Factori induși de hipoxie

Factorii inducibili de hipoxie , de asemenea, HIF-urile (abreviat din engleză Hypoxia -inducible factors ) sunt un grup de factori de transcripție care răspund la o scădere a cantității de oxigen din celule sau la hipoxie [1] [2] .  

Structura

Majoritatea, dacă nu toate, speciile vii aerobe exprimă complexul de transcripție HIF-1 extrem de conservat, care este un heterodimer compus din subunități alfa și beta, acesta din urmă fiind translocatorul nuclear al receptorului AHR ( ARNT ) exprimat constitutiv [3] [4] . HIF-1 aparține subfamiliei PER-ARNT-SIM (PAS) a familiei de bază a factorilor de transcripție bazați pe motivul helix-loop-helix ( bHLH ). Subunitățile alfa și beta sunt similare structural și ambele conțin următoarele domenii [5] [6] [7] :

Factorul-1 indus de hipoxie

Structura complexului HIF-1α-pVHL-ElonginB-ElonginC. [opt]
Identificatori
Simbol HIF-1
Pfam PF11413
Structuri proteice disponibile
Pfam structurilor
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum Model 3D
Regiunea de transactivare C-terminală HIF-1α

Structura HIF-1α . [9]
Identificatori
Simbol HIF-1a_CTAD
Pfam PF08778
InterPro IPR014887
SCOP 1l3e
SUPERFAMILIE 1l3e
Structuri proteice disponibile
Pfam structurilor
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum Model 3D

Membrii familiei

Tabelul enumeră membrii familiei umane HIF:

titlu gena proteină
HIF-1a HIF1A Factorul 1 inductibil de hipoxie , subunitatea alfa
HIF-1p ARNT Translocator nuclear AHR
HIF-2a EPAS1 Proteina endotelială din domeniul PAS1
HIF-2p ARNT2 Translocator nuclear 2 receptor AHR
HIF-3a HIF3A Factorul 3 inductibil de hipoxie , subunitatea alfa
HIF-3p ARNTL Translocator nuclear 3 receptor AHR

Funcții efectuate

Cascada de semnalizare HIF mediază efectele hipoxiei, o stare de concentrație scăzută de oxigen care afectează celula. Hipoxia previne adesea diferențierea celulară . Cu toate acestea, hipoxia promovează formarea vaselor de sânge și este esențială pentru formarea sistemului vascular în embrioni și tumori maligne . Hipoxia în răni favorizează, de asemenea, migrarea keratinocitelor și repararea epitelială [10] .

În general, HIF-urile sunt vitale pentru dezvoltare. La mamifere, deleția genelor HIF-1 are ca rezultat moartea perinatală. HIF-1 s-a dovedit a fi vital pentru supraviețuirea condrocitelor, permițând celulelor să se adapteze la mediul cu oxigen scăzut al osificării endocondriale în os. HIF joacă un rol central în reglarea metabolismului uman [11] .

Mecanism de acțiune

Subunitățile HIF alfa sunt hidroxilate la reziduurile de prolină conservate de HIF prolil hidroxilaze, ceea ce le permite să fie recunoscute și ubiquitinate de VHL ubiquitin -E3 ligaza, care le marchează pentru degradarea rapidă de către proteazomi [12] . Acest lucru se întâmplă doar în condiții normoxice. În condiții hipoxice, inhibitorul de prolil hidroxilază HIF este inhibat deoarece folosește oxigenul ca co-substrat (co-substrat) [13] .

Inhibarea transferului de electroni în complexul succinat dehidrogenază datorită mutațiilor în genele SDHB sau SDHD poate provoca acumularea de succinat , care inhibă proliferarea hidroxilazei HIF, stabilizând astfel HIF-1α. Această condiție se numește pseudohipoxie .

HIF-1, stabilizat de condițiile hipoxice, activează mai multe gene care promovează supraviețuirea în condiții de oxigen scăzut. Acestea includ enzimele glicolitice, care permit sinteza ATP într-o manieră independentă de oxigen și factorul de creștere a endoteliului vascular (VEGF), care promovează angiogeneza. HIF-1 acționează prin legarea la elementele care răspund la HIF (HRE) în promotorii care conțin secvența NCGTG (unde N este fie A, fie G).

S-a demonstrat că proteina antagonizantă a kinazei A musculare (mAKAP) recrutează ubiquitin E3 ligaza, influențând stabilitatea și poziționarea HIF-1 în locul său de acțiune nucleară. Depleția mAKAP sau întreruperea țintirii acestuia către regiunea perinucleară (în cardiomiocite ) modifică stabilitatea HIF-1 și activarea transcripțională a genelor asociate hipoxiei. Astfel, „compartimentarea” componentelor de semnalizare sensibile la oxigen poate influența răspunsul hipoxic [14] .

Cunoașterea avansată a mecanismelor de reglare moleculară a activității HIF1 în condiții hipoxice contrastează puternic cu lipsa de informații privind aspectele mecaniciste și funcționale care influențează reglarea mediată de NF-κB a HIF1 în condiții normoxice. Cu toate acestea, stabilizarea HIF-1α se găsește și în condiții non-hipoxice printr-un mecanism necunoscut până de curând. NF-kB (factorul nuclear κB) s-a dovedit a fi un modulator direct al expresiei HIF-1α în prezența presiunii normale a oxigenului. Studiile siRNA ( ARN mic de interferență ) pentru membrii individuali ai NF-kB au evidențiat efecte diferențiale la nivelul ARNm HIF-1α , indicând faptul că NF-kB poate regla expresia bazală a HIF-1α. În cele din urmă, s-a demonstrat că atunci când NF-kB endogen este indus de tratamentul cu TNF-α (factor de necroză tumorală α), nivelurile HIF-1α sunt, de asemenea, modificate într-o manieră dependentă de NF-kB [15] . HIF-1 și HIF-2 au roluri fiziologice diferite. HIF-2 reglează producția de eritropoietină la vârsta adultă [16] .

Note

  1. Smith TG, Robbins PA, Ratcliffe PJ Latura umană a factorului inductibil de hipoxie  // British  Journal of Hematology : jurnal. - 2008. - Mai ( vol. 141 , nr. 3 ). - P. 325-334 . - doi : 10.1111/j.1365-2141.2008.07029.x . — PMID 18410568 .
  2. Wilkins SE, Abboud MI, Hancock RL, Schofield CJ Targeting Protein-Protein Interactions in the HIF  System //  ChemMedChem : jurnal. - 2016. - Aprilie ( vol. 11 , nr. 8 ). - P. 773-786 . - doi : 10.1002/cmdc.201600012 . — PMID 26997519 .
  3. Wang GL, Jiang BH, Rue EA, Semenza GL Hipoxia-inductible factor 1 este un heterodimer bazic-helix-loop-helix-PAS reglat de tensiunea celulară de O2  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : jurnal. - 1995. - iunie ( vol. 92 , nr. 12 ). - P. 5510-5514 . - doi : 10.1073/pnas.92.12.5510 . — PMID 7539918 .
  4. Jiang BH, Rue E., Wang GL, Roe R., Semenza GL Dimerizarea, legarea ADN-ului și proprietățile de transactivare ale factorului inductibil de hipoxie 1  //  Jurnalul de chimie biologică  : jurnal. - 1996. - iulie ( vol. 271 , nr. 30 ). - P. 17771-17778 . doi : 10.1074 / jbc.271.30.17771 . — PMID 8663540 .
  5. Zhulin IB, Taylor BL, Dixon R. PAS domain S-boxes in Archaea, Bacteria and sensors for oxygen and redox  //  Trends in Biochemical Sciences : jurnal. - Cell Press , 1997. - Septembrie ( vol. 22 , nr. 9 ). - P. 331-333 . - doi : 10.1016/S0968-0004(97)01110-9 . — PMID 9301332 .
  6. Ponting CP, Aravind L. PAS: o familie de domenii multifuncționale vine la lumină  // Current Biology  : journal  . - Cell Press , 1997. - Noiembrie ( vol. 7 , nr. 11 ). - P.R674-7 . - doi : 10.1016/S0960-9822(06)00352-6 . — PMID 9382818 .
  7. ^ Yang J., Zhang L., Erbel PJ, Gardner KH, Ding K., Garcia JA, Bruick RK Functions of the Per/ARNT/Sim domains of the hypoxia-inductible factor  // The  Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2005. - octombrie ( vol. 280 , nr. 43 ). - P. 36047-36054 . - doi : 10.1074/jbc.M501755200 . — PMID 16129688 .
  8. Min JH, Yang H., Ivan M., Gertler F., Kaelin WG, Pavletich NP Structura unui complex HIF-1alpha -pVHL: recunoașterea hidroxiprolinei în semnalizare  //  Science : journal. - 2002. - iunie ( vol. 296 , nr. 5574 ). - P. 1886-1889 . - doi : 10.1126/science.1073440 . — PMID 12004076 .
  9. ↑ Freedman SJ, Sun ZY   , Poy F., Kung AL, Livingston DM, Wagner G., Eck MJ . Statele Unite ale Americii  : jurnal. - 2002. - Aprilie ( vol. 99 , nr. 8 ). - P. 5367-5372 . - doi : 10.1073/pnas.082117899 . — PMID 11959990 .
  10. Benizri E., Ginouvès A., Berra E. Magia cascadei de semnalizare a hipoxiei  // Cellular and Molecular Life Sciences  : journal  . - 2008. - Aprilie ( vol. 65 , nr. 7-8 ). - P. 1133-1149 . - doi : 10.1007/s00018-008-7472-0 . — PMID 18202826 .
  11. Formenti F., Constantin-Teodosiu D., Emmanuel Y., Cheeseman J., Dorrington KL, Edwards LM, Humphreys SM, Lappin TR, McMullin MF, McNamara CJ, Mills W., Murphy JA, O'Connor DF, Percy MJ, Ratcliffe PJ, Smith TG, Treacy M., Frayn KN, Greenhaff PL, Karpe F., Clarke K., Robbins PA Reglementarea metabolismului uman prin factor inductibil de hipoxie  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : jurnal. - 2010. - iulie ( vol. 107 , nr. 28 ). - P. 12722-12727 . - doi : 10.1073/pnas.1002339107 . — PMID 20616028 .
  12. Maxwell PH, Wiesener MS, Chang GW, Clifford SC, Vaux EC, Cockman ME, Wykoff CC, Pugh CW, Maher ER, Ratcliffe PJ Proteina supresoare de tumori VHL vizează factorii inducibili de hipoxie pentru proteoliza dependentă  de oxigen / - 1999. - Mai ( vol. 399 , nr. 6733 ). - P. 271-275 . - doi : 10.1038/20459 . — PMID 10353251 .
  13. Semenza GL Hydroxylation of HIF-1: oxygen sensing la nivel molecular  //  Physiology : journal. - 2004. - august ( vol. 19 , nr. 4 ). - P. 176-182 . - doi : 10.1152/physiol.00001.2004 . — PMID 15304631 .
  14. Wong W., Goehring AS, Kapiloff MS, Langeberg LK, Scott JD mAKAP compartimentează controlul dependent de oxigen al HIF-1alpha   // Science Signaling : jurnal. - 2008. - Decembrie ( vol. 1 , nr. 51 ). -P . ra18 . - doi : 10.1126/scisignal.2000026 . — PMID 19109240 .
  15. van Uden P., Kenneth NS, Rocha S. Reglarea factorului 1alpha inductibil de hipoxia de către NF-kappaB  //  The Biochemical Journal : jurnal. - 2008. - iunie ( vol. 412 , nr. 3 ). - P. 477-484 . - doi : 10.1042/BJ20080476 . — PMID 18393939 .
  16. Haase VH Reglarea hipoxică a eritropoiezei și metabolismului fierului  // American  Physiological Society : jurnal. - 2010. - iulie ( vol. 299 , nr. 1 ). -P.F1-13 ._ _ - doi : 10.1152/ajprenal.00174.2010 . — PMID 20444740 .