Syndekan 1

Syndekan 1
Structuri disponibile
PDB Căutare ortolog: PDBe , RCSB
Identificatori
SimbolSDC1  ; CD138; SDC; SYND1; Syndecan
ID-uri externeOMIM:  186355 MGI :  1349162 HomoloGene :  2252 GeneCards : SDC1 Gene
Profilul expresiei ARN
Mai multe informatii
ortologii
VedereUmanMouse
Entrez638220969
AnsambluENSG00000115884ENMUSG00000020592
UniProtP18827P18828
RefSeq (ARNm)NM_001006946NM_011519
RefSeq (proteină)NP_001006947NP_035649
Locus (UCSC)Chr 2:
20,4 – 20,43 Mb
Chr 12:
8,77 – 8,79 Mb
Căutați în PubMed[unu][2]

Sindecanul 1 ( în engleză  syndecan 1; CD138 ) este o proteină membranară , un proteoglican din familia sindecanilor sau proteoglicani transmembranari heparan sulfat. Au fost descrise în total 4 proteine ​​din această familie. Produs genetic uman SDC1 .

Funcții

Proteina este un proteoglican heparan sulfat transmembranar, un membru al familiei sindecanilor. Sindecanii mediază legarea celulelor, semnalizarea celulară și organizarea citoscheletului . Sunt receptori pentru proteina Tat a virusului HIV . Syndecanul 1 este implicat în proliferarea celulară, migrarea celulelor și interacțiunea celulară cu proteinele matricei extracelulare. [unu]

Structura

Syndecanul 1 poartă lanțuri de sulfat de heparan și sulfat de condroitină , care asigură comunicarea între citoschelet și matricea extracelulară. Se leagă de CDCP1 .

Scindarea ectodomeniului duce la formarea unei forme solubile a proteinei. Clivajul poate apărea sub acțiunea heparanazei, trombinei și factorului de creștere epidermică, precum și în timpul stresului și în timpul vindecării rănilor.

Proteina constă din 288 de aminoacizi, greutatea moleculară a părții proteice este de 32,5 kDa. Include un domeniu extracelular N-terminal (232 de aminoacizi), un singur fragment transmembranar elicoidal și o regiune citosolică mică. Există 6 situsuri de glicozilare pe domeniul extracelular : 3 situsuri de atașare a lanțului de condroitină sulfat, 2 situsuri de atașare a lanțului de sulfat de O -heparan și 1 situs de N - glicozilare . Fragmentul citosol conține o tirozină fosforilată .

Aplicație

Syndecan 1 este folosit ca marker pentru celulele plasmatice [2] dacă se știe că celulele provin din celule sanguine. [3]

Vezi și

Note

  1. Entrez Gene: SDC1 syndecan 1 .
  2. ↑ Rawstron AC Imunofenotiparea celulelor plasmatice  (neopr.)  // Curr Protoc Cytom. - 2006. - Mai ( vol. Capitolul 6 ). — C. Unitatea6.23 . - ISBN 0-471-14295-6 . - doi : 10.1002/0471142956.cy0623s36 . — PMID 18770841 .
  3. O'Connell FP, Pinkus JL, Pinkus GS CD138 (syndecan-1), un profil imunohistochimic de marker al celulelor plasmatice în neoplasmele hematopoietice și nonhematopoietice   // Am . J.Clin. Pathol.  : jurnal. - 2004. - Februarie ( vol. 121 , nr. 2 ). - P. 254-263 . - doi : 10.1309/617D-WB5G-NFWX-HW4L . — PMID 14983940 . Arhivat din original pe 9 iunie 2011.  (link indisponibil)

Literatură

Link -uri