Carnitin palmitoiltransferaza I

Carnitin palmitoiltransferaza I
Structuri disponibile
PDBCăutare ortolog: PDBe RCSB
Identificatori
Simboluri CPT1A , carnitin palmitoiltransferază 1A (ficat), CPT1, CPT1-L, L-CPT1, carnitin palmitoiltransferază 1A
ID-uri externe OMIM: 600528 MGI: 1098296 HomoloGene: 1413 GeneCards: 1374
Boli ereditare conexe
Numele bolii Legături
obezitatea
dislipidemie
deficit de carnitin palmitoiltransferaza I
ortologii
feluri Uman Mouse
Entrez
Ansamblu
UniProt
RefSeq (ARNm)

NM_001031847
NM_001876

NM_013495

RefSeq (proteină)

NP_001027017
NP_001867

NP_038523

Locus (UCSC) Chr 11: 68,75 – 68,84 Mb Chr 19: 3,37 – 3,44 Mb
Căutare PubMed [5] [6]
Editare (uman)Editați (mouse)

Carnitina palmitoiltransferaza I , de asemenea carnitina aciltransferaza I , carnitina acil-CoA transferaza I sau palmitoil-CoA transferaza I ( Carnitine palmitoiltransferaza I , prescurtare CPT1  ) este o enzimă mitocondrială, una dintre formele carnitinei-O-palmitoiltransferazei ( 1EC221.3 . Arhivat 5 mai 2016 la Wayback Machine ), aparține familiei aciltransferazei [1] . Catalizează transferul unei grupări acil (-COR) de la o moleculă de acid gras acil-CoA cu un lanț lung de hidrocarburi la o moleculă de carnitină , cu formarea acilcarnitinei și a unei molecule de coenzimă A liberă . Adesea produsul reacției este palmitoilcarnitina (de unde și denumirea enzimei), cu toate acestea, alte resturi de acizi grași (grupe acil-COR) pot acționa și ca substrat [2] [3] . Una dintre mai multe enzime din sistemul de transport al carnitinei . Gena care codifică această enzimă este situată pe al 11-lea cromozom - CPT1A Arhivat 10 septembrie 2016 la Wayback Machine .

Există 3 izoforme ale enzimei: CPT1A, CPT1B și CPT1C. CPT1 este asociat cu membrana mitocondrială exterioară. Activitatea acestei enzime poate fi redusă de malonil-CoA (care este un inhibitor), un metabolit intermediar implicat în biosinteza acizilor grași. Carnitina palmitoiltransferaza I joacă un rol important în diferite tulburări metabolice, cum ar fi, de exemplu, diabetul . Cu toate acestea, structura cristalului este încă necunoscută, drept urmare mecanismul său exact de acțiune rămâne necunoscut.

Structura

CPT1 se referă la o proteină membranară integrală care este asociată cu membrana mitocondrială exterioară, prin regiunile transmembranare din lanțul peptidic. Ambele domenii terminale N- și C- sunt situate pe partea citoplasmatică a membranei [4] .

Toate cele trei izoforme ale enzimei se găsesc în țesuturile mamiferelor. Izoforma hepatică (CPT1A sau CPTI-L) este localizată în mitocondriile tuturor celulelor corpului, cu excepția celulelor musculare scheletice și a celulelor de țesut adipos brun [5] [6] . Izoforma musculară (CPT1B sau CPTI-M) este o proteină foarte exprimată produsă în miocardul inimii, celulele musculare scheletice (miocite) și celulele țesutului adipos maro [4] [5] [6] . A treia izoformă, cerebrală (CPT1C), a fost izolată în 2002 și este localizată predominant în creier și testicule . Se știu puține despre această formă [7] [8] .

Structura exactă a tuturor izoformelor CPT1 nu a fost încă determinată, deși au fost create modele in silico pe baza enzimelor CPT1 strâns legate - acilcarnitine transferaze, cum ar fi carnitina acetiltransferaza (CRAT) [9] .

O diferență structurală importantă între CPT1 și CPT2, CRAT și carnitin octanoiltransferaza (COT) este că CPT1 conține un domeniu suplimentar la capătul N-terminal de aproximativ 160 de aminoacizi . S-a descoperit că acest domeniu N-terminal suplimentar este important pentru molecula cheie inhibitoare a enzimei, malonil-CoA [10] .

Au fost propuse două situsuri de legare diferite care există în CPT1A și CPT1B. Situl A, sau situsul CoA , pare să leagă atât malonil-CoA, cât și palmitoil-CoA, precum și alte molecule care conțin coenzima A. Se crede că enzima leagă aceste molecule prin interacțiunea cu un fragment de coenzimă. S-a sugerat că malonil-CoA se poate comporta ca un inhibitor competitiv al CPT1A la acest loc. În al doilea, site-ul O , se crede că malonil-CoA se leagă mult mai strâns decât în ​​site-ul A. Spre deosebire de situsul A , situsul O se leagă de malonil-CoA prin gruparea malonat dicarbonil [11] . Legarea malonil-CoA la enzimă de către situsurile A și O inhibă acțiunea CPT1A prin eliminarea legării carnitinei de către enzimă.

Mecanismul de reacție

Din cauza lipsei de date privind structura cristalină a enzimei, mecanismul exact al catalizei CPT1 este încă necunoscut. Au fost postulate câteva mecanisme posibile diferite pentru CPT1, ambele implicând un reziduu de histidină , His473 , care servește drept situs catalitic cheie. Un astfel de mecanism se bazează pe modelul carnitin acetiltransferazei prezentat mai jos, în care reziduul His473 deprotonează carnitina în timp ce restul de serină adiacent stabilizează intermediarul tetraedric al oxianionului.


Un alt mecanism se bazează pe presupunerea că există o așa-numită triadă catalitică, constând din resturi de aminoacizi Cys-305 , His-473 și Asp-454 , care efectuează transferul catalitic de acil [12] . Acest mecanism catalitic implică formarea unei enzime tioacil covalente intermediare cu Cys-305.

Funcții biologice

Sistemul carnitin palmitoil transferază este un pas important în beta-oxidarea acizilor grași cu lanț lung. Acizii grași cu lanț lung, precum palmitoil-CoA, spre deosebire de acizii grași cu lanț scurt și mediu, nu pot difuza liber prin membrana mitocondrială interioară (este impermeabilă), pentru această tranziție există o navetă de carnitină care îi transportă în matrice. [13] .

Carnitina palmitoiltransferaza I este prima componentă a sistemului și reacția chimică care limitează viteza a sistemului de transport al carnitinei , catalizând transferul grupării acil de la coenzima A la carnitină cu formarea palmitoilcarnitinei. Cu ajutorul unei translocaze ( carnitin-acilcarnitine translocaza , CACT), palmitoilcarnitina este transferată prin difuzie facilitată ( antiport ) prin membrana mitocondrială internă în matrice.

Acționând ca un acceptor de grupare acil, carnitina poate juca, de asemenea, un rol în reglarea coenzimei A intracelulare: raportul acil-CoA/CoA [14] .

Regulamentul

CPT1 este inhibată de malonil-CoA, deși mecanismul exact de inhibare rămâne necunoscut. Mușchiul scheletic și izoforma miocardică CPT1 (CPT1B) s-a dovedit a fi de 30-100 de ori mai sensibile la inhibarea malonil-CoA decât izoforma CPT1A analogă. Această inhibiție este o țintă bună pentru încercările viitoare de reglare a CPT1 în tratamentul tulburărilor metabolice [15] .

Acetil-CoA carboxilaza (ACC), o enzimă care catalizează formarea malonil-CoA din acetil-CoA, joacă un rol important în reglarea metabolismului acizilor grași . Oamenii de știință au demonstrat că șoarecii knockout ACC2 au dus la o reducere a grăsimii și a greutății în comparație cu șoarecii de tip sălbatic. Acesta este rezultatul activității reduse a ACC, care determină o scădere ulterioară a concentrațiilor de malonil-CoA. Aceste niveluri reduse de malonil-CoA previn, la rândul lor, inhibarea CPT1, rezultând o creștere marginală a oxidării acizilor grași [16] . Deoarece inima și celulele musculare scheletice au o capacitate scăzută de a sintetiza acizi grași, ACC poate acționa exclusiv ca o enzimă de reglare în aceste celule.

Semnificație medicală

La om, a fost descris doar deficitul de „CPT1A” (deficit de carnitin palmitoiltransferaza I) [17] . Aceasta este o boală rară caracterizată prin riscuri mari de a dezvolta hipoglicemie hipoketonimică, convulsii, encefalopatie hepatică și moarte subită a sugarului la nou-născuți [18] .

CPT1 este, de asemenea, asociat cu diabetul zaharat de tip 2 și rezistența la insulină .

O nouă cercetare prezentată la congresul din 2015 al Comitetului European pentru Tratarea și Cercetarea Sclerozei Multiplă (ECTRIMS) sugerează că CPT1 poate juca și un rol în patologia sclerozei multiple (SM) [19] . Cercetătorii au descoperit că mutațiile din gena CPT1 par să protejeze împotriva sclerozei multiple la anumite populații. Această ipoteză este că o creștere a metabolismului lipidic poate duce la demielinizarea celulelor nervoase (distrugerea mielinei ), permițând astfel un atac autoimun asupra celulelor nervoase. Dr. John Dirk Nyland și colegii de la Universitatea Aalborg din Danemarca au furnizat date care arată că în modelele animale de SM, CPT1 este blocat de o moleculă numită etomoxir, cel mai probabil pentru a atenua simptomele bolii [20] . Cercetătorii caută în prezent sprijin pentru un studiu clinic la persoanele bolnave.

Interacțiuni cu alte proteine

Se știe că CPT1 interacționează cu o varietate de proteine, inclusiv cele din familia NDUF , PKC1 și ENO1 [21] .

Knockout CPT1A prin screeningul bibliotecii shRNA inhibă replicarea HIV-1 în celulele T Jurkat cultivate [22] .

Note

  1. Jogl G., Tong L. Structura cristalină a carnitinei acetiltransferazei și implicații pentru mecanismul catalitic și transportul acizilor grași  // Cell  :  journal. - Cell Press , 2003. - Ianuarie ( vol. 112 , nr. 1 ). - P. 113-122 . - doi : 10.1016/S0092-8674(02)01228-X . — PMID 12526798 .
  2. van der Leij FR, Huijkman NC, Boomsma C., Kuipers JR, Bartelds B.  Genomics of the human carnitine aciltransferase genes  // Molecular Genetics and Metabolism : jurnal. - 2000. - Vol. 71 , nr. 1-2 . - P. 139-153 . - doi : 10.1006/mgme.2000.3055 . — PMID 11001805 .
  3. Bonnefont JP, Djouadi F., Prip-Buus C., Gobin S., Munnich A., Bastin J. Carnitine palmitoyltransferases 1 and 2: biochemical, molecular and medical aspects   // Molecular Aspects of Medicine : jurnal. - 2004. - Vol. 25 , nr. 5-6 . - P. 495-520 . - doi : 10.1016/j.mam.2004.06.004 . — PMID 15363638 .
  4. 1 2 Yamazaki N., Yamanaka Y., Hashimoto Y., Shinohara Y., Shima A., Terada H. Caracteristici structurale ale genei care codifică tipul muscular uman carnitina palmitoiltransferaza I  //  FEBS Letters : jurnal. - 1997. - iunie ( vol. 409 , nr. 3 ). - P. 401-406 . - doi : 10.1016/S0014-5793(97)00561-9 . — PMID 9224698 .
  5. 1 2 Brown NF, Hill JK, Esser V., Kirkland JL, Corkey BE, Foster DW, McGarry JD Adipocitele albe de șoarece și celulele 3T3-L1 prezintă un model anormal al expresiei izoformei carnitine palmitoiltransferazei (CPT) I în timpul diferențierii. Expresia inter-țesut și interspecie a enzimelor CPT I și CPT II  //  The Biochemical Journal : jurnal. - 1997. - octombrie ( vol. 327 (Pt 1) ). - P. 225-231 . — PMID 9355756 .
  6. 1 2 Lee J., Ellis JM, Wolfgang MJ Oxidarea acizilor grași adipoși este necesară pentru termogeneză și potențează inflamația indusă de stresul oxidativ  //  Cell Reports : jurnal. - 2015. - ianuarie ( vol. 10 , nr. 2 ). - P. 266-279 . - doi : 10.1016/j.celrep.2014.12.023 . — PMID 25578732 .
  7. ^ Price N., van der Leij F., Jackson V., Corstorphine C., Thomson R., Sorensen A., Zammit V. A roman brain-expressed protein related to carnitine palmitoyltransferase I  // Genomics  :  journal . - Academic Press , 2002. - Octombrie ( vol. 80 , nr. 4 ). - P. 433-442 . - doi : 10.1006/geno.2002.6845 . — PMID 12376098 .
  8. Lavrentyev EN, Matta SG, Cook GA Expresia a trei izoforme carnitine palmitoiltransferaze-I în 10 regiuni ale creierului șobolanului în timpul hrănirii, postului și diabetului  // Comunicații de cercetare  biochimică și biofizică : jurnal. - 2004. - Februarie ( vol. 315 , nr. 1 ). - P. 174-178 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.01.040 . — PMID 15013442 .
  9. Morillas M., López-Viñas E., Valencia A., Serra D., Gómez-Puertas P., Hegardt FG, Asins G. Structural model of carnitine palmitoyltransferase I based on the  The//carnitine acetiltransferase crystal  : jurnal. - 2004. - Mai ( vol. 379 , nr. Pt 3 ). - P. 777-784 . - doi : 10.1042/BJ20031373 . — PMID 14711372 .
  10. Woldegiorgis G., Dai J., Arvidson D. Structure-Function Studies with the Mitochondrial Carnitine Palmitoyltransferases I and II  //  Monatshefte fur Chemie : journal. - 2005. - Vol. 136 , nr. 8 . - P. 1325-1340 . - doi : 10.1007/s00706-005-0334-7 .
  11. López-Viñas E., Bentebibel A., Gurunathan C., Morillas M., de Arriaga D., Serra D., Asins G., Hegardt FG, Gómez-Puertas P. Definition by functional and structural analysis of two malonyl- Site-uri CoA în carnitina palmitoiltransferaza 1A  (engleză)  // Jurnalul de chimie biologică  : jurnal. - 2007. - iunie ( vol. 282 , nr. 25 ). - P. 18212-18224 . - doi : 10.1074/jbc.M700885200 . — PMID 17452323 .
  12. Liu H., Zheng G., Treber M., Dai J., Woldegiorgis G. Mutageneza prin scanare cu cisteină a carnitinei palmitoiltransferazei musculare I dezvăluie că un singur reziduu de cisteină (Cys-305) este important pentru  cataliză  The//  : jurnal. - 2005. - Februarie ( vol. 280 , nr. 6 ). - P. 4524-4531 . - doi : 10.1074/jbc.M400893200 . — PMID 15579906 .
  13. Berg JM, Tymoczo JL, Stryer L, „Biochemistry”, ediția a 6-a 2007
  14. Jogl G., Hsiao YS, Tong L. Structure and function of carnitine aciltransferases  //  Analele Academiei de Științe din New York : jurnal. - 2004. - noiembrie ( vol. 1033 , nr. 1 ). - P. 17-29 . - doi : 10.1196/annals.1320.002 . — PMID 15591000 .
  15. Shi J., Zhu H., Arvidson DN, Woldegiorgis G. Primele 28 de reziduuri de aminoacizi N-terminale ale carnitinei palmitoiltransferazei I ale mușchiului cardiac uman sunt esențiale pentru sensibilitatea malonil CoA și legarea de mare afinitate  //  Biochimie : jurnal. - 2000. - Februarie ( vol. 39 , nr. 4 ). - P. 712-717 . doi : 10.1021 / bi9918700 . — PMID 10651636 .
  16. Abu-Elheiga L., Oh W., Kordari P., Wakil SJ Șoarecii mutanți de acetil-CoA carboxilază 2 sunt protejați împotriva obezității și diabetului indus de dietele bogate în grăsimi/cu conținut ridicat de carbohidrați   // Proceedings of the National Academy of Sciences of Statele Unite ale Americii  : jurnal. - 2003. - Septembrie ( vol. 100 , nr. 18 ). - P. 10207-10212 . - doi : 10.1073/pnas.1733877100 . — PMID 12920182 .
  17. Ogawa E., Kanazawa M., Yamamoto S., Ohtsuka S., Ogawa A., Ohtake A., Takayanagi M., Kohno Y. Analiza expresiei a două mutații în deficiența carnitinei palmitoiltransferazei IA  //  Journal of Human Genetics : jurnal. - 2002. - Vol. 47 , nr. 7 . - P. 342-347 . - doi : 10.1007/s100380200047 . — PMID 12111367 .
  18. Collins SA, Sinclair G., McIntosh S., Bamforth F., Thompson R., Sobol I., Osborne G., Corriveau A., Santos M., Hanley B., Greenberg CR, Vallance H., Arbor L. Prevalența carnitinei palmitoiltransferazei 1A (CPT1A) P479L la nou-născuții vii din Yukon, Teritoriile de Nord-Vest și Nunavut  // Genetică  moleculară și metabolism : jurnal. - 2010. - Vol. 101 , nr. 2-3 . - P. 200-204 . - doi : 10.1016/j.ymgme.2010.07.013 . — PMID 20696606 .
  19. Wilner, AN (1 decembrie 2015), Exploring a New Mechanism of action for MS Drugs, An Expert Interview With John Dirk Nieland, PhD , Medscape , < http://www.medscape.com/viewarticle/854957 > . Preluat la 3 decembrie 2015. Arhivat 25 mai 2016 la Wayback Machine 
  20. Nieland JD Nieland JG Mørkholt AS Bolther L Nielsen S (7–10 octombrie 2015), Rezumat P1497. Mutația CPT1a deschide calea pentru noi medicamente pentru tratamentul sclerozei multiple, al 31-lea Congres al Comitetului European pentru Tratament și Cercetare în Scleroza Multiplă (ECTRIMS), Barcelona, ​​​​Spania, Programul Final 
  21. Havugimana PC, Hart GT, Nepusz T., Yang H., Turinsky AL, Li Z., Wang PI, Boutz DR, Fong V., Phanse S., Babu M., Craig SA, Hu P., Wan C. , Vlasblom J., Dar VU, Bezginov A., Clark GW, Wu GC, Wodak SJ, Tillier ER, Paccanaro A., Marcotte EM, Emili A. Acensus of human soluble protein complexes  (engleză)  // Cell . - Cell Press , 2012. - August ( vol. 150 , nr. 5 ). - P. 1068-1081 . - doi : 10.1016/j.cell.2012.08.011 . — PMID 22939629 .
  22. Yeung ML, Houzet L., Yedavalli VS, Jang KT Un screening ARN scurt la nivelul genomului a celulelor T jurkat pentru proteine ​​umane care contribuie la replicarea productivă a HIV-1  // The  Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2009. - iulie ( vol. 284 , nr. 29 ). - P. 19463-19473 . - doi : 10.1074/jbc.M109.010033 . — PMID 19460752 .

Vezi și