Histon deacetilaza 2

Versiunea actuală a paginii nu a fost încă examinată de colaboratori experimentați și poate diferi semnificativ de versiunea revizuită la 3 iunie 2015; verificările necesită 6 modificări .
Histon deacetilaza 2
Structuri disponibile
PDB Căutare ortolog: PDBe , RCSB
Identificatori
SimbolHDAC2  ; HD2; RPD3; YAF1
ID-uri externeOMIM:  605164 MGI :  1097691 HomoloGene :  68187 ChEMBL : 1937 GeneCards : HDAC2 Gene
numărul CE3.5.1.98
Profilul expresiei ARN
Mai multe informatii
ortologii
VedereUmanMouse
Entrez306615182
AnsambluENSG00000196591ENMUSG00000019777
UniProtQ92769P70288
RefSeq (ARNm)NM_001527NM_008229
RefSeq (proteină)NP_001518NP_032255
Locus (UCSC)Chr 6:
114,25 – 114,33 Mb
Chr 10:
36,97 - 37 Mb
Căutați în PubMed[unu][2]

Histone deacetilaza 2  este o enzimă din familia histon deacetilazei codificată la om de gena HDAC2 . [unu]

Funcția

Produsul genei HDAC2 aparține familiei histon deacetilazelor . Histone deacetilazele funcționează ca parte a complexelor multiproteice mari și sunt responsabile pentru deacetilarea reziduurilor de lizină în regiunea N-terminală a histonelor de bază (H2A, H2B, H3 și H4). Această proteină formează, de asemenea, complexe represoare transcripționale prin legarea la diferite proteine, inclusiv YY1, unul dintre factorii de transcripție de la mamifere . Histone deacetilaza 2 joacă un rol important în reglarea transcripției , a ciclului celular și a dezvoltării. [2]

Interacțiuni

Histone deacetilaza 2 interacționează cu:

Note

  1. Betz R., Gray SG, Ekström C., Larsson C., Ekström TJ Human histon deacetylase 2, HDAC2 (Human RPD3), este localizată la 6q21 prin cartografiere hibridă cu radiații  // Genomics  :  journal. - Academic Press , 1998. - Decembrie ( vol. 52 , nr. 2 ). - P. 245-246 . doi : 10.1006/ geno.1998.5435 . — PMID 9782097 .
  2. Gena Entrez: HDAC2 histon deacetilaza 2 .
  3. 1 2 Schmidt DR, Schreiber SL Asocierea moleculară între ATR și două componente ale complexului de remodelare și deacetilare a nucleozomilor, HDAC2 și CHD4  //  Biochemistry : journal. — Vol. 38 , nr. 44 . - P. 14711-14717 . - doi : 10.1021/bi991614n . — PMID 10545197 .
  4. 1 2 3 4 Yoon YM, Baek KH, Jeong SJ, Shin HJ, Ha GH, Jeon AH, Hwang SG, Chun JS, Lee CW WD, proteinele din punctul de control mitotic care conțin repetare acționează ca represori transcripționali în timpul   interfazei // FEBS Lett. : jurnal. — Vol. 575 , nr. 1-3 . - P. 23-9 . - doi : 10.1016/j.febslet.2004.07.089 . — PMID 15388328 .
  5. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. O genă candidată a retardului mental legat de X este o componentă a unei noi familii de complexe care conțin histon deacetilază   // J. Biol. Chim.  : jurnal. — Vol. 278 , nr. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
  6. 1 2 3 4 5 Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL Deacetilarea cromatinei printr-un complex de remodelare a nucleozomilor dependent de ATP  //  Nature : journal. — Vol. 395 , nr. 6705 . - P. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
  7. 1 2 Hakimi MA, Bochar DA, Schmiesing JA, Dong Y., Barak OG, Speicher DW, Yokomori K., Shiekhattar R. A chromatin remodeling complex that loads cohesin on human chromosomes  //  Nature : journal. — Vol. 418 , nr. 6901 . - P. 994-998 . - doi : 10.1038/nature01024 . — PMID 12198550 .
  8. Rountree MR, Bachman KE, Baylin SB DNMT1 leagă HDAC2 și un nou co-represor, DMAP1, pentru a forma un complex la focarele de replicare   // Nat . Genet.  : jurnal. — Vol. 25 , nr. 3 . - P. 269-277 . - doi : 10.1038/77023 . — PMID 10888872 .
  9. 1 2 3 van der Vlag J., Otte AP Reprimarea transcripțională mediată de proteina umană de grup polycomb EED implică deacetilarea histonelor   // Nat . Genet.  : jurnal. — Vol. 23 , nr. 4 . - P. 474-478 . - doi : 10.1038/70602 . — PMID 10581039 .
  10. Yang WM, Yao YL, Seto E. Proteina 25 care leagă FK506 se asociază funcțional cu histon deacetilaze și cu factorul de transcripție YY1  // EMBO  J. : jurnal. — Vol. 20 , nr. 17 . - P. 4814-4825 . - doi : 10.1093/emboj/20.17.4814 . — PMID 11532945 .
  11. Controlul în trei căi al proliferării celulelor cardiace fetale ar putea ajuta la regenerarea celulelor cardiace  (7 octombrie 2010). Arhivat din original pe 3 ianuarie 2012. Preluat la 9 aprilie 2015.
  12. Wen YD, Cress WD, Roy AL, Seto E. Histone deacetilaza 3 se leagă și reglează factorul de transcripție multifuncțional TFII-I  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. — Vol. 278 , nr. 3 . - P. 1841-1847 . - doi : 10.1074/jbc.M206528200 . — PMID 12393887 .
  13. 1 2 Fischer DD, Cai R., Bhatia U., Asselbergs FA, Song C., Terry R., Trogani N., Widmer R., Atadja P., Cohen D. Isolation and characterization of a roman class II histon deacetylase , HDAC10  (engleză)  // J. Biol. Chim.  : jurnal. — Vol. 277 , nr. 8 . - P. 6656-6666 . - doi : 10.1074/jbc.M108055200 . — PMID 11739383 .
  14. 1 2 3 Yao YL, Yang WM Proteinele asociate metastazelor 1 și 2 formează complexe proteice distincte cu activitate histon deacetilază  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. — Vol. 278 , nr. 43 . - P. 42560-42568 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
  15. 1 2 3 4 Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. A core-BRAF35 complex containing histone deacetylase mediates repression of neuronal-specific genes  (engleză)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : jurnal. — Vol. 99 , nr. 11 . - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
  16. 1 2 Johnson CA, White DA, Lavender JS, O'Neill LP, Turner BM Complecșii de histonă deacetilaze de clasa I umană prezintă o activitate catalitică îmbunătățită în prezența ATP și co-imunoprecipitat cu proteina chaperonă dependentă de ATP  Hsp70  // J. Biol. Chim.  : jurnal. — Vol. 277 , nr. 11 . - P. 9590-9597 . - doi : 10.1074/jbc.M107942200 . — PMID 11777905 .
  17. Fischle W., Dequiedt F., Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W., Verdin E. Activitatea enzimatică asociată cu HDAC de clasa II este dependentă de un complex multiproteic care conține HDAC3 și SMRT/N-  CoR  // Mol. celulă : jurnal. — Vol. 9 , nr. 1 . - P. 45-57 . - doi : 10.1016/s1097-2765(01)00429-4 . — PMID 11804585 .
  18. ^ Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E. Human HDAC7 histon deacetylaze activity is associated with HDAC3 in vivo  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. — Vol. 276 , nr. 38 . - P. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
  19. Ashburner BP, Westerheide SD, Baldwin AS Subunitatea p65 (RelA) a NF-kappaB interacționează cu corepresorii histone deacetilazei (HDAC) HDAC1 și HDAC2 pentru a regla negativ expresia genelor   // Mol . celulă. Biol. : jurnal. — Vol. 21 , nr. 20 . - P. 7065-7077 . - doi : 10.1128/MCB.21.20.7065-7077.2001 . — PMID 11564889 .
  20. 1 2 3 4 Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analiza subunităților NuRD relevă un complex de miez de histon deacetilază și o legătură cu metilarea ADN-ului   // Genes Dev .  : jurnal. — Vol. 13 , nr. 15 . - P. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
  21. Hassig CA, Tong JK, Fleischer TC, Owa T., Grable PG, Ayer DE, Schreiber SL Un rol pentru activitatea histon-deacetilazei în reprimarea transcripțională mediată de HDAC1  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : jurnal. — Vol. 95 , nr. 7 . - P. 3519-3524 . - doi : 10.1073/pnas.95.7.3519 . — PMID 9520398 .
  22. Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histone deacetylases și SAP18, o nouă polipeptidă, sunt componente ale unui complex uman Sin3  (engleză)  // Cell  : journal. — Apăsare celulară . — Vol. 89 , nr. 3 . - P. 357-364 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)80216-0 . — PMID 9150135 .
  23. ^ Wysocka J., Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W. Human Sin3 deacetilaza și histona H3-K4 metiltransferaza Set1/Ash2 legate de tritorax sunt legate împreună selectiv de factorul de proliferare celulară HCF-   1 / Genes Dev.  : jurnal. — Vol. 17 , nr. 7 . - P. 896-911 . - doi : 10.1101/gad.252103 . — PMID 12670868 .
  24. Mazumdar A., ​​​​Wang RA, Mishra SK, Adam L., Bagheri-Yarmand R., Mandal M., Vadlamudi RK, Kumar R. Reprimarea transcripțională a receptorului de estrogen prin   corepresorul 1 al proteinei asociate metastazelor // Nat. Biol celular.  : jurnal. — Vol. 3 , nr. 1 . - P. 30-7 . - doi : 10.1038/35050532 . — PMID 11146623 .
  25. 1 2 Laherty CD, Yang WM, Sun JM, Davie JR, Seto E., Eisenman RN Histone deacetilaze asociate cu corepresorul mSin3 mediază reprimarea transcripțională nebună  (engleză)  // Cell  : journal. — Apăsare celulară . — Vol. 89 , nr. 3 . - P. 349-356 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)80215-9 . — PMID 9150134 .
  26. Spronk CA, Tessari M., Kaan AM, Jansen JF, Vermeulen M., Stunnenberg HG, Vuister GW Interacțiunea Mad1-Sin3B implică un nou pliu elicoidal   // Nat . Struct. Biol.  : jurnal. — Vol. 7 , nr. 12 . - P. 1100-1104 . - doi : 10.1038/81944 . — PMID 11101889 .
  27. Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Două proteine ​​p66 înrudite cuprind o nouă familie de represori transcripționali puternici care interacționează cu MBD2 și MBD3  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. — Vol. 277 , nr. 43 . - P. 40958-40966 . - doi : 10.1074/jbc.M207467200 . — PMID 12183469 .
  28. Ng HH, Zhang Y., Hendrich B., Johnson CA, Turner BM, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 este un represor transcripțional aparținând complexului histon deacetilază MeCP1  .)  / / Nat. Genet.  : jurnal. — Vol. 23 , nr. 1 . - P. 58-61 . - doi : 10.1038/12659 . — PMID 10471499 .
  29. Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Characterization of BHC80 in BRAF-HDAC complex, implicat in neuron-specific gene   repression // Biochem. Biophys. Res. comun. : jurnal. — Vol. 322 , nr. 2 . - P. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
  30. Jin Q., van Eynde A., Beullens M., Roy N., Thiel G., Stalmans W., Bollen M. Regulatorul proteinei fosfatazei-1 (PP1), inhibitorul nuclear al PP1 (NIPP1), interacționează cu proteina grupului polycomb, dezvoltarea ectodermului embrionar (EED) și funcționează ca represor transcripțional  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. — Vol. 278 , nr. 33 . - P. 30677-30685 . - doi : 10.1074/jbc.M302273200 . — PMID 12788942 .
  31. 1 2 Zhang Y., Dufau ML Mecanisme duale de reglare a transcripției genei receptorului hormonului luteinizant de către receptorii orfani nucleari și complexele de histone deacetilază  (engleză)  // J. Steroid Biochem. Mol. Biol. : jurnal. — Vol. 85 , nr. 2-5 . - P. 401-414 . - doi : 10.1016/s0960-0760(03)00230-9 . — PMID 12943729 .
  32. 1 2 3 Zhang Y., Dufau ML Silence of transcription of the human luteinizing hormone receptor gene by histon deacetylase-mSin3A complex  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. — Vol. 277 , nr. 36 . - P. 33431-33438 . - doi : 10.1074/jbc.M204417200 . — PMID 12091390 .
  33. You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL CoREST este o componentă integrală a complexului CoREST-histone deacetilază umană  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . — Vol. 98 , nr. 4 . - P. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
  34. Kiernan R., Brès V., Ng RW, Coudart MP, El Messaoudi S., Sardet C., Jin DY, Emiliani S., Benkirane M. Post-activation turn-off of NF-kappa B-dependent transcription is regulated prin acetilarea p65  (engleză)  // J. Biol. Chim.  : jurnal. — Vol. 278 , nr. 4 . - P. 2758-2766 . - doi : 10.1074/jbc.M209572200 . — PMID 12419806 .
  35. Yu Z., Zhang W., Kone BC Histone deacetilazele măresc inducerea citokinelor a genei iNOS  //  J. Am. soc. Nefrol. : jurnal. — Vol. 13 , nr. 8 . - P. 2009-2017 . - doi : 10.1097/01.asn.0000024253.59665.f1 . — PMID 12138131 .
  36. Lai A., Lee JM, Yang WM, DeCaprio JA, Kaelin WG, Seto E., Branton PE RBP1 recrutează atât activități de represiune dependente de histon deacetilază, cât și independente pentru proteinele familiei retinoblastom   // Mol . celulă. Biol. : jurnal. — Vol. 19 , nr. 10 . - P. 6632-6641 . — PMID 10490602 .
  37. ^ Zhang Y., Sun ZW, Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, o proteină nouă conservată între om și drojdie, este o componentă a unui complex de histon deacetilază   // Mol. celulă : jurnal. — Vol. 1 , nr. 7 . - P. 1021-1031 . - doi : 10.1016/s1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
  38. Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Role of the Sin3-histone deacetylase complex in growth regulation by the candidat tumor suppressor p33(ING1  )  // Mol. celulă. Biol. : jurnal. — Vol. 22 , nr. 3 . - P. 835-848 . - doi : 10.1128/mcb.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
  39. Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE Identificarea și caracterizarea a trei componente noi ale complexului corepresor mSin3A   // Mol . celulă. Biol. : jurnal. — Vol. 23 , nr. 10 . - P. 3456-3467 . - doi : 10.1128/mcb.23.10.3456-3467.2003 . — PMID 12724404 .
  40. Yang L., Mei Q., ​​​​Zielinska-Kwiatkowska A., Matsui Y., Blackburn ML, Benedetti D., Krumm AA, Taborsky GJ, Chansky HA . histone deacetilaze 1/2 și co-represori de transcripție mSin3A/B  (engleză)  // Biochem. J. : jurnal. — Vol. 369 , nr. Pt 3 . - P. 651-657 . - doi : 10.1042/BJ20020854 . — PMID 12398767 .
  41. ^ Zhou S., Fujimuro M., Hsieh JJ, Chen L., Hayward SD Un rol pentru SKIP în activarea EBNA2 a promotorilor reprimați de CBF1  //  J. Virol. : jurnal. — Vol. 74 , nr. 4 . - P. 1939-1947 . doi : 10.1128 / jvi.74.4.1939-1947.2000 . — PMID 10644367 .
  42. Vaute O., Nicolas E., Vandel L., Trouche D. Interacțiunea funcțională și fizică între histone metil transferaza Suv39H1 și histone deacetilaze  // Nucleic Acids Res  . : jurnal. — Vol. 30 , nr. 2 . - P. 475-481 . doi : 10.1093 / nar/30.2.475 . — PMID 11788710 .
  43. 1 2 Won J., Yim J., Kim TK Sp1 și Sp3 recrutează histon deacetilaza pentru a reprima transcripția promotorului de transcriptază inversă a telomerazei umane (hTERT) în celulele somatice umane normale  (engleză)  // J. Biol. Chim.  : jurnal. — Vol. 277 , nr. 41 . - P. 38230-38238 . - doi : 10.1074/jbc.M206064200 . — PMID 12151407 .
  44. 1 2 Sun JM, Chen HY, Moniwa M., Litchfield DW, Seto E., Davie JR Represorul transcripțional Sp3 este asociat cu histone deacetilază CK2-fosforilată 2  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. — Vol. 277 , nr. 39 . - P. 35783-35786 . - doi : 10.1074/jbc.C200378200 . — PMID 12176973 .
  45. Tsai SC, Valkov N., Yang WM, Gump J., Sullivan D., Seto E. Histone deacetilaza interacționează direct cu ADN-topoizomeraza II   // Nat . Genet.  : jurnal. — Vol. 26 , nr. 3 . - P. 349-353 . - doi : 10.1038/81671 . — PMID 11062478 .
  46. Yang WM, Yao YL, Sun JM, Davie JR, Seto E. Izolarea și caracterizarea cADN-urilor care corespund unui membru suplimentar al familiei de gene a histonei deacetilaze umane  //  J. Biol. Chim.  : jurnal. — Vol. 272 , nr. 44 . - Str. 28001-28007 . doi : 10.1074 / jbc.272.44.28001 . — PMID 9346952 .
  47. Yao YL, Yang WM, Seto E. Reglarea factorului de transcripție YY1 prin acetilare și deacetilare   // Mol . celulă. Biol. : jurnal. — Vol. 21 , nr. 17 . - P. 5979-5991 . - doi : 10.1128/mcb.21.17.5979-5991.2001 . — PMID 11486036 .
  48. Kalenik JL, Chen D., Bradley ME, Chen SJ, Lee TC Drojdie clonarea cu doi hibride a unei noi proteine ​​deget de zinc care interacționează cu factorul de transcripție multifuncțional YY1  // Nucleic Acids Res  . : jurnal. — Vol. 25 , nr. 4 . - P. 843-849 . doi : 10.1093 / nar/25.4.843 . — PMID 9016636 .

Literatură