Coronavirusuri
Coronavirusurile [2]
( lat. Coronaviridae ) sunt o familie de virusuri care conțin ARN , inclusiv 45 de specii din mai 2020, combinate în două subfamilii [3] [4] . Acestea afectează mamiferele (inclusiv oamenii), păsările și amfibienii. Numele este asociat cu structura virusului, ale cărui procese asemănătoare cu vârful seamănă cu corona solară [2] . Există 7 coronavirusuri cunoscute care infectează oamenii [5] [6] [7] :
- HCoV-229E este un alfacoronavirus , identificat pentru prima dată la mijlocul anilor 1960;
- HCoV-NL63 - alfacoronavirus , agentul patogen a fost identificat în Țările de Jos în 2004;
- HCoV-OC43 - betacoronavirus A, agentul cauzal a fost identificat în 1967;
- HCoV-HKU1 - betacoronavirus A, agentul patogen a fost descoperit în Hong Kong în 2005;
- SARS-CoV este betacoronavirus B, agentul cauzal al sindromului respirator acut sever , al cărui prim caz a fost raportat în 2002;
- MERS-CoV - betacoronavirus C, agentul cauzal al sindromului respirator din Orientul Mijlociu , al cărui focar a avut loc în 2015;
- SARS-CoV-2 - betacoronavirus B, identificat în a doua jumătate a anului 2019, a provocat pandemia de COVID-19 , care a dus la închiderea frontierelor și introducerea măsurilor de securitate de urgență ( carantină , izolare strictă, purtarea măștilor etc. ).
Etimologie
Numele „coronavirus” provine din latinescul corona , care înseamnă „cunună”, care, la rândul său, este împrumutat din altă greacă. κορώνη korṓnē, „ghirlandă, cunună” [8] [9] . Numele a fost inventat de Juna Almeida și David Tyrrell, care au fost primii care au descoperit și studiat coronavirusurile umane [10] . Cuvântul a fost folosit pentru prima dată în tipărire în 1968 de un grup informal de virologi în revista Nature pentru a se referi la o nouă familie de viruși [11] . Denumirea se referă la aspectul caracteristic al virionilor (forma infecțioasă a virusului) la microscopia electronică, care sunt mărginiți cu proeminențe mari ridicate pe suprafața lor, creând o imagine asemănătoare cu o coroană solară sau un halou [11] [10] . Această morfologie este creată de peplomerii cu vârf viral, care sunt proteine de la suprafața virusului [12] .
Denumirea științifică Coronavirus a fost adoptată ca denumire de gen de către Comitetul Internațional pentru Nomenclatura Virușilor (redenumit ulterior Comitetul Internațional pentru Taxonomia Virușilor ) în 1971 [13] . Pe măsură ce numărul de noi specii a crescut, genul a fost împărțit în patru genuri și anume Alphacoronavirus , Betacoronavirus , Deltacoronavirus și Gammacoronavirus în 2009 [14] . Denumirea comună coronavirus este folosită pentru a se referi la orice membru al subfamiliei Orthocoronavirinae [15] . Începând cu 2020, 45 de specii sunt recunoscute oficial [16] .
Epidemiologie
Coronavirusurile provoacă boli la mamifere ( oameni , lilieci , pisici , câini , porci , vite ) și păsări . Câteva ___păsărilaAvCoVs(aviar Coronavirus :exemple TGEV — coronavirus gastroenterită transmisibilă porcină și patotipul său PRCV — coronavirus respirator porc), la câini cu coronavirus canin ( CCoV-1 și CCoV-2 /PanCCoV ), la pisici cu coronavirus feline ( FECV — enterita coronavirus pisici, FIPV — feline infectious peritonita coronavirus), la șoareci , coronavirus murin ( MCoV , provoacă hepatită virală la șoareci, la șobolani RtCoV — coronavirus șobolan, PCoV — pufinoză petrel coronavirus), etc., există multe coronavirusuri la diferite specii de lilieci [3 ] [17] .
Sursele de infectare cu coronavirus pot fi o persoană bolnavă, animalele. Mecanisme posibile de transmitere: aerian, aerian, fecal-oral, contact. Incidența crește iarna și primăvara devreme. În structura ARVI la pacienții internați, infecția cu coronavirus este în medie de 12%. Prevalența pe scară largă a coronavirusurilor este evidențiată de anticorpii specifici detectați la 80% dintre oameni [18] [19] .
Coronavirusul uman a fost izolat pentru prima dată în 1965 de la pacienții cu ARVI de către D. Tyrrel din nazofaringe cu rinită acută , mai târziu, în 1975, E. Kaul și S. Clark au izolat coronavirusul din fecale în enterocolita copilăriei . Ulterior, coronavirusurile aproape că nu au atras atenția cercetătorilor, până când un focar de SARS, sau sindrom respirator acut sever (SARS, SARS) , a fost înregistrat în China în 2002-2003 . Boala a fost cauzată de virusul SARS-CoV. Ca urmare, boala sa răspândit în alte țări, un total de 8273 de persoane s-au îmbolnăvit, 775 au murit (rata mortalității 9,6%).
Virusul MERS-CoV este agentul cauzal al sindromului respirator din Orientul Mijlociu (MERS), ale cărui prime cazuri au fost raportate în 2012 [20] . În 2015, în Coreea de Sud a avut loc un focar de sindrom respirator din Orientul Mijlociu , în timpul căruia 183 de persoane s-au îmbolnăvit și 33 au murit.
În decembrie 2019, în China a început un focar de pneumonie , cauzat de virusul SARS-CoV-2 nou descoperit . S-a răspândit curând în alte țări.
Structura și ciclul de viață
Genomul este reprezentat de ARN (+) monocatenar. Nucleocapsidul este înconjurat de o membrană proteică și de o înveliș exterioară care conține lipo, din care se extind procesele spinoase în formă de maciucă, care seamănă cu o coroană, pentru care familia și-a primit numele.
SARS-CoV-2 folosește proteina S de pe coroană pentru a se atașa de receptorul său , enzima de conversie a angiotensinei 2 (ACE2), precum și de serin proteaza TMPRSS2 [21] , la fel ca virusul SARS-CoV (SARS). [22] . Celula învelește virusul cu membrana sa, iar vezicula membranară rezultată se află în citoplasma celulei. Cele două proteine receptorilor celulari menționate mai sus transformă proteina S virală în așa fel încât membranele virale și celulare fuzionează [23] .
După intrarea în celulă, virusul creează vezicule membranare cu ajutorul membranelor intracelulare, de care sunt atașate complexe proteice speciale. Aceste complexe sintetizează o copie a ARN-ului genomic viral și ARNm scurte pentru sinteza proteinelor virale [24] .
ARN-ul virusului are un început 5’-metilat și o sfârșit 3’- poliadenilat . Acest lucru permite virusului să inițieze asamblarea proteinelor sale pe ARN-ul său de către ribozomii celulei, care nu este capabil să determine dacă este ARN-ul virusului sau ARN-ul pentru proteinele celulei în sine.
Coronavirusurile au un ARN de aproximativ 26-30 de mii de perechi de baze , ceea ce înseamnă că coronavirusurile au cel mai mare ARN nesegmentat dintre toate virusurile cunoscute, adică sunt cele mai complexe ca structură dintre virusurile cunoscute. Genomul virusului este format din peste 20.000 de nucleotide și codifică două poliproteine replicative pp1a și pp1ab [25] [26] , din care se formează o copie a ARN-ului virusului în următoarea trecere de replicare/traducere, precum și 8 șabloane separate de ARNm pentru proteine virale, care sunt infinit ele sunt generate. Generarea proteinelor M, S, HE și E care intră în învelișul lipidic membranar al virusului are loc pe ARNm -urile corespunzătoare din reticulul endoplasmatic al celulei; proteina N, care va înconjura ARN-ul genomic viral, este sintetizată pe ARNm care plutește în citoplasma celulară [24] .
-
Momentul atașării coronavirusului la receptorul celular : cuplarea proteinei S a „coroanei” virusului și a receptorului
-
Ciclul de viață al coronavirusului
-
Procesul de finalizare a asamblarii coronavirusului în citoplasma unei celule infectate. O capsidă este construită în jurul ARN-ului virusului
După ce primește ARN-ul genomic al virusului și proteinele sale necesare, acest ARN, învelit în proteina N, se apropie de proteinele care stau pe reticulul endoplasmatic și interacționează cu acestea. Ca urmare, membrana reticulului endoplasmatic cu proteinele virale din ea acoperă acest ARN, formând un virion [24] . Virionii sunt apoi eliberați din celula infectată prin exocitoză . După eliberarea virionilor din celulă, moare.
Taxonomie
Familia coronavirusurilor ( lat. Coronaviridae ) include 2 subfamilii și aproximativ 46 de specii [27] :
Subfamilia Letovirinae , izolată în 2018, include o singură specie acceptată, subgen și gen (cu toate acestea, au fost identificate încă două specii care nu au fost încă aprobate oficial):
Subfamilia Orthocoronavirinae
- Genul Alphacoronavirus ( Alphacoronavirus ), include 14 subgenuri și 19 specii:
- Colacovirus
- Lilieci coronavirus CDPHE15
- Decacovirus
- Lilieci coronavirus HKU10
- Rhinolophus ferrumequinum alfacoronavirus HuB-2013
- Duvinacovirus
- Luchacovirus
- Lucheng Rn coronavirus de șobolan
- Minacovirus
- Minunacovirus
- Miniopterus liliacul coronavirus 1
- Miniopterus liliacul coronavirus HKU8
- Miotacovirus
- Myotis ricketti alfacoronavirus Sax-2011
- Nyctacovirus
- Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013
- Pipistrellus kuhlii coronavirus 3398
- Pedacovirus
- Virusul diareei epidemice porcine
- Scotophilus liliacul coronavirus 512
- Rinacovirus
- Coronavirus liliac Rhinolophus HKU2
- Setracovirus
- Soracovirus
- Sorex araneus coronavirus T14
- sunacovirus
- Suncus murinus coronavirus X74
- Tegacovirus
- Genul Betacoronavirus ( Betacoronavirus ), include 5 subgenuri și 14 specii:
- Embecovirus
- Betacoronavirus 1
- China Rattus coronavirus HKU24
- Coronavirusul uman HKU1
- Coronavirus murin
- Myodes coronavirus 2JL14
- Hibecovirus
- Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013
- Merbecovirus
- Nobecovirus
- Eidolon liliac coronavirus C704
- Liliacul Rousettus coronavirus GCCDC1
- Liliacul Rousettus coronavirus HKU9
- Sarbecovirus
- Genul Gammacoronavirus ( Gammacoronavirus ), include 3 subgenuri și 6 specii:
- Brandacovirusul
- Coronavirus de gâscă CB17
- Cegacovirus
- Coronavirus balena Beluga SW1
- Igacovirus
- Coronavirus aviar
- Coronavirus aviar 9203
- Coronavirus de rață 2714
- Genul Deltacoronavirus ( Deltacoronavirus ), include 3 subgenuri și 7 specii:
- Andecovirus
- Buldecovirus
- Bulbul coronavirus HKU11
- Coronavirusul comun HKU21
- Coronavirus HKU15
- Munia coronavirus HKU13
- Coronavirus cu ochi albi HKU16
- Herdecovirus
- Stârcul de noapte coronavirus HKU19
Vezi și
Note
- ↑ Taxonomia Virușilor pe site-ul web al Comitetului Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV) .
- ↑ 1 2 Atlas de Microbiologie Medicală, Virologie și Imunologie: Manual pentru studenții la medicină / ed. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M . : Agenţia de Informaţii Medicale, 2003. - S. 121. - 236 p. — ISBN 5-89481-136-8 .
- ↑ 1 2 Shchelkanov M. Yu., Popova A. Yu., Dedkov V. G., Akimkin V. G., Maleev V. V. Istoria studiului și clasificării moderne a coronavirusurilor (Nidovirales: Coronaviridae) // Infecție și imunitate . - 2020. - T. 10 , nr 2 . - S. 221-246 . - doi : 10.15789/2220-7619-H0I-1412 . Arhivat din original pe 25 iunie 2020. (Rusă)
- ↑ Taxonomia Virușilor pe site-ul web al Comitetului Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV) . (Accesat: 19 iulie 2019)
- ↑ M. Yu. Șcelkanov, LV Kolobukhina, OA Burgasova, IS Kruzhkova, VV Maleev. COVID-19: etiologie, tablou clinic, tratament // Russian Journal of Infection and Immunity. — 2020-05-06. - T. 10 , nr. 3 . — S. 421–445 . — ISSN 2220-7619 2313-7398, 2220-7619 . - doi : 10.15789/2220-7619-CEC-1473 . Arhivat din original pe 3 aprilie 2022.
- ↑ Supotnitsky M. V. Noul coronavirus SARS-CoV-2 în aspectul epidemiologiei globale a infecțiilor cu coronavirus // Buletinul Trupelor de protecție a RCB. - 2020. - Vol. 4 , nr. 1 . - S. 32-65 .
- ↑ Istoria secretă a primului coronavirus Arhivat 22 aprilie 2020 la Wayback Machine // Forbes.
- ↑ Definiția coronavirusului de către Merriam-Webster . Merriam Webster. Preluat la 24 martie 2020. Arhivat din original la 23 martie 2020. (nedefinit)
- ↑ Definiția Corona de către Merriam-Webster . Merriam Webster. Preluat la 24 martie 2020. Arhivat din original la 24 martie 2020. (nedefinit)
- ↑ 1 2 Tyrrell, David Arthur John. Războaiele Rece : Lupta împotriva răcelii comune ] / David Arthur John Tyrrell, Michael Fielder. - Oxford University Press, 2002. - P. 96. - „Ne-am uitat mai atent la apariția noilor viruși și am observat că aveau un fel de aureolă în jurul lor. Recursul la un dicționar a produs echivalentul latin, corona, și astfel s-a născut numele coronavirus.” - ISBN 978-0-19-263285-2 . Arhivat pe 18 noiembrie 2020 la Wayback Machine
- ↑ 1 2 Almeida JD, Berry DM, Cunningham CH, Hamre D, Hofstad MS, Mallucci L, McIntosh K, Tyrrell DA (noiembrie 1968). Virologie: Coronavirus. natura . 220 (5168): 650. Bibcode : 1968Natur.220..650. . DOI : 10.1038/220650b0 . [A]i este, de asemenea, o „franjuri” caracteristică de proiecții 200 A lungi, care sunt rotunjite sau în formă de petală... Acest aspect, care amintește de corona solară, este împărtășit de virusul hepatitei la șoarece și de mai mulți virusuri recuperați recent de la om, și anume tulpina B814, 229E și alte câteva.
- ↑ Sturman LS, Holmes KV (01.01.1983). Lauffer MA, Maramorosch K, eds. „Biologia moleculară a coronavirusurilor” . Progrese în cercetarea virușilor . 28 :35-112. DOI : 10.1016/s0065-3527(08)60721-6 . ISBN 9780120398287 . PMC 7131312 . PMID 6362367 . Acești virusuri prezentau o margine caracteristică de peplomeri mari, distincti, în formă de petale sau vârfuri, care semăna cu o coroană, ca corona spinarum în arta religioasă; de unde și numele de coronavirus.
- ↑ Lalchhandama, Kholhring (2020). „Cronicile coronavirusurilor: bronșita, hepatita și răceala”. Viziunea științei _ ]. 20 (1):43-53. DOI : 10.33493/scivis.20.01.04 .
- ↑ Carstens EB (2010). „Votul de ratificare a propunerilor taxonomice către Comitetul Internațional pentru Taxonomia Virușilor (2009)” . Arhivele Virologiei . 155 (1): 133-46. DOI : 10.1007/s00705-009-0547-x . PMC 7086975 . PMID 19960211 .
- ↑ Fan Y, Zhao K, Shi ZL, Zhou P (martie 2019). Coronavirus lilieci în China . Virușii . 11 (3):210 . doi : 10.3390/ v11030210 . PMC 6466186 . PMID 30832341 .
- ↑ Comitetul Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV ) . talk.ictvonline.org . Preluat la 14 septembrie 2020. Arhivat din original la 20 martie 2020.
- ↑ Gilmutdinov R. Ya., Galiullin A. K., Spiridonov G. N. Infecții cu coronavirus ale păsărilor sălbatice // Doctor veterinar. - 2020. - Emisiune. 6 . - S. 57-67 . - doi : 10.33632/1998-698X.2020-6-57-67 .
- ↑ Pneumologie: un ghid național . - M. : GEOTAR-Media, 2009.
- ↑ Shirobokov V.P. Microbiologie medicală, virologie și imunologie . - Vinnitsa: Carte nouă, 2015. - S. 504-505.
- ↑ Korotyaev A.I. , Babichev S.A. Microbiologie medicală, imunologie și virologie . - Sankt Petersburg: SpecLit, 2008.
- ↑ Stasevici, 2020 , p. 11-12.
- ↑ Xintian Xu, Ping Chen, Jingfang Wang, Jiannan Feng, Hui Zhou. Evoluția noului coronavirus din focarul în curs de la Wuhan și modelarea proteinei sale pentru riscul de transmitere umană // SCIENCE CHINA Life Sciences. - 2020. - Vol. 63 . — P. 457–460 . - doi : 10.1007/s11427-020-1637-5 . Arhivat din original pe 28 iunie 2021.
- ↑ Stasevici, 2020 , p. 10-12.
- ↑ 1 2 3 Stasevici, 2020 , p. 12.
- ↑ Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology (engleză) / V. Thiel (editor). — Ed. I. – Caister Academic Press, 2007. - ISBN 978-1-904455-16-5 .
- ↑ Familie - Coronaviridae // Virus Taxonomy: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses / Andrew MQ King, Michael J. Adams, Eric B. Carstens, Elliot J. Lefkowitz (Eds.). - Elsevier Inc., 2012. - P. 806 -828. — ISBN 978-0-12-384684-6 . - doi : 10.1016/B978-0-12-384684-6.00068-9 .
- ↑ Depozitul de metadate viruși: versiunea 1 mai 2020; MSL35 // Comitetul Internațional pentru Taxonomia Virușilor (ICTV). - 2020. - 1 mai.
Literatură
- Coronavirusuri / Gorbalenya A. E. // Congo - Botez. - M .: Marea Enciclopedie Rusă, 2010. - S. 352. - ( Marea Enciclopedie Rusă : [în 35 de volume] / redactor-șef Yu. S. Osipov ; 2004-2017, v. 15). - ISBN 978-5-85270-346-0 .
- Stasevich K. Viața și structura coronavirusurilor // Știință și viață . - 2020. - Nr. 4 . - S. 8-13 . (Rusă)
- Shchelkanov M. Yu., Popova A. Yu., Dedkov V. G., Akimkin V. G., Maleev V. V. Istoria studiului și clasificării moderne a coronavirusurilor (Nidovirales: Coronaviridae) // Infecție și imunitate. - 2020. - T. 10. - Nr. 2. - S. 221-246. DOI: 10.15789/2220-7619-HOI-1412
- Shchelkanov M. Yu., Kolobukhina L. V., Burgasova O. A., Kruzhkova I. S., Maleev V. V. COVID-19: etiologie, clinică, tratament // Infecție și imunitate. - 2020. - T. 10. - Nr. 3. - S. 421-445. DOI: 10.15789/2220-7619-CEC-1473
Link -uri
Dicționare și enciclopedii |
|
---|
Taxonomie |
|
---|
În cataloagele bibliografice |
|
---|
Clasificarea virusurilor după Baltimore |
---|
ADN | I: virusuri |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Neclasificat | Naldaviricetes | |
---|
Neclasificat |
- familia : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Gen : Dinodnavirus
- Rizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: virusuri ADN |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | cosaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Neclasificat |
|
---|
|
|
|
---|
ARN | | IV: (+) virusuri ARN |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | hepelivirale |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Neclasificat |
- Familii : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
DIN | |
---|