorii hsp90   // Mol . celulă : jurnal. - 2007. - octombrie ( vol. 28 , nr. 1 ). - P. 41-56 . - doi : 10.1016/j.molcel.2007.08.024 . — PMID 17936703 .
  19. Wandinger SK, Richter K., Buchner J. The hsp90 chaperone machinery  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2008. - iulie ( vol. 283 , nr. 27 ). - P. 18473-18477 . - doi : 10.1074/jbc.R800007200 . — PMID 18442971 .
  20. Sato S, Fujita N, Tsuruo T (septembrie 2000). „Modularea activității Akt kinazei prin legarea la Hsp90” . Proc. Natl. Acad. sci. SUA . 97 (20): 10832-7. DOI : 10.1073/pnas.170276797 . PMC  27109 . PMID  10995457 .
  21. Fontana J., Fulton D., Chen Y., Fairchild TA, McCabe TJ, Fujita N., Tsuruo T., Studiile de cartografiere a domeniului Sessa WC arată că domeniul M al hsp90 servește ca o schelă moleculară pentru a regla fosforilarea dependentă de Akt. de oxid nitric sintaza endotelială și eliberare de NO   // Circ . Res. : jurnal. - 2002. - Mai ( vol. 90 , nr. 8 ). - P. 866-873 . - doi : 10.1161/01.RES.0000016837.26733.BE . — PMID 11988487 .
  22. Panaretou B., Siligardi G., Meyer P., Maloney A., Sullivan JK, Singh S., Millson SH, Clarke PA, Naaby-Hansen S., Stein R., Cramer R., Mollapour M., Workman P. ., Piper PW, Pearl LH, Prodromou C. Activarea activității ATPazei a hsp90 de către cochaperonul reglat de stres aha1   // Mol . celulă : jurnal. - 2002. - Decembrie ( vol. 10 , nr. 6 ). - P. 1307-1318 . - doi : 10.1016/S1097-2765(02)00785-2 . — PMID 12504007 .
  23. Marcu MG, Chadli A., Bouhouche I., Catelli M., Neckers LM Novobiocinul antagonist al proteinei de șoc termic 90 interacționează cu un domeniu de legare ATP nerecunoscut anterior în capătul carboxil al chaperonei  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2000. - noiembrie ( vol. 275 , nr. 47 ). - P. 37181-37186 ​​​​. - doi : 10.1074/jbc.M003701200 . — PMID 10945979 .
  24. Söti C., Rácz A., Csermely P. Un comutator molecular dependent de nucleotide controlează legarea ATP la domeniul C-terminal al Hsp90. Legarea nucleotidelor N-terminale demască un buzunar de legare C-terminal  (engleză)  // J. Biol. Chim.  : jurnal. - 2002. - Martie ( vol. 277 , nr. 9 ). - P. 7066-7075 . - doi : 10.1074/jbc.M105568200 . — PMID 11751878 .
  25. Young JC, Obermann WM, Hartl FU Legarea specifică a proteinelor repetate tetratricopeptidice la domeniul C-terminal de 12 kDa al hsp90  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. - 1998. - iulie ( vol. 273 , nr. 29 ). - P. 18007-18010 . doi : 10.1074/ jbc.273.29.18007 . — PMID 9660753 .
  26. Pratt WB, Morishima Y., Murphy M., Harrell M. Chaperoning of glucocorticoid receptors  (neopr.)  // Handbook of Experimental Pharmacology. - 2006. - T. 172 , Nr. 172 . - S. 111-138 . — ISBN 3-540-25875-2 . - doi : 10.1007/3-540-29717-0_5 . — PMID 16610357 .
  27. Grad I., Picard D. Răspunsurile la glucocorticoizi sunt modelate de chaperone moleculare   // Mol . celulă. Endocrinol. : jurnal. - 2007. - Septembrie ( vol. 275 , nr. 1-2 ). - P. 2-12 . - doi : 10.1016/j.mce.2007.05.018 . — PMID 17628337 .
  28. Pratt WB, Galigniana MD, Morishima Y., Murphy PJ Rolul chaperonelor moleculare în acțiunea receptorilor de steroizi  //  Essays Biochem. : jurnal. - 2004. - Vol. 40 . - P. 41-58 . — PMID 15242338 . Arhivat din original pe 18 august 2007.
  29. Rafestin-Oblin ME, Couette B., Radanyi C., Lombes M., Baulieu EE Receptorul mineralocorticosteroid al intestinului de pui. Structură și transformare oligomerică  (engleză)  // J. Biol. Chim.  : jurnal. - 1989. - Iunie ( vol. 264 , nr. 16 ). - P. 9304-9309 . — PMID 2542305 . Arhivat din original pe 16 august 2005.
  30. Joab I., Radanyi C., Renoir M., Buchou T., Catelli MG, Binart N., Mester J.,  Baulieu EE .  Natura: jurnal. - 1984. - Vol. 308 , nr. 5962 . - P. 850-853 . - doi : 10.1038/308850a0 . — PMID 6201744 .
  31. Redeuilh G., Moncharmont B., Secco C., Baulieu EE Compoziția subunității a receptorului de estradiol netransformat „8-9 S” stabilizat cu molibdat exclus din uterul de vițel  (engleză)  // J. Biol. Chim.  : jurnal. - 1987. - Mai ( vol. 262 , nr. 15 ). - P. 6969-6975 . — PMID 3584104 . Arhivat din original pe 7 octombrie 2008.
  32. Catelli MG, Binart N., Jung-Testas I., Renoir JM, Baulieu EE, Feramisco JR, Welch WJ Componenta proteică comună de 90 kd a receptorilor de steroizi „8S” netransformați este o proteină de șoc  termic)  // EMBO J. : jurnal. - 1985. - Decembrie ( vol. 4 , nr. 12 ). - P. 3131-3135 . — PMID 2419124 .