Tulpina SARS-CoV-2 beta

Versiunea actuală a paginii nu a fost încă examinată de colaboratori experimentați și poate diferi semnificativ de versiunea revizuită la 9 iunie 2022; verificările necesită 2 modificări .

Tulpina SARS-CoV-2 beta a coronavirusului [1] , cunoscută și sub numele de descendența 501.V2, 20C/501Y.V2 sau B.1.351 [ ]2 [4] ) este o tulpină a SARS-CoV- 2 virus care provoacă COVID-19 . Această tulpină a fost detectată pentru prima dată în districtul Nelson Mandela Bay [5] din Eastern Cape al Africii de Sud [6] , după cum a raportat Ministerul Sănătății din Africa de Sud la 18 decembrie 2020 [7] .

Tulpina

Cercetătorii și oficialii au raportat că prevalența acestei tulpini a fost mai mare în rândul tinerilor fără afecțiuni medicale subiacente și, în comparație cu alte tulpini, este mai probabil să conducă la boli grave în astfel de cazuri. Ministerul Sănătății din Africa de Sud a indicat, de asemenea, că această tulpină ar putea conduce la cel de-al doilea val al pandemiei de COVID-19 în țară, deoarece tulpina se răspândește mai rapid decât alte tulpini anterioare ale virusului.

Oamenii de știință au observat că această tulpină conține mai multe mutații care îi permit să se atașeze mai ușor la celulele umane datorită a trei mutații în domeniul de legare la receptor (RBD) în glicoproteina spike a virusului: N501Y (aminoacidul asparagina (N) este înlocuit de aminoacidul tirozină (Y) în poziţia 501), K417N şi E484K. Două dintre aceste mutații (E484K și N501Y) sunt în motivul de legare la receptor (RBM) al domeniului de legare la receptor (RBD).

Mutația N501Y a fost găsită și în tulpina 202012/01 , care este distribuită pe scară largă în Marea Britanie. Alte două mutații găsite în 501.V2, E484K și K417N, sunt absente în tulpina britanică. În plus, 501.V2 nu are mutația 69-70del găsită la o altă tulpină.

Descoperire

Noua tulpină a fost descoperită prin secvențierea întregului genom. Mai multe secvențe genomice din această linie au fost trimise în baza de date de secvențe genetice GISAID, de exemplu secvența EPI_ISL_678597.

Distribuție internațională

Pe 23 decembrie, Matt Hancock a anunțat că două persoane care au călătorit din Africa de Sud în Marea Britanie au fost infectate cu 501.V2. Pe 28 decembrie, această tulpină a fost găsită la două persoane din Elveția și o persoană din Finlanda. Pe 29 decembrie, tulpina a fost detectată la un călător din Africa de Sud în Japonia și la un călător internațional din Queensland, Australia. Pe 30 decembrie, tulpina a fost detectată în Zambia. Pe 31 decembrie, acesta a fost găsit și în Franța pe un pasager care se întorcea din Africa de Sud. Pe 2 ianuarie 2021, în Coreea de Sud a fost detectat primul caz de infecție cu această tulpină. Austria a raportat primul său caz de infecție cu tulpină, precum și patru cazuri de infecție cu tulpina britanică pe 4 ianuarie. Pe 8 ianuarie 2021, Irlanda a raportat descoperirea a 3 cazuri de această tulpină, toate asociate cu călătoriile din Africa de Sud.

În Rusia, această tulpină a fost identificată pentru prima dată în martie 2021 [8] .

Insensibilitate la vaccin

Pe 4 ianuarie 2021, The Telegraph a raportat că imunologul de la Oxford Sir John Bell consideră că noua tulpină sud-africană ridică o „întrebare mare”, deoarece ar putea fi rezistentă la vaccinuri, spulberând astfel speranțele și înlocuindu-le cu frică [9] . În aceeași zi, profesorul de vaccinologie Shabir Madhi a declarat pentru CBS News că nu există nicio certitudine că noua tulpină 501.V2 va putea „ocoli” protecția vaccinului, dar consideră că acesta „ar putea fi mai puțin eficient” [10]. ] . Mutații suplimentare în proteina spike din tulpina 501.V2 au fost citate de profesorul asociat de microbiologie celulară la Universitatea Reading, Simon Clarke, ca fiind o îngrijorare, deoarece „pot face virusul mai puțin susceptibil la răspunsul imun provocat de vaccin”. Lawrence Young, virolog la Universitatea din Warwick, a remarcat, de asemenea, că mutațiile multiple ale acestei tulpini „pot duce la o oarecare scăpare din apărarea imună” [11] .

Unele studii arată scăparea acestei tulpini dintr-un anticorp multiclonal neutralizant care vizează proteina spike SARS-CoV-2 [12] [13] .

Ugur Sahin, directorul executiv al BioNTech , a declarat că sunt necesare cercetări suplimentare pentru a se asigura că vaccinul actual al companiei funcționează împotriva tulpinii 501.V2, totuși, dacă vaccinul trebuie ajustat, compania poate face acest lucru în aproximativ 6 săptămâni . 14] .

Pe 8 ianuarie, The Guardian a raportat că vaccinul COVID-19 de la Pfizer și BioNTech a arătat în teste care implică 20 de teste de sânge că este capabil să ofere protecție împotriva tulpinii 501.V2. Sunt necesare cercetări suplimentare pentru a stabili gradul exact de protecție [15] .

Moderna plănuiește să testeze o nouă versiune a vaccinului său , special modificată pentru a proteja împotriva tulpinii 501.V2 [16] , Novavax ia măsuri similare [17] . Potrivit unui studiu clinic al vaccinului Ad26.COV2.S realizat de Johnson & Johnson, eficacitatea acestuia în Africa de Sud este cu 15% mai mică decât în ​​Statele Unite (57%, respectiv 72%); diferența este probabil legată de prevalența tulpinii 501.V2 în Africa de Sud [18] . Un alt studiu de vaccin ( NVX-CoV2373 de Novavax) a arătat [17] [19] 60% eficacitate (la participanții HIV negativi) în Africa de Sud, comparativ cu 90% eficacitate în Marea Britanie. Potrivit Reuters, vaccinul Pfizer este doar puțin mai puțin eficient împotriva 501.V2 [20] . AstraZeneca plănuiește să își adapteze vaccinul la această tulpină, iar noul vaccin ar trebui să fie gata până în toamna anului 2021 [21] .

Pe 24 februarie 2021, Moderna a anunțat începerea studiilor clinice pentru o nouă versiune a vaccinului său. Noua versiune este concepută special pentru a combate 501.V2 [22] [23] .

Mutația E484K

O modificare a aminoacidului E484K, o mutație a domeniului de legare la receptor (RBD), a fost raportată a fi „asociată cu evadarea anticorpilor neutralizanți”, ceea ce poate afecta negativ eficacitatea vaccinurilor COVID care vizează proteina spike [24] [25 ]. ] . Mutația cu vârf E484K a fost asociată cu un caz de reinfecție cu tulpina 501.V2 SARS-CoV-2 în Brazilia, care, potrivit cercetătorilor, a fost primul astfel de caz de reinfecție cu o tulpină care conține această mutație. [26] .

Statistici

Cazuri în funcție de țară (începând cu 9 ianuarie 2021)
Țară Cazuri confirmate data Surse
Marea Britanie 2 23 decembrie 2020 [27]
Elveţia 2 28 decembrie 2020 [28]
Finlanda unu 28 decembrie 2020 [29]
Japonia unu 29 decembrie 2020 [treizeci]
Australia unu 29 decembrie 2020 [31]
Zambia unu 30 decembrie 2020 [32]
Franţa unu 31 decembrie 2020 [33]
Coreea de Sud unu 2 ianuarie 2021 [34]
Austria unu 4 ianuarie 2021 [35]
Irlanda 3 8 ianuarie 2021 [36]
Canada unu 8 ianuarie 2021 [37]
La nivel mondial (alte 11 țări) cincisprezece

Vezi și

Note

  1. ↑ OMS a decis să numească tulpinile de coronavirus cu literele alfabetului grecesc . „Variantele coronavirusului COVID-19 vor fi notate cu literele alfabetului grecesc, pentru a nu face discriminare între țările în care aceste tulpini au fost descoperite pentru prima dată și pentru ușurința pronunției în conversațiile non-științifice, Organizația Mondială a Sănătății ( Care a spus. În cadrul noului sistem, tulpina „britanică” a coronavirusului B.1.1.7 va fi numită „Alpha”, varianta B.1.351, descoperită pentru prima dată în Africa de Sud, va deveni „Beta”, iar brazilianul P.1 - „ Gamma". Cele două subspecii ale tulpinii "indiene" de coronavirus - B.1.617.2 și B.1.617.1 - vor fi numite "Delta" și, respectiv, "Kappa". Preluat la 28 iunie 2021. Arhivat din original la 28 iunie 2021.
  2. ↑ CDC. Boala cu coronavirus 2019 (COVID-19  )  ? . Centrele pentru Controlul și Prevenirea Bolilor (11 februarie 2020). Preluat la 9 ianuarie 2021. Arhivat din original la 15 mai 2021.
  3. ↑ Tulpina africană de coronavirus a pus sub semnul întrebării eficacitatea vaccinurilor . www.mk.ru _ Preluat la 9 ianuarie 2021. Arhivat din original la 11 ianuarie 2021.
  4. ↑ O nouă tulpină de coronavirus „sud-africană” ajunge în Franța . lenta.ru . Preluat la 9 ianuarie 2021. Arhivat din original la 4 ianuarie 2021.
  5. ↑ SA atinge pragul sumbru de 1 milion de cazuri de Covid-19  . www.iol.co.za. _ Preluat la 9 ianuarie 2021. Arhivat din original la 26 mai 2021.
  6. ↑ Covid: Africa de Sud a trecut de un milion de infecții pe măsură ce cazurile cresc , BBC News  (28 decembrie 2020). Arhivat din original pe 11 februarie 2021. Preluat la 9 ianuarie 2021.
  7. ↑ Fink, Sheri . Africa de Sud anunță o nouă variantă de coronavirus. , The New York Times  (18 decembrie 2020). Arhivat din original pe 21 decembrie 2020. Preluat la 9 ianuarie 2021.
  8. ↑ Tulpini de coronavirus COVID-19 identificate în Rusia - RIA Novosti, 21.10.2021
  9. ↑ Knapton, Sarah . Varianta sud-africană poate sustrage vaccinurile și testele, avertizează oamenii de știință , The Telegraph  (4 ianuarie 2021). Arhivat din original pe 15 decembrie 2021. Preluat la 5 ianuarie 2021.
  10. ↑ Vaccinurile COVID „s-ar putea să nu funcționeze” la fel de bine pe tulpina sud-africană,   avertizează oamenii de știință ? . www.cbsnews.com . Preluat la 5 ianuarie 2021. Arhivat din original la 3 decembrie 2021.
  11. ↑ Oamenii de știință din Marea Britanie se tem că vaccinurile ar putea să nu protejeze împotriva variantei de coronavirus găsite în Africa de Sud | CBC News , CBC . Arhivat din original pe 5 ianuarie 2021. Preluat la 5 ianuarie 2021.
  12. ↑ Yiska Weisblum, Fabian Schmidt, Fengwen Zhang, Justin DaSilva, Daniel Poston. Evadare de anticorpii neutralizanți de către variantele proteinei spike SARS-CoV-2  // eLife. - T. 9 . — ISSN 2050-084X . - doi : 10.7554/eLife.61312 . Arhivat din original pe 3 ianuarie 2021.
  13. ↑ Raport scurt: O nouă tulpină variantă a SARS-CoV-2 identificată la călători din Brazilia . Preluat la 24 ianuarie 2021. Arhivat din original la 15 ianuarie 2021.
  14. ↑ Vaccinul BioNTech pentru noua variantă COVID-19 ar putea fi gata în 6  săptămâni . euronews (22 decembrie 2020). Preluat la 5 ianuarie 2021. Arhivat din original la 8 ianuarie 2021.
  15. ↑ Geddes, Linda . Vaccinul Pfizer protejează împotriva noilor variante de Covid, sugerează un studiu , The Guardian  (8 ianuarie 2021). Arhivat din original pe 8 ianuarie 2021. Preluat la 9 ianuarie 2021.
  16. ↑ Grady, Denise . Moderna spune că vaccinul încă protejează împotriva variantelor de virus , The New York Times  (25 ianuarie 2021). Arhivat din original pe 25 ianuarie 2021. Preluat la 25 ianuarie 2021.
  17. ↑ 1 2 Vaccinul Novavax COVID-19 demonstrează o eficacitate de 89,3% în studiul de fază 3 din Regatul Unit | Novavax Inc. - Site IR  (engleză) . www.novavax.com . Preluat la 30 ianuarie 2021. Arhivat din original la 6 iunie 2021.
  18. ↑ Johnson & Johnson raportează despre eficacitatea vaccinului său împotriva COVID-19 . RBC . Preluat la 29 ianuarie 2021. Arhivat din original la 29 ianuarie 2021.
  19. ↑ Novavax urcă după rezultatele optimiste ale testului vaccinului Covid , Bloomberg.com  (28 ianuarie 2021). Arhivat din original pe 29 ianuarie 2021. Preluat la 29 ianuarie 2021.
  20. ↑ Geddes, Linda . Vaccinul Pfizer protejează împotriva noilor variante de Covid, sugerează un studiu , The Guardian  (8 ianuarie 2021). Arhivat din original pe 8 ianuarie 2021. Preluat la 1 februarie 2021.
  21. ↑ AstraZeneca adaptează vaccinul pentru a lupta împotriva tulpinii sud-africane de COVID-19 . RBC . Preluat la 12 februarie 2021. Arhivat din original la 13 februarie 2021.
  22. ↑ Moderna a anunțat dezvoltarea unui vaccin împotriva tulpinii sud-africane de COVID-19 - Interfax . Preluat la 26 februarie 2021. Arhivat din original la 27 februarie 2021.
  23. ↑ Berkeley Lovelace Jr. Moderna va începe studiile clinice ale vaccinurilor de rapel Covid pentru varianta din Africa de Sud, trimite la NIH pentru studiu  . CNBC (24 februarie 2021). Preluat la 26 februarie 2021. Arhivat din original la 25 februarie 2021.
  24. ↑ O nouă mutație a virusului ridică  întrebări despre vaccin . Franța 24 (13 ianuarie 2021). Preluat la 24 ianuarie 2021. Arhivat din original la 31 august 2021.
  25. ↑ Ewen Callaway. Noile variante COVID ar putea submina vaccinurile? Laboratoarele se chinuie să afle   // Natura . — 2021-01-07. — Vol. 589 , iss. 7841 . — P. 177–178 . - doi : 10.1038/d41586-021-00031-0 . Arhivat din original pe 20 decembrie 2021.
  26. ↑ Brito, Ricardo . Varianta de coronavirus din Africa de Sud detectată în caz de reinfecție în Brazilia , Reuters  (9 ianuarie 2021). Arhivat din original pe 28 ianuarie 2021. Preluat la 24 ianuarie 2021.
  27. ↑ Cazuri confirmate de variantă COVID-19 din Africa de Sud identificate în Marea Britanie . Guvernul Regatului Unit . Preluat la 23 decembrie 2020. Arhivat din original la 23 decembrie 2020.
  28. ↑ Varianta de Covid din Africa de Sud descoperită în Elveția . insider de afaceri . Preluat la 29 decembrie 2020. Arhivat din original la 19 noiembrie 2021.
  29. ↑ Actualizare: Noi tulpini de Covid variante din Marea Britanie, Africa de Sud au fost detectate în Finlanda . Yle News . Preluat la 29 decembrie 2020. Arhivat din original la 31 octombrie 2021.
  30. ↑ Varianta de coronavirus din Africa de Sud găsită în   Japonia ? . Știri24 . Preluat la 29 decembrie 2020. Arhivat din original la 19 noiembrie 2021.
  31. ↑ Primul caz de tulpină de coronavirus „mai contagioasă” detectat în Australia . 9 News (29 decembrie 2020). Preluat la 9 ianuarie 2021. Arhivat din original la 19 noiembrie 2021.
  32. ↑ Zambia se confruntă cu al doilea val de Covid-19 ca variantă legată de o nouă tulpină în Africa de Sud izolat  , Luksaka Times (  30 decembrie 2020). Arhivat din original pe 7 ianuarie 2021. Preluat la 9 ianuarie 2021.
  33. ↑ Franța a detectat primul său caz de variantă sud-africană a coronavirusului, a anunțat Ministerul Sănătății joi , France 24  (31 decembrie 2020). Arhivat 19 noiembrie 2021. Preluat la 9 ianuarie 2021.
  34. ↑ 남아공 '변이 코로나' 첫 국내 확인…영국발 변이도 4건 추가  (coreeană) , Donga Ilbo (2021 ianuarie). Arhivat 19 noiembrie 2021. Preluat la 13 iunie 2021.
  35. ↑ Ellyatt, Holly . Varianta de Covid găsită în Africa de Sud îi îngrijorează pe experți: iată ce știm până acum , CNBC  (6 ianuarie 2021). Arhivat din original pe 7 ianuarie 2021. Preluat la 9 ianuarie 2021.
  36. ↑ Declarația Echipa Națională de Urgență de Sănătate Publică - vineri 8 ianuarie . Guvernul Irlandei . Departamentul de Sănătate (8 ianuarie 2021). Preluat la 8 ianuarie 2021. Arhivat din original pe 7 decembrie 2021.
  37. ↑ Alberta raportează primul caz de variantă de coronavirus din Canada găsit în Africa de Sud . CBC News (8 ianuarie 2021). Consultat la 9 ianuarie 2021. Arhivat din original pe 9 ianuarie 2021.

Link -uri