Ribonucleaza pancreatică

Ribonucleaza pancreatică

Structura RNazei A
Identificatori
Cod KF 3.1.27.5
numar CAS 9001-99-4
Baze de date de enzime
IntEnz Vedere IntEnz
BRENDA intrare BRENDA
ExPASy Vedere NiceZyme
MetaCyc cale metabolică
KEGG intrare KEGG
PRIAM profil
Structuri PDB RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Ontologie genetică AmiGO  • EGO
Căutare
PMC articole
PubMed articole
NCBI proteine ​​NCBI
CAS 9001-99-4
Ribonucleaza pancreatică
Identificatori
Simbol RNaseA
Pfam PF00074
INTELIGENT SM00092
PROZITA PDOC00118
Structuri proteice disponibile
Pfam structurilor
PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsum Model 3D

Ribonucleaze pancreatice ( codul CE 3.1.27.5 , RNază, RNază I, RNază A, RNază pancreatică, ribonuclează I, endoribonuclează I, fosfatază ribonucleică, ribonuclează alcalină, ribonuclează, glicoproteine ​​ale genei S, ribonucleaze alcalinate SL-asociate de gena S, ribonuclează alcalinată SL-asociată glicoproteinele, ribonucleate 3'-pirimidino-oligonucleotide hidrolaze ) sunt endonucleaze specifice pirimidinice care se găsesc în număr mare în pancreasul unor mamifere și al unor reptile [1] .

în particular, enzimele sunt implicate în scindarea endonucleolitică a 3'-fosfomononucleotidelor şi 3'-fosfoligonucleotidelor care se termină în CP sau UP cu intermediari fosfat 2',3'-ciclici. Ribonucleaza poate derula helixul ARN, formând un complex cu ARN monocatenar; complexul apare ca urmare a unei interacțiuni extinse cation-anion cu mai multe locații între resturile de lizină și arginină ale enzimei și grupările fosfat ale nucleotidelor.

Membri noti ai familiei

Ribonucleaza pancreatică bovină este cel mai studiat membru al familiei și servește ca un sistem model în lucrările legate de plierea proteinelor , formarea legăturilor disulfurice , cristalografia și spectroscopia proteinelor și dinamica proteinelor [2] . Genomul uman conține 8 gene care împărtășesc structură și funcție cu ribonucleaza pancreatică bovină, cu 5 pseudogene suplimentare. Structura și dinamica acestor enzime sunt legate de diversitatea funcțiilor lor biologice [3] .

Alte proteine ​​aparținând superfamiliei ribonucleazelor pancreatice includ: ribonucleaze ale veziculelor seminale bovine și cerebrale; ribonucleaze nesecretoare ale rinichilor [4] ; ribonuclează de tip hepatic [5] ; angiogenina , care provoacă vascularizarea țesuturilor normale și maligne; proteină cationică eozinofilă [6] , citotoxină și helmintotoxină cu activitate ribonuclează; și ribonuclează de ficat de broaște și lectină care leagă acidul sialic. Secvența ribonucleazelor pancreatice conține patru legături disulfurice conservate și trei resturi de aminoacizi implicate în activitatea catalitică [7] .

Genele umane

Genele umane care codifică proteinele care conțin acest domeniu includ:

Citotoxicitate

Unii membri ai familiei ribonucleazelor pancreatice au efecte citotoxice . Celulele de mamifere sunt protejate de aceste efecte datorită afinității lor extrem de ridicate pentru inhibitorul ribonucleazei (RI), care protejează ARN-ul celular de distrugerea de către ribonucleazele pancreatice [8] . RNazele pancreatice care nu sunt inhibate de RI sunt la fel de toxice ca alfa-sarcina , toxina difterice sau ricina [9] .

Două ribonucleaze pancreatice izolate din ovocitele de broaște leopard nordic  , amfinază și ranpyrnaza  , nu sunt inhibate de RI și prezintă citotoxicitate diferențială împotriva celulelor tumorale [10] . Ranpirnase a fost studiat în studiile clinice de fază 3 ca candidat pentru tratamentul mezoteliomului , dar studiul nu a arătat semnificație statistică pentru obiectivele principale [11] .

Note

 

  1. „Compararea structurii ribonucleazei pancreatice de broasca testoasă cu cele ale ribonucleazelor de mamifere”. FEBS Lett . 194 (2): 338-343. 1986. DOI : 10.1016/0014-5793(86)80113-2 . PMID  3940901 .
  2. „Înapoi în viitor: ribonucleaza A”. biopolimeri . 90 (3): 259-77. 2008. doi : 10.1002/ bip.20845 . PMID 17868092 . 
  3. ^ „Conservarea dinamicii asociate cu funcția biologică într-o superfamilie de enzime”. structura . 26 (3): 426-436. Mar 2018. DOI : 10.1016/j.str.2018.01.015 . PMID29478822  . _
  4. ^ „Clonarea moleculară a neurotoxinei umane derivate din eozinofile: un membru al familiei genelor ribonucleazei”. Proc. Natl. Acad. sci. SUA . 86 (12): 4460-4464. 1989. doi : 10.1073/pnas.86.12.4460 . PMID2734298  . _
  5. „Structura primară a unei ribonucleaze din ficat de porc, un nou membru al superfamiliei ribonucleazei”. biochimie . 28 (25): 9806-9813. 1989. doi : 10.1021/ bi00451a040 . PMID 2611266 . 
  6. „Proteina cationică a eozinofilelor umane. Clonarea moleculară a unei citotoxine și a helmintotoxinei cu activitate ribonuclează”. J. Exp. Med . 170 (1): 163-176. 1989. doi : 10.1084/ jem.170.1.163 . PMID2473157 . _ 
  7. ^ „ Ribonucleaza A”. Chim. Rev. _ 98 (3): 1045-1066. 1998. doi : 10.1021/ cr960427h . PMID 11848924 . 
  8. Gaur, D (6 iulie 2001). „Interacțiunea ribonucleazei pancreatice umane cu inhibitorul ribonucleazei umane. Generarea de variante citotoxice rezistente la inhibitor” . Jurnalul de chimie biologică . 276 (27): 24978-84. doi : 10.1074/ jbc.m102440200 . PMID 11342552 . 
  9. Saxena, SK (5 noiembrie 1991). „Compararea RNazelor și toxinelor la injectarea în ovocitele Xenopus” . Jurnalul de chimie biologică . 266 (31): 21208-14. PMID  1939163 .
  10. ^ „ Ribonucleazele ca chimioterapice noi: exemplul ranpirnazei”. Biomedicamente . 22 (1): 53-58. 2008. DOI : 10.2165/00063030-200822010-00006 . PMID  18215091 .
  11. Raport anual Alfacell 2009 . Preluat la 2 februarie 2015. Arhivat din original la 8 aprilie 2019.